9oz9

Flavobacterium johnsoniae 70S initiation complex with Shine-Dalgarno-less mRNA.

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 295.9 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9oz9

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9oz9
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9oz9
沉积日期 deposition_date2025-06-05
结构标题 titleFlavobacterium johnsoniae 70S initiation complex with Shine-Dalgarno-less mRNA.
关键词 keywordsRibosome, initiation complex, Flavobacterium johnsoniae; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier85.14
回转半径 Rg (电子) rg_electron86.12
零角强度 I(0) i0135530000000.00
分子量 molecular_weight2047800.0 kDa
排除体积 excluded_volume2110200 ų
包络体积 envelope_volume3926400 ų
水化壳体积 shell_volume349960 ų
包络直径 envelope_diameter284.1
壳层 Rg shell_rg99.68
包络 Rg envelope_rg84.06
形状 Rg shape_rg86.20
总 Rg total_rg86.04
总原子数 total_atoms137848
残基数 n_residues10164
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax295.9
Rg (实空间) rg_real87.24
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.54
I(0) (实空间) i0_real1.3430e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.8770e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal86.55
I(0) (倒空间) i0_reciprocal136100000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9002
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary115.1
偏度 Skewness skewness0.351
峰度 Kurtosis kurtosis-0.018
角度范围 angular_range— – 0.0900 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.2030
最高正则化参数 α highest_alpha8133000000.0000
实空间数据点数 n_real_points19
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.798; Stabil: 0.915; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.911; Smooth: 0.662

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (56)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)