9v1k

Cryo- EM structure of small subunit (head) of 75S ribosome with P- tRNA from Entamoeba histolytica

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

40S ribosomal protein S25

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S28, putative × 1 （C4LZQ8） Ribosomal protein S29, putative × 1 （C4LW10） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative × 1 （C4LTS8） 17S rRNA × 1 40S ribosomal protein S3 × 1 （C4LT02） Small ribosomal subunit protein uS7 × 1 （O15587） 40S ribosomal protein S10, putative × 1 （C4LVC0） 40S ribosomal protein S15, putative × 1 （C4M7H3） 40S ribosomal protein S16, putative × 1 （C4M2R7） 40S ribosomal protein S17, putative × 1 （C4M0Z2） Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 （P48151） Small ribosomal subunit protein eS19 × 1 （O15631） 40S ribosomal protein S20, putative × 1 （C4M5V7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4M9F4_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 sA； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137

40S ribosomal protein S28, putative

物种未注明

UniProt C4LZQ8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S25 × 1 （C4M9F4） Ribosomal protein S29, putative × 1 （C4LW10） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative × 1 （C4LTS8） 17S rRNA × 1 40S ribosomal protein S3 × 1 （C4LT02） Small ribosomal subunit protein uS7 × 1 （O15587） 40S ribosomal protein S10, putative × 1 （C4LVC0） 40S ribosomal protein S15, putative × 1 （C4M7H3） 40S ribosomal protein S16, putative × 1 （C4M2R7） 40S ribosomal protein S17, putative × 1 （C4M0Z2） Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 （P48151） Small ribosomal subunit protein eS19 × 1 （O15631） 40S ribosomal protein S20, putative × 1 （C4M5V7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4LZQ8_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 sD； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69

Ribosomal protein S29, putative

物种未注明

UniProt C4LW10

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S25 × 1 （C4M9F4） 40S ribosomal protein S28, putative × 1 （C4LZQ8） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative × 1 （C4LTS8） 17S rRNA × 1 40S ribosomal protein S3 × 1 （C4LT02） Small ribosomal subunit protein uS7 × 1 （O15587） 40S ribosomal protein S10, putative × 1 （C4LVC0） 40S ribosomal protein S15, putative × 1 （C4M7H3） 40S ribosomal protein S16, putative × 1 （C4M2R7） 40S ribosomal protein S17, putative × 1 （C4M0Z2） Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 （P48151） Small ribosomal subunit protein eS19 × 1 （O15631） 40S ribosomal protein S20, putative × 1 （C4M5V7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4LW10_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 sE； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56

Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative

物种未注明

UniProt C4LTS8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S25 × 1 （C4M9F4） 40S ribosomal protein S28, putative × 1 （C4LZQ8） Ribosomal protein S29, putative × 1 （C4LW10） 17S rRNA × 1 40S ribosomal protein S3 × 1 （C4LT02） Small ribosomal subunit protein uS7 × 1 （O15587） 40S ribosomal protein S10, putative × 1 （C4LVC0） 40S ribosomal protein S15, putative × 1 （C4M7H3） 40S ribosomal protein S16, putative × 1 （C4M2R7） 40S ribosomal protein S17, putative × 1 （C4M0Z2） Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 （P48151） Small ribosomal subunit protein eS19 × 1 （O15631） 40S ribosomal protein S20, putative × 1 （C4M5V7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4LTS8_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 sG； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321

40S ribosomal protein S3

物种未注明

UniProt C4LT02

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S25 × 1 （C4M9F4） 40S ribosomal protein S28, putative × 1 （C4LZQ8） Ribosomal protein S29, putative × 1 （C4LW10） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative × 1 （C4LTS8） 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS7 × 1 （O15587） 40S ribosomal protein S10, putative × 1 （C4LVC0） 40S ribosomal protein S15, putative × 1 （C4M7H3） 40S ribosomal protein S16, putative × 1 （C4M2R7） 40S ribosomal protein S17, putative × 1 （C4M0Z2） Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 （P48151） Small ribosomal subunit protein eS19 × 1 （O15631） 40S ribosomal protein S20, putative × 1 （C4M5V7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4LT02_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 sd； PDB构建体 1–244； UniProt 1–244

Small ribosomal subunit protein uS7

物种未注明

UniProt O15587

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S25 × 1 （C4M9F4） 40S ribosomal protein S28, putative × 1 （C4LZQ8） Ribosomal protein S29, putative × 1 （C4LW10） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative × 1 （C4LTS8） 17S rRNA × 1 40S ribosomal protein S3 × 1 （C4LT02） 40S ribosomal protein S10, putative × 1 （C4LVC0） 40S ribosomal protein S15, putative × 1 （C4M7H3） 40S ribosomal protein S16, putative × 1 （C4M2R7） 40S ribosomal protein S17, putative × 1 （C4M0Z2） Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 （P48151） Small ribosomal subunit protein eS19 × 1 （O15631） 40S ribosomal protein S20, putative × 1 （C4M5V7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS5_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 sg； PDB构建体 1–206； UniProt 1–206

40S ribosomal protein S10, putative

物种未注明

UniProt C4LVC0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S25 × 1 （C4M9F4） 40S ribosomal protein S28, putative × 1 （C4LZQ8） Ribosomal protein S29, putative × 1 （C4LW10） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative × 1 （C4LTS8） 17S rRNA × 1 40S ribosomal protein S3 × 1 （C4LT02） Small ribosomal subunit protein uS7 × 1 （O15587） 40S ribosomal protein S15, putative × 1 （C4M7H3） 40S ribosomal protein S16, putative × 1 （C4M2R7） 40S ribosomal protein S17, putative × 1 （C4M0Z2） Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 （P48151） Small ribosomal subunit protein eS19 × 1 （O15631） 40S ribosomal protein S20, putative × 1 （C4M5V7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4LVC0_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 sl； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127

40S ribosomal protein S15, putative

物种未注明

UniProt C4M7H3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S25 × 1 （C4M9F4） 40S ribosomal protein S28, putative × 1 （C4LZQ8） Ribosomal protein S29, putative × 1 （C4LW10） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative × 1 （C4LTS8） 17S rRNA × 1 40S ribosomal protein S3 × 1 （C4LT02） Small ribosomal subunit protein uS7 × 1 （O15587） 40S ribosomal protein S10, putative × 1 （C4LVC0） 40S ribosomal protein S16, putative × 1 （C4M2R7） 40S ribosomal protein S17, putative × 1 （C4M0Z2） Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 （P48151） Small ribosomal subunit protein eS19 × 1 （O15631） 40S ribosomal protein S20, putative × 1 （C4M5V7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4M7H3_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 sq； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144

40S ribosomal protein S16, putative

物种未注明

UniProt C4M2R7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S25 × 1 （C4M9F4） 40S ribosomal protein S28, putative × 1 （C4LZQ8） Ribosomal protein S29, putative × 1 （C4LW10） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative × 1 （C4LTS8） 17S rRNA × 1 40S ribosomal protein S3 × 1 （C4LT02） Small ribosomal subunit protein uS7 × 1 （O15587） 40S ribosomal protein S10, putative × 1 （C4LVC0） 40S ribosomal protein S15, putative × 1 （C4M7H3） 40S ribosomal protein S17, putative × 1 （C4M0Z2） Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 （P48151） Small ribosomal subunit protein eS19 × 1 （O15631） 40S ribosomal protein S20, putative × 1 （C4M5V7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4M2R7_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 ss； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158

40S ribosomal protein S17, putative

物种未注明

UniProt C4M0Z2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S25 × 1 （C4M9F4） 40S ribosomal protein S28, putative × 1 （C4LZQ8） Ribosomal protein S29, putative × 1 （C4LW10） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative × 1 （C4LTS8） 17S rRNA × 1 40S ribosomal protein S3 × 1 （C4LT02） Small ribosomal subunit protein uS7 × 1 （O15587） 40S ribosomal protein S10, putative × 1 （C4LVC0） 40S ribosomal protein S15, putative × 1 （C4M7H3） 40S ribosomal protein S16, putative × 1 （C4M2R7） Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 （P48151） Small ribosomal subunit protein eS19 × 1 （O15631） 40S ribosomal protein S20, putative × 1 （C4M5V7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4M0Z2_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 st； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

Small ribosomal subunit protein uS13

物种未注明

UniProt P48151

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S25 × 1 （C4M9F4） 40S ribosomal protein S28, putative × 1 （C4LZQ8） Ribosomal protein S29, putative × 1 （C4LW10） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative × 1 （C4LTS8） 17S rRNA × 1 40S ribosomal protein S3 × 1 （C4LT02） Small ribosomal subunit protein uS7 × 1 （O15587） 40S ribosomal protein S10, putative × 1 （C4LVC0） 40S ribosomal protein S15, putative × 1 （C4M7H3） 40S ribosomal protein S16, putative × 1 （C4M2R7） 40S ribosomal protein S17, putative × 1 （C4M0Z2） Small ribosomal subunit protein eS19 × 1 （O15631） 40S ribosomal protein S20, putative × 1 （C4M5V7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS18_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 su； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155

Small ribosomal subunit protein eS19

物种未注明

UniProt O15631

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S25 × 1 （C4M9F4） 40S ribosomal protein S28, putative × 1 （C4LZQ8） Ribosomal protein S29, putative × 1 （C4LW10） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative × 1 （C4LTS8） 17S rRNA × 1 40S ribosomal protein S3 × 1 （C4LT02） Small ribosomal subunit protein uS7 × 1 （O15587） 40S ribosomal protein S10, putative × 1 （C4LVC0） 40S ribosomal protein S15, putative × 1 （C4M7H3） 40S ribosomal protein S16, putative × 1 （C4M2R7） 40S ribosomal protein S17, putative × 1 （C4M0Z2） Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 （P48151） 40S ribosomal protein S20, putative × 1 （C4M5V7）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS19_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 sv； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155

40S ribosomal protein S20, putative

物种未注明

UniProt C4M5V7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 1	40S ribosomal protein S25 × 1 （C4M9F4） 40S ribosomal protein S28, putative × 1 （C4LZQ8） Ribosomal protein S29, putative × 1 （C4LW10） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative × 1 （C4LTS8） 17S rRNA × 1 40S ribosomal protein S3 × 1 （C4LT02） Small ribosomal subunit protein uS7 × 1 （O15587） 40S ribosomal protein S10, putative × 1 （C4LVC0） 40S ribosomal protein S15, putative × 1 （C4M7H3） 40S ribosomal protein S16, putative × 1 （C4M2R7） 40S ribosomal protein S17, putative × 1 （C4M0Z2） Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 （P48151） Small ribosomal subunit protein eS19 × 1 （O15631）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4M5V7_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 sw； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9v1k
沉积日期 deposition_date	2025-05-19
最后修订 last_revision	2025-10-08
结构标题 title	Cryo- EM structure of small subunit (head) of 75S ribosome with P- tRNA from Entamoeba histolytica
关键词 keywords	SSU-head, Ribosome, P-tRNA, Entamoeba histolytica; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9v1k__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9v1k__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9v1k__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	42.48 Å
Rg（电子密度）	42.97 Å
总 Rg	43.21 Å
原子数	22456
残基数	2029
排除体积	365480 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9v1k__assembly_1__model_1`	tetradecameric （14）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S25
分子量 formula_weight	14794.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sA
原子数 atom_count	22456

MPPKDAKGKGAASGKKGALTKPKKSSGGKAPKKSWSKTKVKEKLNNAVLFDKATLDKCTKEVPSMKVITPAVVADRMKITCSLAKILLKDLEKKELIVPVKVDNHIWIYTRSAKHAAAAPTEAEKKPAKGSKKQVKA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S28, putative
分子量 formula_weight	7746.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sD

MSTQVTETPVIYAQVTEILGRTGSRGGVLQVRCDIMGENRQILRNVKGPIRVGDILTLLEAEREARRLR

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Ribosomal protein S29, putative
分子量 formula_weight	6472.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sE

MGSYSIYNAHPRNYGNGSRTCRKCGARKGLIRKYGLDLCRRCFREKAVEIGFQKLD

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative
分子量 formula_weight	35015.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sG

MSAGLAFELKSTLEGHNGAVTSIAVAATKPDVLVSGSRDKTLMVWKVDTNSEAQAETILPTKSLHGHSHFISDLVLSNDGQFAISSSWDHTLRLWDLTKMESVRRFVGHEGDVMSVAFSADNTKIISGGRDKTIKLWNTVGKCVASVKTDSHSEWVSCVRFVPNAKGNKFVSAGWDNQVKTWTLDQSCKLESTITHHTGFINTVAFSPDGSIMATAGKDGNIAMWTLNNGTGLYEFLYDVPVNCQVYQIVFAENPEQYTLLAATELGVVAIKDKEIKAFTKTSACMSICLSATKDVIFTGHVDKKIRMWKVGVASTIKATN

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	17S rRNA
分子量 formula_weight	628401.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	sa

UAUCUGGUUGAUCCUGCCAGUAUUAUAUGCUGAUGUUAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUGUAAGUAUAAAGACCAAGUAGGAUGAAACUGCGGACGGCUCAUUAUAACAGUAAUAGUUUCUUUGGUUAGUAAAAUACAAGGAUAGCUUUGUGAAUGAUAAAGAUAAUACUUGAGACGAUCCAGUUUGUAUUAGUACAAAAUGGCCAAUUCAUUCAAUGAAUUGAGAAAUGACAUUCUAAGUGAGUUAGGAUGCCACGACAAUUGUAGAACACACAGUGUUUAACAAGUAACCAAUGAGAAUUUCUGAUCUAUCAAUCAGUUGGUAGUAUCGAGGACUACCAAGAUUAUAACGGAUAACGAGGAAUUGGGGUUCGACAUCGGAGAGGGAGCUUUACAGAUGGCUACCACUUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGUAAAUUACCCACUUUCGAAUUGAAGAGGUAGUGACGACACAUAACUCUAGAGUUGAGUAAAAUCAAUUCUUGAAGGAAUGAGUAGGAGGUAAAUUCUCCUACGAAAUCAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGUGUAUAUUAAAGUUGCUGUGAUUAAAACGCUCGUAGUUGAAUUAAAAUGUGGUUUUAUACAUUUUGAAGACUUUAUGUAAGUAAAGUUUCUAGAAAUGUUAAAUUAAAAUCAAAGAAGGAAACAAUUCAAGUAAUUGAGUUGUUAUUACUUUGAAUAAAAUAAGGUGUUUAAAGCAAAACAUUAUGUUAAUGAAUAUUCAAGCAUGGGACAAUGCUGAGGGGAUGUCAAUAAGACAUUUCGAGAGAAGGAUUAAAAGGAACAAUUGGGGUGAUUCAGAAAAUAACGGGAGAGGUGAAAAUCCAUGAUCGCUAUAAGAUGCACGAGAGCGAAAGCAUUUCACUCAACUGUGUCCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCCUAACUAUAAACGAUGUCAACCAAGGAUUGGAUGAAAUUCAGAUGUACAAAGAUAGAGAAGCAUUGUUUCUAGAUCUGAGUAUAUCAAUAUUACCUUGUUCAGAACUUAAAGAGAAAUCUUGAGUUUAUGGACUUCAGGGGGAGUAUGGUCACAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAAGACCGAACAGUAGAAGGAAUGACAGAUUAAGAGUUCUUUCAUGAUUUAUUGGGUAGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCAGGUUAAUUCCGGUAACGAACGAGACUGAAACCUAUUAAUUAGUUUUCUGCCUAUAAGACAGAAAUGUUCGCAAGAACAGGUGCGUAAGUACCACUUCUUAAAGGGACACAUUUCAAUUGUCCUAUUUUAAUUGUAGUUAUCUAAUUUCGGUUAGACCUCUUUUAACGUGGGAAAAAGAAAAAGGAAGCAUUCAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGACAUCUUGGGCCGCACGCGCGCUACAAUGGAGUUACUAGAGAGUAUUUUAUCAUUUACACCUUAUUUAUUAGGCUUUGUCUAAUAAUUAAGGAUAGUAAGUGGUGUACCGAGAUUGAAAUAGUUAAGGAAAACUCAAAAGAACGUACAUGACAGGGAUAAAUGAUUGGAAUUAUUUGUUUUGAACGAGGAAUUCCUUGUAAUAUCGAGUCAUUAACUCGAGAUGAAUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAUAAAGAGGUGAAAUUCUAGGAUUCUGUCUUAUAGAUAGAAAAAUGGAUUUAAAUCUCCUUAUUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S3
分子量 formula_weight	26977.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sd

MFCLTKTKALNVDVLKTNISRKHKFVADGVFYAELNELLQRELSADGYSGVEVRKNGSKFQIIIRATRTTNIIGDKGRRIHELTNLLIARFGFPKDKIELYVEKVLARGLCPVSQAESIKYKIAEGLPVRRAVGSVMRLIMDSGAKGCEVSISGKLRGQRAQGMVFKEGYMIKSGNATRQFYSSAVRCVLLRMGIIGIKVTIMLDTDPSGKNGPAARIPDVVEIKTPKDESTTVKTEVIPANKQ

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein uS7
分子量 formula_weight	23072.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sg

MAEAVAQPVETVAHTFAPKLFNKWSYDVTVSDISLKELLAINSKLKYQVFLPHTAGRYQIKPFRKIQCPIVERLVCCMMQHGKNSGKKLLAMRVVEESFEIIHLLTEKNPIQVLVDAIINASPREDSTRVGTGGNAKRQAVDVSPLRRINQALYLMTMGCRSAAFRNSKTLAECLADEIVNASKSNTASFAIKKKEDMERVAKSNR

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S10, putative
分子量 formula_weight	14575.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sl

MRIATKDIIAIYKQLFNDGCIVCHKDFVCLHPVFGIPNLQVFMLMKGLATKKCVKETCNWRCLYWTLNDEGIAYLRQKLALPEDAVPSTLKQSIHTAVHDEAKQIQGERKLKKDFNAGKKPEMKKAE

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S15, putative
分子量 formula_weight	16405.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sq

MSETVAKKRTFKKFELQGKSLEEITAMPEADFVKMLDARARRSYRRSPKLKHERLVKKLLKIKKATKEGEKPKLVKTHCRDKIILPNMIGSVIGVYNGKSFTTVEIKPEMLGHYLGEFSITYKPVTHGRPGVGATHSSKFVPLK

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S16, putative
分子量 formula_weight	17547.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	ss

MSATVKATGKTQKKHTEALKSVQVFGKKKTAIAVCLCKEGKGMIRVNGVPLDLINPPVLRIKVFEPLFIVGKENYAKLDLKIRVTGGGQVAQAYAIRQAIAKALIAYNQKFVDETTKNELKAKFLEYDRTLLVADPRRCEAKKFGGPGARAKYQKSYR

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S17, putative
分子量 formula_weight	13618.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	st

MGGVRTKTVKRAARNIIEKYYPLLTLDFHTNKRVVDEVAVVETKRLRNKIAGFITHLMRRIQKGPVRGISFKLQEEERERRDNYVPEKSEVNIDKITADPVTLKMLESIGMPINKKN

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein uS13
分子量 formula_weight	17698.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	su

MATVTSESEFQHMLRVCNTNLDGRRKVPYALTGIKGCGRRYAYLVCKRAGIDVNKRAGLMTPAEIEKIVDILNNPLNYKIPVWFLNRQKDNKDGKDSQLIANAVETRLREDIEALKKMRAHRGLRHYWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSRTKGA

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein eS19
分子量 formula_weight	17776.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sv

MHHFSNIKDVVAIDFIKAYAEHLKKSGKLEIPEWVDTVKTGMCKELAPLNPDWIYIRAAAIARKVYLNNGIGVMALRRAYGDQYNKHYNPSHRTLGSGKVNRYILQQLEKMGIVAKIQSGRSLTKEGRKDMDKIAFQVYKEHEAKVTPMILMPMN

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S20, putative
分子量 formula_weight	13258.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sw

MANIKKDIKAPVTPKVYKNITITITSTKVKAVESLCAEVKENGKKKGVQVKGPVRIPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDHYQMRIYKRVLSMKTTPETVKEITSLKVEPGVELEVAMFD

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	53764

Cryo- EM structure of small subunit (head) of 75S ribosome with P- tRNA from Entamoeba histolytica

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

40S ribosomal protein S25

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S28, putative

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ribosomal protein S29, putative

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Guanine nucleotide-binding protein subunit beta 2-like 1, putative

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein uS7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S10, putative

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S15, putative

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S16, putative

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S17, putative

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体