SAXSdb — 9nlz

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Vesicular-fusion protein SEC18

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–758 链 B； UniProt 1–758 链 C； UniProt 1–758 链 D； UniProt 1–758 链 E； UniProt 1–758 链 F； UniProt 1–758	未记录	Alpha-soluble NSF attachment protein × 3 （P32602） Synaptobrevin homolog 1 × 1 （P31109） Protein SSO1 × 1 （P32867） Protein transport protein SEC9 × 1 （P40357） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9NLZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CR5 N-TERMINAL DOMAIN OF SEC18P 提交 1999-08-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–210（189 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG 8000, sodium phosphate, dimethyl sulfoxide, ATP, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
1CR5 N-TERMINAL DOMAIN OF SEC18P 提交 1999-08-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 22–210（189 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG 8000, sodium phosphate, dimethyl sulfoxide, ATP, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
1CR5 N-TERMINAL DOMAIN OF SEC18P 提交 1999-08-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 22–210（189 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG 8000, sodium phosphate, dimethyl sulfoxide, ATP, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
9CRU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 1 提交 2024-07-22	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.89 Å
9CRX Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 3 提交 2024-07-22	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.73 Å
9N22 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 2 提交 2025-01-27	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.91 Å
9NG2 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 4 提交 2025-02-21	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.61 Å
9NLU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 5 提交 2025-03-03	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.29 Å
9NLW Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 6 提交 2025-03-03	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.73 Å
9NLY Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 7 提交 2025-03-03	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.75 Å
9NM1 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - All Merge (Class 9, focused on D1/D2) 提交 2025-03-03	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9NUD Y20S after Mg2+ (Sec18) - Class 2 提交 2025-03-19	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
9NUE Y20S after Mg2+ (Sec18) - Class 3 提交 2025-03-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）链 G 1–758（758 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.36 Å
9NUZ Y20S after Mg2+ (Sec18) - Class 4 提交 2025-03-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）链 G 1–758（758 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å
9NV0 Sec18 Mg2+ class 2 提交 2025-03-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.83 Å
9NV1 Sec18 Mg2+ class 1 提交 2025-03-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–758（758 aa）链 B 1–758（758 aa）链 C 1–758（758 aa）链 D 1–758（758 aa）链 E 1–758（758 aa）链 F 1–758（758 aa）链 G 1–758（758 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.99 Å

共 14 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SEC18_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–761； UniProt 1–758 作者链 B； PDB构建体 4–761； UniProt 1–758 作者链 C； PDB构建体 4–761； UniProt 1–758 作者链 D； PDB构建体 4–761； UniProt 1–758 作者链 E； PDB构建体 4–761； UniProt 1–758 作者链 F； PDB构建体 4–761； UniProt 1–758

Alpha-soluble NSF attachment protein

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32602

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 1–292 链 H； UniProt 1–292 链 I； UniProt 1–292	未记录	Vesicular-fusion protein SEC18 × 6 （P18759） Synaptobrevin homolog 1 × 1 （P31109） Protein SSO1 × 1 （P32867） Protein transport protein SEC9 × 1 （P40357） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9NLZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1QQE CRYSTAL STRUCTURE OF THE VESICULAR TRANSPORT PROTEIN SEC17 提交 1999-06-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–292（292 aa）	突变：M1I	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 5.9；277 K；POLYETHYLENEIMINE, SODIUM CITRATE, SODIUM CHLORIDE, GLYCEROL, DTT, pH 5.9, MICROBATCH, temperature 277K	分辨率 2.90 Å R-free 0.283
9CRU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 1 提交 2024-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 G 1–292（292 aa）链 H 1–292（292 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.89 Å
9CRX Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 3 提交 2024-07-22	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–292（292 aa）链 H 1–292（292 aa）链 I 1–292（292 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.73 Å
9N22 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 2 提交 2025-01-27	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–292（292 aa）链 H 1–292（292 aa）链 I 1–292（292 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.91 Å
9NG2 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 4 提交 2025-02-21	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–292（292 aa）链 H 1–292（292 aa）链 I 1–292（292 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.61 Å
9NLU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 5 提交 2025-03-03	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–292（292 aa）链 H 1–292（292 aa）链 I 1–292（292 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.29 Å
9NLW Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 6 提交 2025-03-03	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–292（292 aa）链 H 1–292（292 aa）链 I 1–292（292 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.73 Å
9NLY Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 7 提交 2025-03-03	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–292（292 aa）链 H 1–292（292 aa）链 I 1–292（292 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.75 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SEC17_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 2–293； UniProt 1–292 作者链 H； PDB构建体 2–293； UniProt 1–292 作者链 I； PDB构建体 2–293； UniProt 1–292

Synaptobrevin homolog 1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P31109

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 1–93	未记录	Vesicular-fusion protein SEC18 × 6 （P18759） Alpha-soluble NSF attachment protein × 3 （P32602） Protein SSO1 × 1 （P32867） Protein transport protein SEC9 × 1 （P40357） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9NLZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3B5N Structure of the yeast plasma membrane SNARE complex 提交 2007-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 27–86（60 aa）片段：Residues 27-86	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.25；298 K；100 mM MES pH 6.25, 30 % MPD, 200 mM Sodium bromide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.248
3B5N Structure of the yeast plasma membrane SNARE complex 提交 2007-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 27–86（60 aa）片段：Residues 27-86	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.25；298 K；100 mM MES pH 6.25, 30 % MPD, 200 mM Sodium bromide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.248
3B5N Structure of the yeast plasma membrane SNARE complex 提交 2007-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 27–86（60 aa）片段：Residues 27-86	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.25；298 K；100 mM MES pH 6.25, 30 % MPD, 200 mM Sodium bromide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.248
9CRU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 1 提交 2024-07-22	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 J 1–93（93 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.89 Å
9CRX Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 3 提交 2024-07-22	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 J 1–93（93 aa）片段：cytoplasmic domain	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.73 Å
9N22 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 2 提交 2025-01-27	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 J 1–93（93 aa）片段：cytoplasmic domain	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.91 Å
9NG2 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 4 提交 2025-02-21	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 J 1–93（93 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.61 Å
9NLU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 5 提交 2025-03-03	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 J 1–93（93 aa）片段：cytoplasmic domain	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.29 Å
9NLW Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 6 提交 2025-03-03	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 J 1–93（93 aa）片段：cytoplasmic domain	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.73 Å
9NLY Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 7 提交 2025-03-03	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 J 1–93（93 aa）片段：cytoplasmic domain	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.75 Å

共 8 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SNC1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 5–97； UniProt 1–93

Protein SSO1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32867

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 1–265	未记录	Vesicular-fusion protein SEC18 × 6 （P18759） Alpha-soluble NSF attachment protein × 3 （P32602） Synaptobrevin homolog 1 × 1 （P31109） Protein transport protein SEC9 × 1 （P40357） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9NLZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1FIO CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST T-SNARE PROTEIN SSO1 提交 2000-08-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–225（195 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Hepes, PEG 4000, isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.265
3B5N Structure of the yeast plasma membrane SNARE complex 提交 2007-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 189–257（69 aa）片段：Residues 189-257	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.25；298 K；100 mM MES pH 6.25, 30 % MPD, 200 mM Sodium bromide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.248
3B5N Structure of the yeast plasma membrane SNARE complex 提交 2007-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 189–257（69 aa）片段：Residues 189-257	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.25；298 K；100 mM MES pH 6.25, 30 % MPD, 200 mM Sodium bromide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.248
3B5N Structure of the yeast plasma membrane SNARE complex 提交 2007-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 189–257（69 aa）片段：Residues 189-257	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.25；298 K；100 mM MES pH 6.25, 30 % MPD, 200 mM Sodium bromide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.248
9CRU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 1 提交 2024-07-22	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 K 1–265（265 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.89 Å
9CRX Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 3 提交 2024-07-22	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–265（265 aa）片段：cytoplasmic domain	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.73 Å
9N22 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 2 提交 2025-01-27	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–265（265 aa）片段：cytoplasmic domain	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.91 Å
9NG2 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 4 提交 2025-02-21	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–265（265 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.61 Å
9NLU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 5 提交 2025-03-03	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–265（265 aa）片段：residues 1-265	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.29 Å
9NLW Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 6 提交 2025-03-03	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–265（265 aa）片段：residues 1-265	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.73 Å
9NLY Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 7 提交 2025-03-03	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–265（265 aa）片段：residues 1-265	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.75 Å
9NM1 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - All Merge (Class 9, focused on D1/D2) 提交 2025-03-03	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 K 1–265（265 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 10 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SSO1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 5–269； UniProt 1–265

Protein transport protein SEC9

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P40357

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 433–650	未记录	Vesicular-fusion protein SEC18 × 6 （P18759） Alpha-soluble NSF attachment protein × 3 （P32602） Synaptobrevin homolog 1 × 1 （P31109） Protein SSO1 × 1 （P32867） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9NLZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3B5N Structure of the yeast plasma membrane SNARE complex 提交 2007-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 433–499（67 aa）片段：Residues 433-499 链 D 589–650（62 aa）片段：Residues 589-650	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.25；298 K；100 mM MES pH 6.25, 30 % MPD, 200 mM Sodium bromide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.248
3B5N Structure of the yeast plasma membrane SNARE complex 提交 2007-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 433–499（67 aa）片段：Residues 433-499 链 H 589–650（62 aa）片段：Residues 589-650	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.25；298 K；100 mM MES pH 6.25, 30 % MPD, 200 mM Sodium bromide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.248
3B5N Structure of the yeast plasma membrane SNARE complex 提交 2007-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 433–499（67 aa）片段：Residues 433-499 链 L 589–650（62 aa）片段：Residues 589-650	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.25；298 K；100 mM MES pH 6.25, 30 % MPD, 200 mM Sodium bromide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.248
9CRU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 1 提交 2024-07-22	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 L 433–650（218 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.89 Å
9CRX Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 3 提交 2024-07-22	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 L 433–650（218 aa）片段：t-SNARE coiled-coil homology domains	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.73 Å
9N22 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 2 提交 2025-01-27	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 L 433–650（218 aa）片段：t-SNARE coiled-coil homology domains	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.91 Å
9NG2 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 4 提交 2025-02-21	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 L 433–650（218 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.61 Å
9NLU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 5 提交 2025-03-03	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 L 433–650（218 aa）片段：t-SNARE coiled-coil homology domains	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.29 Å
9NLW Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 6 提交 2025-03-03	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 L 433–650（218 aa）片段：t-SNARE coiled-coil homology domains	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.73 Å
9NLY Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 7 提交 2025-03-03	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 L 433–650（218 aa）片段：t-SNARE coiled-coil homology domains	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.75 Å

共 8 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SEC9_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 5–222； UniProt 433–650

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9nlz
沉积日期 deposition_date	2025-03-03
最后修订 last_revision	2025-10-01
结构标题 title	Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 8
关键词 keywords	SNARE, NSF, Sec18, AAA+, TRANSLOCASE; TRANSLOCASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	65.87 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	65.38 Å
零角强度 I(0) i0	4934360000.00
分子量 molecular_weight	586990.0 kDa
排除体积 excluded_volume	732840 Å³
包络体积 envelope_volume	1222100 Å³
水化壳体积 shell_volume	154450 Å³
包络直径 envelope_diameter	228.9 Å
壳层 Rg shell_rg	69.93 Å
包络 Rg envelope_rg	62.46 Å
形状 Rg shape_rg	65.38 Å
总 Rg total_rg	65.48 Å
总原子数 total_atoms	82446
残基数 n_residues	5221
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	226.3 Å
Rg (实空间) rg_real	65.67 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.77 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.9340e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.1620e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	66.01 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	4937000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8565
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	75.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.276
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.294
角度范围 angular_range	— – 0.1200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0004
最高正则化参数 α highest_alpha	340600000.0000
实空间数据点数 n_real_points	25
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.802; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.975; Smooth: 0.750

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Vesicular-fusion protein SEC18
分子量 formula_weight	84423.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	82471

GAHMFKIPGFGKAAANHTPPDMTNMDTRTRHLKVSNCPNNSYALANVAAVSPNDFPNNIYIIIDNLFVFTTRHSNDIPPGTIGFNGNQRTWGGWSLNQDVQAKAFDLFKYSGKQSYLGSIDIDISFRARGKAVSTVFDQDELAKQFVRCYESQIFSPTQYLIMEFQGHFFDLKIRNVQAIDLGDIEPTSAVATGIETKGILTKQTQINFFKGRDGLVNLKSSNSLRPRSNAVIRPDFKFEDLGVGGLDKEFTKIFRRAFASRIFPPSVIEKLGISHVKGLLLYGPPGTGKTLIARKIGTMLNAKEPKIVNGPEILSKYVGSSEENIRNLFKDAEAEYRAKGEESSLHIIIFDELDSVFKQRGSRGDGTGVGDNVVNQLLAKMDGVDQLNNILVIGMTNRKDLIDSALLRPGRFEVQVEIHLPDEKGRLQIFDIQTKKMRENNMMSDDVNLAELAALTKNFSGAEIEGLVKSASSFAINKTVNIGKGATKLNTKDIAKLKVTREDFLNALNDVTPAFGISEEDLKTCVEGGMMLYSERVNSILKNGARYVRQVRESDKSRLVSLLIHGPAGSGKTALAAEIALKSGFPFIRLISPNELSGMSESAKIAYIDNTFRDAYKSPLNILVIDSLETLVDWVPIGPRFSNNILQMLKVALKRKPPQDRRLLIMTTTSAYSVLQQMDILSCFDNEIAVPNMTNLDELNNVMIESNFLDDAGRVKVINELSRSCPNFNVGIKKTLTNIETARHDEDPVNELVELMTQSA

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Alpha-soluble NSF attachment protein
分子量 formula_weight	32899.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,I

GMSDPVELLKRAEKKGVPSSGFMKLFSGSDSYKFEEAADLCVQAATIYRLRKELNLAGDSFLKAADYQKKAGNEDEAGNTYVEAYKCFKSGGNSVNAVDSLENAIQIFTHRGQFRRGANFKFELGEILENDLHDYAKAIDCYELAGEWYAQDQSVALSNKCFIKCADLKALDGQYIEASDIYSKLIKSSMGNRLSQWSLKDYFLKKGLCQLAATDAVAAARTLQEGQSEDPNFADSRESNFLKSLIDAVNEGDSEQLSEHCKEFDNFMRLDKWKITILNKIKESIQQQEDDLL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Synaptobrevin homolog 1
分子量 formula_weight	10943.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

GASHMSSSTPFDPYALSEHDEERPQNVQSKSRTAELQAEIDDTVGIMRDNINKVAERGERLTSIEDKADNLAVSAQGFKRGANRVRKAMWYKDLKMK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Protein SSO1
分子量 formula_weight	30798.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

GASHMSYNNPYQLETPFEESYELDEGSSAIGAEGHDFVGFMNKISQINRDLDKYDHTINQVDSLHKRLLTEVNEEQASHLRHSLDNFVAQATDLQFKLKNEIKSAQRDGIHDTNKQAQAENSRQRFLKLIQDYRIVDSNYKEENKEQAKRQYMIIQPEATEDEVEAAISDVGGQQIFSQALLNANRRGEAKTALAEVQARHQELLKLEKSMAELTQLFNDMEELVIEQQENVDVIDKNVEDAQLDVEQGVGHTDKAVKSARKARKNKIR

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Protein transport protein SEC9
分子量 formula_weight	25777.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

GASHIKFTKQSSVASTRNTLKMAQDAERAGMNTLGMLGHQSEQLNNVEGNLDLMKVQNKVADEKVAELKKLNRSILAVHVSNPFNSKRRRREREEQLKNRKIEEKLMREQTSQQLSQSTQRIEGAMNANNNISEVRERYQRKNVLEKAKRYQFENDEEDDEMELEIDRNLDQIQQVSNRLKKMALTTGKELDSQQKRLNNIEESTDDLDINLHMNTNRLAGI

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.13 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	31497

fit	/app/data/saxs_computation/nl/9nlz/9nlz.fit
pddf	/app/data/pr_computation/nl/9nlz/9nlz.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/nl/9nlz/9nlz.dat

Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 8

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Vesicular-fusion protein SEC18

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Alpha-soluble NSF attachment protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Synaptobrevin homolog 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein SSO1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein transport protein SEC9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)