9vci

Crystal structure of Escherichia coli tryptophanyl-tRNA synthetase in complex with an inhibitor

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tryptophan--tRNA ligase

Escherichia coli

UniProt E2QFN4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 ~{N}-[[5-[4-(6-azanyl-8-oxidanylidene-9-piperidin-4-yl-purin-7-yl)phenoxy]-2-fluoranyl-4-oxidanyl-phenyl]methyl]ethanamide × 1 SULFATE ION × 5 CHLORZOXAZONE × 1 TRYPTOPHANYL-5'AMP × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 E2QFN4_ECOLX
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–333; UniProt 1–333 作者链 B; PDB构建体 1–333; UniProt 1–333

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9vci
沉积日期 deposition_date2025-06-06
最后修订 last_revision2025-09-24
结构标题 titleCrystal structure of Escherichia coli tryptophanyl-tRNA synthetase in complex with an inhibitor
关键词 keywordstryptophanyl-tRNA synthetase, an inhibitor, complex, LYASE; LYASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9vci__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9vci__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9vci__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)30.75 Å
Rg(电子密度)30.72 Å
总 Rg31.21 Å
原子数5110
残基数656
排除体积90410 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9vci__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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7. 引用文献 (1)