9sw6

Structure of the Mvh-Hdr-Fmd complex of Methanothermobacter marburgensis (composite structure)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B × 2 （Q50755） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C × 2 （Q50754） F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D × 2 （P60238） F420-non-reducing hydrogenase subunit G × 2 （P60239） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F × 4 （D9PU51） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A × 4 （D9PU54） formylmethanofuran dehydrogenase subunit B × 4 （D9PXE7） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G × 4 （D9PU52） Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C × 4 （P61937） Polyferredoxin protein MvhB × 2 （P60232） F420-non-reducing hydrogenase subunit A × 2 （P60227） IRON/SULFUR CLUSTER × 90 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 Non-cubane [4Fe-4S]-cluster × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZINC ION × 8 2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 8 MOLYBDENUM ATOM × 4 HYDROSULFURIC ACID × 4 FE3-S4 CLUSTER × 2 formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni) × 2 water × 32	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	HDRA_METTM
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–659； UniProt 1–659

H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B

物种未注明

UniProt Q50755

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A × 2 （Q50756） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C × 2 （Q50754） F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D × 2 （P60238） F420-non-reducing hydrogenase subunit G × 2 （P60239） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F × 4 （D9PU51） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A × 4 （D9PU54） formylmethanofuran dehydrogenase subunit B × 4 （D9PXE7） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G × 4 （D9PU52） Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C × 4 （P61937） Polyferredoxin protein MvhB × 2 （P60232） F420-non-reducing hydrogenase subunit A × 2 （P60227） IRON/SULFUR CLUSTER × 90 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 Non-cubane [4Fe-4S]-cluster × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZINC ION × 8 2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 8 MOLYBDENUM ATOM × 4 HYDROSULFURIC ACID × 4 FE3-S4 CLUSTER × 2 formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni) × 2 water × 32	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	HDRB_METTM
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302

H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C

物种未注明

UniProt Q50754

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A × 2 （Q50756） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B × 2 （Q50755） F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D × 2 （P60238） F420-non-reducing hydrogenase subunit G × 2 （P60239） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F × 4 （D9PU51） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A × 4 （D9PU54） formylmethanofuran dehydrogenase subunit B × 4 （D9PXE7） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G × 4 （D9PU52） Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C × 4 （P61937） Polyferredoxin protein MvhB × 2 （P60232） F420-non-reducing hydrogenase subunit A × 2 （P60227） IRON/SULFUR CLUSTER × 90 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 Non-cubane [4Fe-4S]-cluster × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZINC ION × 8 2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 8 MOLYBDENUM ATOM × 4 HYDROSULFURIC ACID × 4 FE3-S4 CLUSTER × 2 formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni) × 2 water × 32	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	HDRC_METTM
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185

F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D

物种未注明

UniProt P60238

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A × 2 （Q50756） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B × 2 （Q50755） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C × 2 （Q50754） F420-non-reducing hydrogenase subunit G × 2 （P60239） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F × 4 （D9PU51） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A × 4 （D9PU54） formylmethanofuran dehydrogenase subunit B × 4 （D9PXE7） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G × 4 （D9PU52） Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C × 4 （P61937） Polyferredoxin protein MvhB × 2 （P60232） F420-non-reducing hydrogenase subunit A × 2 （P60227） IRON/SULFUR CLUSTER × 90 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 Non-cubane [4Fe-4S]-cluster × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZINC ION × 8 2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 8 MOLYBDENUM ATOM × 4 HYDROSULFURIC ACID × 4 FE3-S4 CLUSTER × 2 formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni) × 2 water × 32	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MVHD_METTM
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–141； UniProt 1–141

F420-non-reducing hydrogenase subunit G

物种未注明

UniProt P60239

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A × 2 （Q50756） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B × 2 （Q50755） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C × 2 （Q50754） F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D × 2 （P60238） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F × 4 （D9PU51） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A × 4 （D9PU54） formylmethanofuran dehydrogenase subunit B × 4 （D9PXE7） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G × 4 （D9PU52） Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C × 4 （P61937） Polyferredoxin protein MvhB × 2 （P60232） F420-non-reducing hydrogenase subunit A × 2 （P60227） IRON/SULFUR CLUSTER × 90 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 Non-cubane [4Fe-4S]-cluster × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZINC ION × 8 2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 8 MOLYBDENUM ATOM × 4 HYDROSULFURIC ACID × 4 FE3-S4 CLUSTER × 2 formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni) × 2 water × 32	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MVHG_METTM
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–308； UniProt 1–308

Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F

物种未注明

UniProt D9PU51

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A × 2 （Q50756） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B × 2 （Q50755） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C × 2 （Q50754） F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D × 2 （P60238） F420-non-reducing hydrogenase subunit G × 2 （P60239） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A × 4 （D9PU54） formylmethanofuran dehydrogenase subunit B × 4 （D9PXE7） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G × 4 （D9PU52） Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C × 4 （P61937） Polyferredoxin protein MvhB × 2 （P60232） F420-non-reducing hydrogenase subunit A × 2 （P60227） IRON/SULFUR CLUSTER × 90 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 Non-cubane [4Fe-4S]-cluster × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZINC ION × 8 2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 8 MOLYBDENUM ATOM × 4 HYDROSULFURIC ACID × 4 FE3-S4 CLUSTER × 2 formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni) × 2 water × 32	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	D9PU51_METTM
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–349； UniProt 1–349 作者链 h； PDB构建体 1–349； UniProt 1–349

Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A

物种未注明

UniProt D9PU54

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A × 2 （Q50756） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B × 2 （Q50755） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C × 2 （Q50754） F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D × 2 （P60238） F420-non-reducing hydrogenase subunit G × 2 （P60239） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F × 4 （D9PU51） formylmethanofuran dehydrogenase subunit B × 4 （D9PXE7） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G × 4 （D9PU52） Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C × 4 （P61937） Polyferredoxin protein MvhB × 2 （P60232） F420-non-reducing hydrogenase subunit A × 2 （P60227） IRON/SULFUR CLUSTER × 90 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 Non-cubane [4Fe-4S]-cluster × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZINC ION × 8 2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 8 MOLYBDENUM ATOM × 4 HYDROSULFURIC ACID × 4 FE3-S4 CLUSTER × 2 formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni) × 2 water × 32	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	D9PU54_METTM
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–569； UniProt 1–569 作者链 i； PDB构建体 1–569； UniProt 1–569

formylmethanofuran dehydrogenase subunit B

物种未注明

UniProt D9PXE7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A × 2 （Q50756） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B × 2 （Q50755） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C × 2 （Q50754） F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D × 2 （P60238） F420-non-reducing hydrogenase subunit G × 2 （P60239） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F × 4 （D9PU51） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A × 4 （D9PU54） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G × 4 （D9PU52） Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C × 4 （P61937） Polyferredoxin protein MvhB × 2 （P60232） F420-non-reducing hydrogenase subunit A × 2 （P60227） IRON/SULFUR CLUSTER × 90 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 Non-cubane [4Fe-4S]-cluster × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZINC ION × 8 2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 8 MOLYBDENUM ATOM × 4 HYDROSULFURIC ACID × 4 FE3-S4 CLUSTER × 2 formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni) × 2 water × 32	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	D9PXE7_METTM
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–436； UniProt 1–436 作者链 j； PDB构建体 1–436； UniProt 1–436

Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G

物种未注明

UniProt D9PU52

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A × 2 （Q50756） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B × 2 （Q50755） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C × 2 （Q50754） F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D × 2 （P60238） F420-non-reducing hydrogenase subunit G × 2 （P60239） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F × 4 （D9PU51） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A × 4 （D9PU54） formylmethanofuran dehydrogenase subunit B × 4 （D9PXE7） Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C × 4 （P61937） Polyferredoxin protein MvhB × 2 （P60232） F420-non-reducing hydrogenase subunit A × 2 （P60227） IRON/SULFUR CLUSTER × 90 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 Non-cubane [4Fe-4S]-cluster × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZINC ION × 8 2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 8 MOLYBDENUM ATOM × 4 HYDROSULFURIC ACID × 4 FE3-S4 CLUSTER × 2 formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni) × 2 water × 32	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	D9PU52_METTM
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82 作者链 l； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82

Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C

物种未注明

UniProt P61937

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A × 2 （Q50756） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B × 2 （Q50755） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C × 2 （Q50754） F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D × 2 （P60238） F420-non-reducing hydrogenase subunit G × 2 （P60239） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F × 4 （D9PU51） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A × 4 （D9PU54） formylmethanofuran dehydrogenase subunit B × 4 （D9PXE7） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G × 4 （D9PU52） Polyferredoxin protein MvhB × 2 （P60232） F420-non-reducing hydrogenase subunit A × 2 （P60227） IRON/SULFUR CLUSTER × 90 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 Non-cubane [4Fe-4S]-cluster × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZINC ION × 8 2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 8 MOLYBDENUM ATOM × 4 HYDROSULFURIC ACID × 4 FE3-S4 CLUSTER × 2 formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni) × 2 water × 32	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	FMDC_METTM
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–400； UniProt 1–400 作者链 k； PDB构建体 1–400； UniProt 1–400

Polyferredoxin protein MvhB

物种未注明

UniProt P60232

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A × 2 （Q50756） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B × 2 （Q50755） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C × 2 （Q50754） F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D × 2 （P60238） F420-non-reducing hydrogenase subunit G × 2 （P60239） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F × 4 （D9PU51） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A × 4 （D9PU54） formylmethanofuran dehydrogenase subunit B × 4 （D9PXE7） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G × 4 （D9PU52） Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C × 4 （P61937） F420-non-reducing hydrogenase subunit A × 2 （P60227） IRON/SULFUR CLUSTER × 90 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 Non-cubane [4Fe-4S]-cluster × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZINC ION × 8 2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 8 MOLYBDENUM ATOM × 4 HYDROSULFURIC ACID × 4 FE3-S4 CLUSTER × 2 formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni) × 2 water × 32	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MVHB_METTM
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–412； UniProt 1–412

F420-non-reducing hydrogenase subunit A

物种未注明

UniProt P60227

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A × 2 （Q50756） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B × 2 （Q50755） H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C × 2 （Q50754） F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D × 2 （P60238） F420-non-reducing hydrogenase subunit G × 2 （P60239） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F × 4 （D9PU51） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A × 4 （D9PU54） formylmethanofuran dehydrogenase subunit B × 4 （D9PXE7） Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G × 4 （D9PU52） Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C × 4 （P61937） Polyferredoxin protein MvhB × 2 （P60232） IRON/SULFUR CLUSTER × 90 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 Non-cubane [4Fe-4S]-cluster × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZINC ION × 8 2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 8 MOLYBDENUM ATOM × 4 HYDROSULFURIC ACID × 4 FE3-S4 CLUSTER × 2 formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni) × 2 water × 32	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MVHA_METTM
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9sw6
沉积日期 deposition_date	2025-10-04
结构标题 title	Structure of the Mvh-Hdr-Fmd complex of Methanothermobacter marburgensis (composite structure)
关键词 keywords	Oxidoreductase, hydrogenase, dehydrogenase, polyferredoxin; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9sw6__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9sw6__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9sw6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	83.55 Å
Rg（电子密度）	83.18 Å
总 Rg	82.81 Å
原子数	183662
残基数	12026
排除体积	1667800 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9sw6__assembly_1__model_1`	34-meric （34）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (23)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A
分子量 formula_weight	72265.0 kDa
EC 编号 ec_number	1.8.98.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	92174

MAEEKKETMEEPKIGVYVCHCGVNIGGVVDVEAVRDYAAKLPNVVIAKDYKYYCSDPGQLEIQKDIKELGINRVVVAACSPRLHEPTFRRCVEEAGLNQFLFEFANIREHDSWVHMDNPEGATEKAKDLVRMAVAKARLLEPLEASKVSVDDKALVIGGGVAGIQAALDLADMGFKTYMVEKRPSISGRMGQLDKTFPTLDCSMCILAPKMVDVGKHDNIELITYAEVKEVDGYIGNFKVKIEKKPRYIDEELCTGCGSCVEVCPIEMPNYFDEGIGMTKAVYIPFPQAVPLCATIDKDYCIECMLCDEVCERGAVKHDQEPEEIEIEVGTIIVATGYDAYDPTEKLEYGYGRHTNVITGLELERMINASGPTDGKVLKPSDGEKPKRVAFIHCVGSRDEQIGKPYCSRVCCMYIMKNAQLIKDKMPDTEVTLYYMDIRAFGKGFEEFYKRSQEKYGIKFIRGRPAEVIENPDLTLTVRSEDTLLGKVTEYDYDMVVLGVGLVPPEGAETLRQTIGLSKSADGFLMEAHPKLRPVDTLTDGVYLAGVAQGPKDIPDAVAQASGAAARAAIPMVKGEVEIEPIIAVTDSDVCGGCEVCIELCPFGAISIEEGHANVNVALCKGCGTCVAACPSGAMDQQHFKTEQIMAQIEAALNEPASK

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B
分子量 formula_weight	33496.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.8.98.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MEIAYFLGCIMNNRYPGIEKATRVLFDKLGIELKDMEGASCCPAPGVFGSFDKTTWAAIAARNITIAEDMGADIMTECNGCFGSLFETNHLLKEDEEMKAKINEILKETGREYKGEVNVRHFAEVLYNDVGLDKLSELVEKPLNLNVAVHYGCHFLKPSDEINIDNPERPTILDEIVEVTGAKSVEYKDKMMCCGAGGGVRSRDLDVALDFTREKLTNMKEAGVDAIVNVCPFCHLQFDVGQMEIKDKFGEEFDIPVLHLAQLLGLAMGLPKEDLVVDAHQVCVDECLEKLEELDRLAPGSG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C
分子量 formula_weight	20548.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.8.98.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MTLLQREENIIRKGNIDKEFSEKIKAAGGDSLEYCFQCGTCTGSCPSGRRTPYRVRQIIRKANVGLKDEIISDPTLWMCTTCYSCQERCPRKVKIVDVVKLARNEAAKAGFMAPAHKAVGSFVIKTGHGVPINDATMELRKAVGLGELPPTTHQFPEALEEVQKIIKATGFDQLIGYNWETGELE

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D
分子量 formula_weight	15954.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.12.99.-
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MAEDDIKIVMFCCNWCSYGGADTAGTARMQYPTNIRVIRVMCSGRIEPQFVFKAFREGADGVLVTGCHHGDCHYDAGNYKLDRRMRLIYKLADELGIGRERIHHDWISASEGEKFAETVKMMVDRIRALGPSPIKKQLAEA

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	F420-non-reducing hydrogenase subunit G
分子量 formula_weight	33786.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.12.99.-
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MAEKIKIGTMWLGGCSGCHLSIADFHEKLLDVMEHADFEFSPVLMDTKYDEIPELDVVVIEGGIVNDENREFAEELREKAKFVISYGTCAVYGGIPGLRNLWDKDEVIEEAYINSITTPNEEGVIPSEDVPHLEGRVKPLGEVIDVDFEVPGCPPRSDVAAEVVMALLKGEEIELPSTNLCEVCPREKPPEGLAMDFIKRQFEVGKPEDDLCLIPQGLICMGPATVSICGAECPSIAIPCRGCYGPTARVEDQGAKMISAIASDYKVEEDKTVDPEEVAEQLDDIVGTFYTFTLPAALIPMKIKKEGK

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F
分子量 formula_weight	38614.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.2.99.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,h

METTEVIEGKNITVERTGEENRKLIFQDCLCAVCGLCGEICPVSAIEVNPTGAMVRTEQDESKILIDENKCVLCGMCSSICPFQALDLQIDGTSIKELAEYPKILKSAEIDDETCIQCKACETACPQDAITITRELPERKDLITGEIEIDKDTCIYCGMCEEMCPVDAIEIEHQIPSSSSPTVATDINVDEDKCVHCGICKRICPVDAIMQVCRICPYGEYEIKVPEVTGTSYIDPELCVNCGWCQEICPVDAATVTKPFEGELIIDQDTCQACETCVMACPCNVLSFPKPEKSGEKPTKLYKDERFCIYCGACERSCPVNAIEVKRSRINTTPIKSKAWKNAFESLLK

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A
分子量 formula_weight	63001.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.2.99.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,i

MEYIIKNGFVYCPLNNVDGEKMDICVRDGKIVESVSDSAKVIDASGKIVMPGGVDPHSHIAGAKVNVGRMYRPEDSRRDAEKFKAGRAGSGFSVPSTFMTGYRYAQMGYTTAMEAAMPPLLARHTHEEFHDTPIIDHAAYPLFGNNWFVMEYLKEGDVDACAAYASWLLKATKGYTIKIVNPAGTEAWGWGGNVHGIHDPAPYFDITPAEIIKGLAEVNEKLQLPHSIHLHCNDLGHPGNYETTLASFDVPKNIKANPATGERDTVLYATHVQFHSYGGTTWRDFVSEAPKIADYVNKNDHIVIDVGQITLDETTTMTADGPMEYDLHSLNGLKWANCDVELETGSGVVPFIYSARAPVPAVQWAIGMELFLLIDDPAKVCLTTDSPNAGPFTRYPRVIAWLMSNKYRMNLIEGELHKWAQRKSTIATVDREYTFSEIAQITRSTSAKVLGLSETKGHLGVGADADIAVYNINPETVDPSVDYMAIEEGFSRAAYVLKDGEIVVKDGEVVASPHGRTYWVDTRVDESTYNEVLAKVESKFKQYYSVNFANYPVQDEYLPKSAPVKGVML

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	formylmethanofuran dehydrogenase subunit B
分子量 formula_weight	48179.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.2.7.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,j

MSVYKNVTCPVCGGSCDDIEVLYDGKTIKTRNACRMGNAKFQEMVSSHRILRPQIKTESGFRSAEWDEALDAAAEILTESKRPTLFMGSEMSTEAMAAGLELGEYLNAMVDSNATICHGPTLMGIQEAGQSAATAGEIKNRADVIIYWGTNVMDSMPRHMSRYSIFMRGFFRERGKKDRTVISVDPRETATTKASDIHLQLKPNSDYELFSALLTVIRGNEPHRSIESITGISVETIKEVADIMLNAQFGAIYGGLGLASSEGKHRNVEMVLKLVAALNEHTKFTIGAIRGHCNVAGFNQVASWEYGFPFGVDFTRGYPRYNPGETTIVDLLQRKESDAVLVICSDLGAHLPKECVEYMKEIPVICIDIAPCPTTLVSDVVIPGVIDAMESSGTFYRFDNVPIHHKAFTTSPFPETESNEHTLRQILERVKSIKGE

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G
分子量 formula_weight	8564.9 kDa
EC 编号 ec_number	1.2.99.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,l

MAIGLKAYPELCHGCGNCVIACPVNALRSPEVAGGKGPTDDVEIIMIVEDGVVNIKNPDLCGKCGTCVESCPVDAIRLEELE

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C
分子量 formula_weight	43383.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.2.7.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,k

MGFVLVPKSDFQIPLEADTIRPDLFEGLDLDEIRSLQVYEGNIKRPLGEFFEIAETSHEDQLIRIDGDVSRVKYIGSGMKSGKIIINGDVGLQLGCEMKGGEIEVNGNVSSWIGMEMHGGTIKINGNAGDYVGCAYRGEWRGMKGGKIIIQGNAGNNIGGGMMAGEIYIGGDAGNFCGIRMNGGEITVRGDAGRAPGAEMVSGIIKIHGRISSLLPGFKEISTFKEDGSLMILFKGDLSEKNPEGNLYINYNKNLHILENETDEGRVITKKGIKVIYNSGSTIREGQIIKGGNKLTDDYIDECARCCISPEDYKLLGEPENVVVSSHGNEVVLRAVEDPGIQMGTIFIPRGIWANVLTPPYTESTGSPMYKGVPVYLRKASQGERILSAEELVEEYGVGK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Polyferredoxin protein MvhB
分子量 formula_weight	44090.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MIVVNKEDCIRCGACQGTCPTAAIEVTPEDVIYCDICGGEPKCVDACPTGALKIEDLVVDEAGNTQGRIVFNPDKCNECGDCVEVCPPQILKLDEGKVKKIPLQGFCVMCQKCVDICPVGVIGVEGIKEPAKVELEIEGPIFIADCVGCGMCVPECPVDAITLEKVGGVIEIDEDTCIKCGVCAQTCPWNAVYISGKKPEKRAKEIRKFELDEEACIGCNTCVEACPGDFIVPKSSNLTVELPAICTACGLCEQLCPVDAIDLDVELGPAKPASEEGLVWDEGKCDFIGACANICPNDAIRVVTREGMKLPDNEKVDEEPSFAMCTRCGACTMACPKGALSLVDMDKVIDGEVVKRKRVQYNPALCDQCGDCIEACPYDMLKLTDEKVPLKGFCILCDQCIPACPKGALSLK

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	F420-non-reducing hydrogenase subunit A
分子量 formula_weight	52905.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.12.99.-
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MVKLTMEPVTRIEGHAKITVHLDDAGNVEDTRLHVMEFRGFEKFLQGRPIEEAPRIVPRICGICDVQHHLAAAKAVDACFGFEPDDVLPAAYKMREIMNWGSYMHSHGLHFYFLAAPDFIAGKDRKTRNVFQIIKDAPDVALQAIELRKNALEIVRATGGRPIHPTSSTPGGISTELDDETQKDLLQKAQRNVELAEATLELAVPIFEENIDLVNSLGNIETYHTGLVKNGVWDVYDGIVRIKDKEGNLFREFKPADYADTIAEHVKPYSWLKFPYIKDLGYPDGVYRVSPLSRLNVADKMPDAAPKAQDYFKEFQDKFGYAQQTLLYHWARLIEVLACAECAADALEGDLSGEKFPDSLERQAGDGVGIVEAPRGTLTHHYTCDENGLITKANIVVATIQNNPAMEMGIQKVAQDYIKPGVEVDDKIFNLMEMVIRAYDPCLSCATHTIDSQMRLATLEVYDSEGDLVKRI

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	45

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	785.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	Non-cubane [4Fe-4S]-cluster
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	740.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	MOLYBDENUM ATOM
分子量 formula_weight	95.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	HYDROSULFURIC ACID
分子量 formula_weight	34.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	FE3-S4 CLUSTER
分子量 formula_weight	295.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	formyl[bis(hydrocyanato-1kappaC)]ironnickel(Fe-Ni)
分子量 formula_weight	195.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 23 Entity 23 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	343

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.70 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	722594

Structure of the Mvh-Hdr-Fmd complex of Methanothermobacter marburgensis (composite structure)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

H(2):CoB-CoM heterodisulfide,ferredoxin reductase subunit C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

F420-non-reducing hydrogenase iron-sulfur subunit D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

F420-non-reducing hydrogenase subunit G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

formylmethanofuran dehydrogenase subunit B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Molybdenum-containing formylmethanofuran dehydrogenase 1 subunit C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体