9vfj

PSI-LHCI of Euglena gracilis strain Z

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

物种未注明

UniProt P19431

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） Photosystem I reaction center subunit II × 1 Photosystem I reaction center subunit IV × 1 Photosystem I reaction center subunit III × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHCI-1 × 1 LHCI-2 × 1 LHCI-3 × 1 LHCI-4 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） LHCI-6 × 1 LHCI-7 × 1 LHCI-8 × 1 LHCI-9 × 1 LHCI-10 × 1 LHCI-11 × 3 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 236 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 17 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 UNKNOWN LIGAND × 42 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 26 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAB_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–734； UniProt 1–734

Photosystem I iron-sulfur center

物种未注明

UniProt P31556

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） Photosystem I reaction center subunit II × 1 Photosystem I reaction center subunit IV × 1 Photosystem I reaction center subunit III × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHCI-1 × 1 LHCI-2 × 1 LHCI-3 × 1 LHCI-4 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） LHCI-6 × 1 LHCI-7 × 1 LHCI-8 × 1 LHCI-9 × 1 LHCI-10 × 1 LHCI-11 × 3 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 236 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 17 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 UNKNOWN LIGAND × 42 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 26 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAC_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Photosystem I reaction center subunit IX

物种未注明

UniProt P30394

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） Photosystem I reaction center subunit II × 1 Photosystem I reaction center subunit IV × 1 Photosystem I reaction center subunit III × 1 Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHCI-1 × 1 LHCI-2 × 1 LHCI-3 × 1 LHCI-4 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） LHCI-6 × 1 LHCI-7 × 1 LHCI-8 × 1 LHCI-9 × 1 LHCI-10 × 1 LHCI-11 × 3 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 236 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 17 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 UNKNOWN LIGAND × 42 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 26 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAJ_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–37； UniProt 1–37

Photosystem I reaction center subunit XII

物种未注明

UniProt P31479

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） Photosystem I reaction center subunit II × 1 Photosystem I reaction center subunit IV × 1 Photosystem I reaction center subunit III × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） LHCI-1 × 1 LHCI-2 × 1 LHCI-3 × 1 LHCI-4 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） LHCI-6 × 1 LHCI-7 × 1 LHCI-8 × 1 LHCI-9 × 1 LHCI-10 × 1 LHCI-11 × 3 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 236 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 17 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 UNKNOWN LIGAND × 42 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 26 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAM_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–31； UniProt 1–31

Chloroplast light-harvesting complex I protein

物种未注明

UniProt A8HPE4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） Photosystem I reaction center subunit II × 1 Photosystem I reaction center subunit IV × 1 Photosystem I reaction center subunit III × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHCI-1 × 1 LHCI-2 × 1 LHCI-3 × 1 LHCI-4 × 1 LHCI-6 × 1 LHCI-7 × 1 LHCI-8 × 1 LHCI-9 × 1 LHCI-10 × 1 LHCI-11 × 3 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 236 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 BETA-CAROTENE × 17 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 UNKNOWN LIGAND × 42 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 26 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A8HPE4_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 5； PDB构建体 1–252； UniProt 535–786

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9vfj
沉积日期 deposition_date	2025-06-11
结构标题 title	PSI-LHCI of Euglena gracilis strain Z
关键词 keywords	Photosystem I, ELECTRON TRANSPORT, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9vfj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9vfj__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9vfj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	62.59 Å
Rg（电子密度）	61.87 Å
总 Rg	61.84 Å
原子数	48198
残基数	4252
排除体积	889700 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9vfj__assembly_1__model_1`	21-meric （21）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (29)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
分子量 formula_weight	85183.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	48242

VYDNLIENYMTITPPEQQVKRVRVAFVSNPVETSFEKWSRPGHFSRLLSKGPNTTTWIWNLHADAHDFDNHTTDLEDISRKVFSAHFGQLAIIEIWLSGMFFHGARFSNYEAWLLDPIHVKPSAQIVWPIVGQEILNGDVGGNFQGIQITSGLFQLWRSCGITSEFQLYITALTGLIFSAVLFFAGWFHYHKAAPKLEWFQNVESMLNHHLSGLLGLGCLSWAGHQIHVSLPINKLLDSGVNPAELPLPHDFILDKSLISQLYPSFSKGLAPFFTFHWSEYSDFLTFRGGLNNVTGGLWLTDVAHHHLALAVLFILAGHMYKTNWKIGHDIKGLLESHTGPFTGQGHKGLYEIFTNSWHAQLSLNLAMMGSLSIIVAQHMYSMPPYPYIAIDYGTELSLFTHHYWIGGFCIVGAAAHAAIFMVRDYDPALNFNNLLDRVLLHRDAIISHLNWVCIFLGLHSFGLYIHNDTLSALGRPQDMFSDSAIQLQPVFAQWIQNTHYLAPTLTAFNLVSPTTPVWGGDVVSISGKVAMMPIKLGTADFLVHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFSRSSRLIPDKASLGFRFPCDGPGRGGTCQVSAWDHVFLGLFWMYNSISVAIFHFSWKMQSDVWGTVLANKVSHITGGNFSQGSLTINGWLRDFLWAQSSQVIQSYGSPLSAYGLMFLGAHFVWAFSLMFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKVAPNIQPRALSITQGRAVGVAHYLLGGIATTWSFFLARIISVG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2
分子量 formula_weight	82780.3 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MATKFPKFSQGLAQDPTTRRIWFGIATSHDFESHDGMTENNLYQKIFASHFGQLAIIFLWTSGNLFHVAWQGNFEQWIKDPLHIRPIAHAISDPHFGQPAIEAFTRSQFPGPVNIAYSGVYQWWYTIGLRTNVDLYNGSMFLLFIATLALFAGWLHLEPKYSPKVSWFKDAESRLNHHLSALFGLSSLAWSGHLIHVAIPESRGIHVRWDNFLSQLPHPSGLEPFFKGNWSLYSENPDSLTHVFGTASGAGTAVLTFLGGFHPETKSLWLTDIAHHHLAIAVLFIVAGHMYRTNFAIGHRIDDILNAHKAPSGKLGLGHFGLYETINNSLHFQLGLALASLGVITSLVAQHMYSLSPYAFLIQDRTTMAALYTHHQYIAGFIMTGAFAHGAIFFIRDFDEEKNKGNVLSRILDHKEAIISHLSWVTLFLGFHTLGLYVHNDVMQAFGTPEKQILIEPVFAQWIQSAHGKNIYELNILLSSDSSNAFSASQAIWLPGWLNGINDKSTSLFLQIGPGDFLVHHAIALGLHTTTLILVKGALDARGSRLMPDKKDFGYSFPCDGPGRGGTCDISAWDAFYLAVFWMLNTIGWTTFYWHWKHITLWQGNVGQFNESSTYLMGWLRDYLWLNSSQLINGYNPFGMNSLAVWGWMFLFGHLVWATGFMFLISWRGYWQELIETLVWAHERTPITNVFKWTDKPVALSIVQARLVGLAHFSVGYVFTYAAFLIASTSAKFG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem I iron-sulfur center
分子量 formula_weight	8784.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSHSVKIYNTCIGCTQCVRACPTDVLEMVPWDGCKAGQIASSPRTEDCVGCKRCESACPTDFLSVRVYLGSETSRSMGLAY

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit II
分子量 formula_weight	76196.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

LAAGALFGLALSPSVASNYAAPSAVRASTTISAVRPVVFTGSYVRGVQTGRTTVVEATPNQEVETLASANNLWVTAAAAGLAFSAASLVLALLRKPRSEETYSMLAEAAEVGKAPWTAPKLEDALKNEKARQKAEALSTQLPVFWDLRDALGEVPKSKFPEVFARYKGSTGTLLSAAKTEEYYAITWTSPKTQIYELPTGGAAEMDEGLNIMYFARKEQCLALGAQLRTKFKPRIESFAIYRVFPNGETQYLHPKDGVFPEKVNQGRTKANHNPRSIGENKEPASVKFTGTTPKDVQTEGAVAMFAETGEKAAKPAWTVPDLADALKNTSAVAKAKGIATQLPTFWELRDALSEVPKSKFPEVFASYKGSTGTLLSAAEKEEKYVITWTSPKKQIFELPTGGAAEMEEGENIFFFARKEQCLALGAQLRTAFKPRIENFQIFRVFPNGEVQYLHPKDGVFPEKVNQGRTKANHNPRSIGENAEPASVKFTGTTPKDVQTEGAVAMFAETGEKAAKPAWTVPNLSDALKNTAAVAKAKEIATQLPTFWELRDALSEVPKSKFPEVFASYKGSTGTLLAAAEKEEKYVITWTSPKKQIFELPTGGAAEMEEGENIFYFARKEQCLALGAQLRTAFKPRIENFQIFRVFPNGEVQYLHPKDGVFPEKVNAGRQQANHNARSIGENVEPASVKFSGSTPKDL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IV
分子量 formula_weight	17927.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

ECLFFFGQITMAFNNAMADPWFKFTAVSSATLMAIGCALMAIAELTAPQQQALYAAPAVQTRMITRLADDAAARVADRTQFIEEYKERRAEAPATPKAKAGPARGSTVKVTRPESYWYNQYGKVISVDESGAIRYPVVVRFEKENYQGVTTNNFALDELEY

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit III
分子量 formula_weight	35240.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

QNLESKQLSIFFRAEHKMYRCNYQNLESKQWSMTAVLGVTALLSVSVGATAGFIASQPSTTSLYAPASTTTSISSVAAIPVSQAAARAPVQAVPVSEAQSVEQSIYTEAPQASFNWAPVAALIALPTAIAAFLLRRSENEVKLATAGVAASAVLASGAMTAMPANATEAILGLTPCAESAKFQKVLTKEVKALEKREKLYEPGSAPFQALEATKAKTQARFAKYAESGLLCGADGLPHLISDPGLAVKYGHAGETLIPTIGFLYVAGYIGTAGRTYLQEISTRQKPTQSEIIIDVPLATSIAFKSWDWPNKAVKELASGTLLEDAKNVPVSRR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IX
分子量 formula_weight	4298.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MKYFTTYLSTAPVVAVLWFTLTASLLIEINRFFPDIL

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XII
分子量 formula_weight	3445.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MEITTNQVYIALLASLIPAFFAFKLGKSLNQ

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	LHCI-1
分子量 formula_weight	52475.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1

LVGFVAAQTTSLHAPVVVRPVVQASTLAVPAARAGRANVLLRAGTESQIVPKNGFATKVNVAFVPLACGVGALAALVATLVHKKEQPLAMLATSGEKRPTWFPGAEAPAWLTGEFPGDRGFDPCGLARDPVDFAKFRDSEVFHGRWAMLGLVGCLVPEVFGNLGIAQLPAWYDAATVANTSNLDYLGNPNLVHASNVSFIALSTLLLMGPVEAWRWNGALASEAKSAERTTYPGGPFDPLKLGASPELKLKEIKNGRLAMVGMFGFWAQSYVTGEGPLANLAAHLADPAHNNLLNTVAMFAASGEKRPTWFPGAEAPAWLTGEYPGDRGFDPFGLAKDPEDFAKNRDSEVYHGRWAMLGLVGCLVPEVFGNLGIAQLPAWYEAGAVANTGSLDYLGNPNLVHASNVPLIFFTTLLLFLPIEAWRWNGQIAPDAKSKEWTTYPGGPFDPLKLGASPELKLKEIKNGRLAMVGMFGFWAQSYVTGEGPLANLAA

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	LHCI-2
分子量 formula_weight	65361.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

IFFRHSLLSSTHFKMPNNADAMKFGLAAGAAMGVIVYVLAGTASSTSLAATHVNIQQAPAVIPRMASVPSAYTIATNPIGASARVVDANYESTDYLTLPATEKSTMGSLLMIAAAGVAAAVAFVWKSVPRQQDSVINVPLLPVSVATMATSGKKSKAPAADNLSQWYGPDRAKWLGPLTGQVPAYLTGELPGDYGWDTAGLGADPVTLARYREAEVIHARWAMLGALGVVTPELLAGNGVPFGEGAVWYKAGAQIFSADGLNYLGNPSLIHAQSVVLTFLSTLAIMGAVEAYRYGGGVGDFGRELDTLYPGGPFDPLGLANDPDALAELKVKELKNGRLAMVAMLGFYVQPLVTKAGPVENLTFHLADPSSNNIFSFTSGFAMFAATGSKWYGPNRPKWLGPLSGGAVPEYLKGEYAGDYGFDTAGLAADPKLFQRYRDAELQNGRWAMLGVLGCLAPEVLSNVFGVPYPEPVWFKTGATILNGGSIDYLANPKLIHASNLLLTLVLELVFFFAAETWREAGEGPLGKAQDKSYPGGVFDPLGLSKDPAAFAEAKVKEVKNGRLAMLAMLGLFVQAGVTGQSPLENLSAHLANPGVNFWTSYAPTLAMFAASGRKSAAPK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	LHCI-3
分子量 formula_weight	46443.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

VYFFSKKMASSVPLKQLSIVLLSGAAIACIFISDASTSLSTVSPVVQSRTLQRIDNQLKASRIQTYPGTTLQLRTASSTTLNEVFGKEGKFQLSLLAPLLSTLGAAVAIFMWNKKTQEETAMFAATGEKLSDWYGPNRKLFLGPLSDGAPEHLKGELPGDYGFDVLGLATQPTRLERYRQGEIINGRWAMLGIVGCIVPELLARNYGVPFPEPVWFKTGATVFSEEGLNYLGNPSLIHAKSIAAILVTEILFVGAAEAFRVSGGPLGPATDLVYPGKAFDPLGLSKDETAFAELKVKEVKNGRLAMLGMLGLFMQGFATGKGPLQNLADHLADPTGANIITFHQRVLSDLGGVAMFAATGEKLSDWYGPNRKLFLGPLSDGAPEHLKGELPGDYGFDVLGLATQPTRLERYRQGEIINGRWAMLGIVGCIV

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	LHCI-4
分子量 formula_weight	44705.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

IPELLGRGVWFQAGESVDAAQLGLYFMFLAAPSEYWRGNGGFGWDQKEKKAGNRIYPGFDPLKMTSDETKTKEIKNGRLAMIAFLGLVSQANTTGVSPFQNLAAVFGASPVAMFTTTGEKRPLWFPGAKPPAYLTGEFPADRGFDPLGLAKDPATYERMRSSEVFHSRLAMLGVVGSLIPELQGQGAWYTLSEKQFGPGPNGEVIGFTELALIGMLFSYPLEYWRGNGGFGWFEEKGDRTYPGFDPLQLTSEYTKTAEIKNGRLAMSALLGFAVQHATTGASPLENWAATTGGSVAMFAAAGERATWFPGAKAPPHLTGEFPGDRGFDPVDFAANPESFERMRASEVFHGRMAMLGVAGCLIPELLGRGVWFQAGESVDAAQLGLYFMFLAAPSEYWRGNGGFGWDQKEKK

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Chloroplast light-harvesting complex I protein
分子量 formula_weight	27130.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	5

WRGNGGFGWFEEKGDRTYPGFDPLQLTSEYTKTAEIKNGRLAMSALLGFAVQHATTGASPLENWAATTGGSVAMFAAAGERATWFPGAKAPPHLTGEFPGDRGFDPVDFAANPESFERMRASEVFHGRMAMLGVAGCLIPELLGRGVWFQAGESVDAAQLGLYFMFLAAPSEYWRGNGGFGWDQKEKKAGNRIYPGFDPLKMTSDETKTKEIKNGRLAMIAFLGLVSQANTTGVSPFQNLAAVFGASPVAML

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	LHCI-6
分子量 formula_weight	95661.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	6

YFFSDKKMYGTVSASSSNKATSTVAVCACAAVFAVAGFVAVQPRSLYAPAAVRPVVQATMTTVPVAHSVQSNTVAAQIQSRPLNVESNVFAQVGSTFAPIALGVGALAAFVAALIHKGQQPVAMAASSGERLLWIPNATPPAHLTGEFPGDRGFDPLGLSKDPKVFARMRISEVFHGRLAMLGIVGCVGQEWLFNKGAWFDYSDFDLPRLGLIALQVIAPLEYWRGNGGFSWNGNDGPDRSYPGFDPLGLTTEDTKLREIKNGRLAMSAMLGLEVQSHITGKSPLTNLGDHLSSPFTANILTGGGSVAMFSTSGKVDRPLWFPGGYAPSYLTGQYFGDRGFDPAGLAADPKVFERMRVSEVYHGRLAMLAIVGAVVPDILGKGAWYEAAQNAGIGVNEVAVFTAAYGVVEVARGLKANSDPTKNYPGFDPLKLTTDYTKEAEIKNGRLALTGMLGLEVQRHVTGVSPLVNLVEHVKHPLNHNIAESVMHQWPVAMFAATGHKDGVWFPGAQPPAHLTGEYPADRGFDPLSLAADPTVYARMRVSEVFHARLSMLAIVGSIVPELLGKGAWFEVGNSVDGIKLGFILMAIAAPTEYWRGNGGFNWDKGTADRSYPGFDPLKLTTDYTKAAEIKNGRLAMTGLLGLTFQYLATGESPLANLAAHLANPVGANITTTLAMYSTSGEKYRGLWFPNITPPAYLTGEFPADRGFDPAGLAADPKVYERMRVAEVFNGRLAMLAIVGCVYPELLGNGVWFEVWNKVDFYRFALISLQVVAPLEYWRGNGGFGWDGEEKYDRSYPGFDPCNLTTEYTKAAEIKNGRLAMIGMFGLEVQNHVTAQGPVANLIEHLRHPLAANIGASLAHPWPPVAMFATTGHKDGVWFPGAQPPAHL

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	LHCI-7
分子量 formula_weight	66506.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	7

EIKNGRLAMTAMLGLEVQSHITGKSPLTNLSEHLSHPLSANLLTGGGSLAMFSTAGQKTDRRPLWFPGGYAPSWLTGQHFGDRGFDPAGLAADPKVFERMRVSEVYHGRLAMLAIVGAVVPDIQGKGAWYEAAQSAGIGVNEVAVFTAAYGIAEVARGLKANSDPTSRYPGFDPLNLTTDYTKEAEIKNGRLALTAMLGLEVQRHVTGVSPLVNLVEHVKHPLGHNIAESVMHQWPVAMFAATGHKDGVWFPGATPPAHLTGEYPADRGFDPLSLAADPTVYARMRVSEVFHARLSMLAIVGAIVPEVLGKGAWFEAGNSVDGIKLGFIAMAIAAPTEYWRGNGGFNWDKGAADRSYPGFDPLKLTTDYTKAAEIKNGRLAMAGLLGLTFQYLATGESPLANLAAHLANPVGANITTTLAMYSTSGEKYRGLWFPNITPPAYLTGEFPADRGFDPAGLAADPKVYERMRIAEVFNGRLAMLAIVGCVYPELLGNGVWFEVWNKVDFYRFALISLQVVAPLEYWRGNGGFGWDGEEKYDRSYPGFDPCNLTTEYTKAAEIKNGRLAMIGMFGLEVQSHVTAQGPVANLIEHLRHPLAANIGANLAHPWPPVAMFATT

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	LHCI-8
分子量 formula_weight	89149.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	8

FFSIEKKMYGAAHNSSSNKNATSIVAFFGCAAVFAVAGFVAAQPGALYAPASVRPAVASMTAAPAMMIQRPSSAVAATNVQAQNVQGSGYHQVGATFAPIVLGVGAITAFVAALLHRGQKPVAMAATTGERLLWVPNATPPAHLTGEFPGDRGFDPLGLAKDPKVYQRMRISEVFHGRLAMLGIVGCVAPELFFSKGAWFDYSDYDLNRLGLIALQVIAPLEYWRGNGGFSWDGNDGPDRSYPGFDPLGLTNEETKLQEIKNGRLAMTAMLGLEVQSHITGKSPLTNLSEHLSHPLSANLLTGGGSLAMFSTAGQKTDRRPLWFPGGYAPSWLTGQHFGDRGFDPAGLAADPKVFERMRVSEVYHGRLAMLAIVGAVVPDIQGKGAWYEAAQSAGIGVNEVAVFTAAYGIAEVARGLKANSDPTSRYPGFDPLNLTTDYTKEAEIKNGRLALTAMLGLEVQRHVTGVSPLVNLVEHVKHPLGHNIAESVMHQWPVAMFAATGHKDGVWFPGATPPAHLTGEYPADRGFDPLSLAADPTVYARMRVSEVFHARLSMLAIVGSIVPELLGKGAWFEVGNSVDGIKLGFILMAIAAPTEYWRGNGGFNWDKGTADRSYPGFDPLKLTTDYTKAAEIKNGRLAMTGLLGLTFQYLATGESPLANLAAHLANPVGANITTTLAMYSTSGEKYRGLWFPNITPPAYLTGEFPADRGFDPAGLAADPKVYERMRVAEVFNGRLAMLAIVGCVYPELLGNGVWFEVWNKVDFYRFALISLQVVAPLEYWRGNGGFGWDGEEKYDRSYPGFDPCNLTTEYTKAAEIKNGRLAMIGMF

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	LHCI-9
分子量 formula_weight	94434.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	9

GFVAAQPGALYAPASVRPAVASMTAAPAMMIQRPSSAVAATNVQAQNVQGSGYHQVGATFAPIVLGVGAITAFVAALLHRGQKPVAMAATTGERLLWIPNATPPAHLTGEFPGDRGFDPLGLAKDPKVYQRMRISEVFHGRLAMLGIVGCVAPELFFSKGAWFDYSDYDLNRLGLIALQVIAPLEYWRGNGGFSWDGNDGPDRSYPGFDPLGLTNEETKLQEIKNGRLAMTAMLGLEVQSHITGKSPLTNLSEHLSHPLSANLLTGGGSLAMFSTAGQKTDRRPLWFPGGYAPSWLTGQHFGDRGFDPAGLAADPKVFERMRVSEVYHGRLAMLAIVGAVVPDIQGKGAWYEAAQSAGIGVNEVAVFTAAYGIAEVARGLKANSDPTSRYPGFDPLNLTTDYTKEAEIKNGRLALTAMLGLEVQRHVTGVSPLVNLVEHVKHPLGHNIAESVMHQWPVAMFAATGHKDGVWFPGATPPAHLTGEYPADRGFDPLSLAADPTVYARMRVSEVFHARLCMLAIVGAIVPEVLGKGAWFEAGNSVDGIKLGFIAMAIAAPTEYWRGNGGFNWDKGAADRSYPGFDPLKLTTDYTKAAEIKNGRLAMAGLLGLTFQYLATGESPLANLAAHLANPVGTNITTTLAMYSTSGEKYRGLWFPNITPPAYLTGEFPADRGFDPAGLAADPKVYERMRIAEVFNGRLAMLAIVGCVYPELLGNGVWFEVWNKVDFYRFALISLQVVAPLEYWRGNGGFGWDGEEKYDRSYPGFDPCNLTTEYTKAAEIKNGRLAMIGMFGLEVQSHVTAQGPVANLIEHLRPCSWSVRLESYTPVCWHAPGFFQNFQRMGQRAPFQWGVTEPPSFIHTSATVNEGWWGSES

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	LHCI-10
分子量 formula_weight	69436.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	10

MSAMLGLEVQSHITGKSPLTNLGDHLSSPFTANILTGGGSVAMFSTSGKVDRPLWFPGGYAPSYLTGQYFGDRGFDPAGLAADPKVFERMRVSEVYHGRLAMLAIVGAVVPDILGKGAWYEAAQNAGIGVNEVAVFTAAYGVVEVARGLKANSDPTKNYPGFDPLKLTTDYTKEAEIKNGRLALTGMLGLEVQRHVTGVSPLVNLVEHVKHPLNHNIAESVMHQWPVAMFAATGHKDGVWFPGAQPPAHLTGEYPADRGFDPLSLAADPTVYARMRVSEVFHARLSMLAIVGSIVPELLGKGAWFEVGNSVDGIKLGFILMAIAAPTEYWRGNGGFNWDKGTADRSYPGFDPLKLTTDYTKAAEIKNGRLAMTGLLGLTFQYLATGESPLANLAAHLANPVGANITTTLAMYSTSGEKYRGLWFPNITPPAYLTGEFPADRGFDPAGLAADPKVYERMRVAEVFNGRLAMLAIVGCVYPELLGNGVWFEVWNKVDFYRFALISLQVVAPLEYWRGNGGFGWDGEEKYDRSYPGFDPCNLTTEYTKAAEIKNGRLAMIGMFGLEVQNHVTAQGPVANLIEHLRHPLAANIGANLAHPWPPVAMFATTGHKDGVWFPGAQPPAHLTGEYPADRGFDPLSLAADPT

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	LHCI-11
分子量 formula_weight	112373.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	11,12,13

FFSDKKMYGTVSASSSNKATSTVAVCACAAVFAVAGFVAVQPRSLYAPAAVRPVVQATMTTVPVAHSVQSNTVAAQIQSRPLNVESNVFAQVGSTFAPIALGVGALAAFVAALIHKGQQPVAMAASSGERLLWIPNATPPAHLTGEFPGDRGFDPLGLSKDPKVFARMRISEVFHGRLAMLGIVGCVGQEWLFNKGAWFDYSDFDLPRLGLIALQVIAPLEYWRGNGGFSWNGNDGPDRSYPGFDPLGLTTEDTKLREIKNGRLAMSAMLGLEVQSHITGKSPLTNLGDHLSSPFTANILTGGGSVAMFSTSGKVDRPLWFPGGYAPSYLTGQYFGDRGFDPAGLAADPKVFERMRVSEVYHGRLAMLAIVGAVVPDILGKGAWYEAAQNAGIGVNEVAVFTAAYGVVEVARGLKANSDPTKNYPGFDPLKLTTDYTKEAEIKNGRLALTGMLGLEVQRHVTGVSPLVNLVEHVKHPLNHNIAESVMHQWPVAMFAATGHKDGVWFPGAQPPAHLTGEYPADRGFDPLSLAADPTVYARMRVSEVFHARLSMLAIVGSIVPELLGKGAWFEVGNSVDGIKLGFILMAIAAPTEYWRGNGGFNWDKGTADRSYPGFDPLKLTTDYTKAAEIKNGRLAMTGLLGLTFQYLATGESPLANLAAHLANPVGANITTTLAMYSTSGEKYRGLWFPNITPPAYLTGEFPADRGFDPAGLAADPKVYERMRIAEVFNGRLAMLAIVGCVYPELLGNGVWFEVWNKVDFYRFALISLQVVAPLEYWRGNGGFGWDGEEKYDRSYPGFDPCNLTTEYTKAAEIKNGRLAMIGMFGLEVQSHVTAQGPVANLIEHLRHPLAANIGANLAHPWPPVAMFATTGHKDGVWFPGATPPAHLTGEYPADRGFDPLSLAADPTVYARMRVSEVFHARLSMLAIVGAIVPEVLGKGAWFEAGNSVDGIKLGFIAMAIAAPTEYWRGNGGFNWDKGAADRSYPGFDPLKLTTDYTKAAEIKNGRLAMAGLLGLTFQYLATGESPLANLAAHLANPVGANITTTLA

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A ISOMER
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	236

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	17

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	UNKNOWN LIGAND
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	42

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	(3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol
分子量 formula_weight	582.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	26

实体 29 Entity 29 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	44

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.83 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	56060

PSI-LHCI of Euglena gracilis strain Z

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I iron-sulfur center

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit IX

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit XII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chloroplast light-harvesting complex I protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9vfj__assembly_1__model_1

9vfj__assembly_1__model_1 | I(q)

9vfj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (29)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

实体 10 Entity 10 polymer

聚合物 Polymer

实体 11 Entity 11 polymer

聚合物 Polymer

实体 12 Entity 12 polymer

聚合物 Polymer

实体 13 Entity 13 polymer

聚合物 Polymer

实体 14 Entity 14 polymer

聚合物 Polymer