9vjs

Cryo-EM structure of Euglenophyte photosystem I

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

物种未注明

UniProt P19430

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 23	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHC-1 × 1 Light harvesting chlorophyll a /b binding protein of PSII × 1 （Q39725） LHC-3 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPC6） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 2 （A8HPD0） LHC-10, 15 × 2 LHC-11 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 4 （A8HPD7） CHLOROPHYLL A × 244 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 37 BETA-CAROTENE × 13 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 16 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 CHLOROPHYLL B × 27 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSAA_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–751； UniProt 1–751

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

物种未注明

UniProt P19431

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 23	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P19430） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHC-1 × 1 Light harvesting chlorophyll a /b binding protein of PSII × 1 （Q39725） LHC-3 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPC6） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 2 （A8HPD0） LHC-10, 15 × 2 LHC-11 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 4 （A8HPD7） CHLOROPHYLL A × 244 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 37 BETA-CAROTENE × 13 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 16 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 CHLOROPHYLL B × 27 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSAB_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–733； UniProt 1–733

Photosystem I iron-sulfur center

物种未注明

UniProt P31556

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 23	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P19430） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHC-1 × 1 Light harvesting chlorophyll a /b binding protein of PSII × 1 （Q39725） LHC-3 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPC6） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 2 （A8HPD0） LHC-10, 15 × 2 LHC-11 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 4 （A8HPD7） CHLOROPHYLL A × 244 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 37 BETA-CAROTENE × 13 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 16 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 CHLOROPHYLL B × 27 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSAC_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Photosystem I reaction center subunit IX

物种未注明

UniProt P30394

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 23	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P19430） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHC-1 × 1 Light harvesting chlorophyll a /b binding protein of PSII × 1 （Q39725） LHC-3 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPC6） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 2 （A8HPD0） LHC-10, 15 × 2 LHC-11 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 4 （A8HPD7） CHLOROPHYLL A × 244 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 37 BETA-CAROTENE × 13 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 16 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 CHLOROPHYLL B × 27 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSAJ_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–37； UniProt 1–37

Photosystem I reaction center subunit XII

物种未注明

UniProt P31479

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 23	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P19430） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） LHC-1 × 1 Light harvesting chlorophyll a /b binding protein of PSII × 1 （Q39725） LHC-3 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPC6） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 2 （A8HPD0） LHC-10, 15 × 2 LHC-11 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 4 （A8HPD7） CHLOROPHYLL A × 244 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 37 BETA-CAROTENE × 13 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 16 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 CHLOROPHYLL B × 27 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSAM_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–31； UniProt 1–31

Light harvesting chlorophyll a /b binding protein of PSII

物种未注明

UniProt Q39725

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 23	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P19430） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHC-1 × 1 LHC-3 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPC6） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 2 （A8HPD0） LHC-10, 15 × 2 LHC-11 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 4 （A8HPD7） CHLOROPHYLL A × 244 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 37 BETA-CAROTENE × 13 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 16 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 CHLOROPHYLL B × 27 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q39725_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–225； UniProt 351–575

Chloroplast light-harvesting complex I protein

物种未注明

UniProt A8HPE4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 23	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P19430） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHC-1 × 1 Light harvesting chlorophyll a /b binding protein of PSII × 1 （Q39725） LHC-3 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPC6） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 2 （A8HPD0） LHC-10, 15 × 2 LHC-11 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 4 （A8HPD7） CHLOROPHYLL A × 244 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 37 BETA-CAROTENE × 13 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 16 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 CHLOROPHYLL B × 27 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A8HPE4_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	12, 13
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 1–184； UniProt 62–245 作者链 e； PDB构建体 1–177； UniProt 608–784

Chloroplast light-harvesting complex I protein

物种未注明

UniProt A8HPC6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 23	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P19430） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHC-1 × 1 Light harvesting chlorophyll a /b binding protein of PSII × 1 （Q39725） LHC-3 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 2 （A8HPD0） LHC-10, 15 × 2 LHC-11 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 4 （A8HPD7） CHLOROPHYLL A × 244 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 37 BETA-CAROTENE × 13 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 16 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 CHLOROPHYLL B × 27 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A8HPC6_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 f； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185

Chloroplast light-harvesting complex I protein

物种未注明

UniProt A8HPD0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 23	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P19430） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHC-1 × 1 Light harvesting chlorophyll a /b binding protein of PSII × 1 （Q39725） LHC-3 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPC6） LHC-10, 15 × 2 LHC-11 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 4 （A8HPD7） CHLOROPHYLL A × 244 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 37 BETA-CAROTENE × 13 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 16 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 CHLOROPHYLL B × 27 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A8HPD0_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 g； PDB构建体 1–191； UniProt 210–400 作者链 j； PDB构建体 1–191； UniProt 210–400

Chloroplast light-harvesting complex I protein

物种未注明

UniProt A8HPD7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 23	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P19430） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P19431） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P31556） PsaD × 1 PsaE × 1 PsaF × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （P30394） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （P31479） LHC-1 × 1 Light harvesting chlorophyll a /b binding protein of PSII × 1 （Q39725） LHC-3 × 1 Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPE4） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 1 （A8HPC6） Chloroplast light-harvesting complex I protein × 2 （A8HPD0） LHC-10, 15 × 2 LHC-11 × 1 CHLOROPHYLL A × 244 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 (3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol × 37 BETA-CAROTENE × 13 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 16 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 CHLOROPHYLL B × 27 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A8HPD7_EUGGR
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 k； PDB构建体 1–174； UniProt 429–602 作者链 l； PDB构建体 1–174； UniProt 429–602 作者链 m； PDB构建体 1–174； UniProt 429–602 作者链 n； PDB构建体 1–174； UniProt 429–602

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9vjs
沉积日期 deposition_date	2025-06-21
结构标题 title	Cryo-EM structure of Euglenophyte photosystem I
关键词 keywords	Euglenophyte, Photosystem I, evolution, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9vjs__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9vjs__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9vjs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	68.55 Å
Rg（电子密度）	68.26 Å
总 Rg	68.00 Å
原子数	54391
残基数	4732
排除体积	1008700 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9vjs__assembly_1__model_1`	23-meric （23）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (29)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
分子量 formula_weight	84059.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	54391

MTITPPEQQVKRVRVAFVSNPVETSFEKWSRPGHFSRLLSKGPNTTTWIWNLHADAHDFDNHTTDLEDISRKVFSAHFGQLAIIEIWLSGMFFHGARFSNYEAWLLDPIHVKPSAQIVWPIVGQEILNGDVGGNFQGIQITSGLFQLWRSCGITSEFQLYITALTGLIFSAVLFFAGWFHYHKAAPKLEWFQNVESMLNHHLSGLLGLGCLSWAGHQIHVSLPINKLLDSGVNPAELPLPHDFILDKSLISQLYPSFSKGLAPFFTFHWSEYSDFLTFRGGLNNVTGGLWLTDVAHHHLALAVLFILAGHMYKTNWKIGHDIKGLLESHTGPFTGQGHKGLYEIFTNSWHAQLSLNLAMMGSLSIIVAQHMYSMPPYPYIAIDYGTELSLFTHHYWIGGFCIVGAAAHAAIFMVRDYDPALNFNNLLDRVLLHRDAIISHLNWVCIFLGLHSFGLYIHNDTLSALGRPQDMFSDSAIQLQPVFAQWIQNTHYLAPTLTAFNLVSPTTPVWGGDVVSISGKVAMMPIKLGTADFLVHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFSRSSRLIPDKASLGFRFPCDGPGRGGTCQVSAWDHVFLGLFWMYNSISVAIFHFSWKMQSDVWGTVLANKVSHITGGNFSQGSLTINGWLRDFLWAQSSQVIQSYGSPLSAYGLMFLGAHFVWAFSLMFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKVAPNIQPRALSITQGRAVGVAHYLLGGIATTWSFFLARIISVG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2
分子量 formula_weight	82723.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MATKFPKFSQGLAQDPTTRRIWFGIATSHDFESHDGMTENNLYQKIFASHFGQLAIIFLWTSGNLFHVAWQGNFEQWIKDPLHIRPIAHAISDPHFGQPAIEAFTRSQFPGPVNIAYSGVYQWWYTIGLRTNVDLYNGSMFLLFIATLALFAGWLHLEPKYSPKVSWFKDAESRLNHHLSALFGLSSLAWSGHLIHVAIPESRGIHVRWDNFLSQLPHPSGLEPFFKGNWSLYSENPDSLTHVFGTASGAGTAVLTFLGGFHPETKSLWLTDIAHHHLAIAVLFIVAGHMYRTNFAIGHRIDDILNAHKAPSGKLGLGHFGLYETINNSLHFQLGLALASLGVITSLVAQHMYSLSPYAFLIQDRTTMAALYTHHQYIAGFIMTGAFAHGAIFFIRDFDEEKNKGNVLSRILDHKEAIISHLSWVTLFLGFHTLGLYVHNDVMQAFGTPEKQILIEPVFAQWIQSAHGKNIYELNILLSSDSSNAFSASQAIWLPGWLNGINDKSTSLFLQIGPGDFLVHHAIALGLHTTTLILVKGALDARGSRLMPDKKDFGYSFPCDGPGRGGTCDISAWDAFYLAVFWMLNTIGWTTFYWHWKHITLWQGNVGQFNESSTYLMGWLRDYLWLNSSQLINGYNPFGMNSLAVWGWMFLFGHLVWATGFMFLISWRGYWQELIETLVWAHERTPITNVFKWTDKPVALSIVQARLVGLAHFSVGYVFTYAAFLIASTSAKF

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem I iron-sulfur center
分子量 formula_weight	8784.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSHSVKIYNTCIGCTQCVRACPTDVLEMVPWDGCKAGQIASSPRTEDCVGCKRCESACPTDFLSVRVYLGSETSRSMGLAY

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	PsaD
分子量 formula_weight	22389.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MFAETGEKAAKPAWTVPDLADALKNTSAVAKAKGIATQLPTFWELRDALSEVPKSKFPEVFASYKGSTGTLLSAAEKEEKYVITWTSPKKQIFELPTGGAAEMEEGENIFYFARKEQCLALGAQLRTAFKPRIENFQIFRVFPNGEVQYLHPKDGVFPEKVNQGRTKANHNPRSIGENAEPASVKFTGTTPKDVQTEGAVAMF

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	PsaE
分子量 formula_weight	11251.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MITRLADDAAARVADRTQFIEEYKERRAEAPATPKAKAGPARGSTVKVTRPESYWYNQYGKVISVDESGAIRYPVVVRFEKENYQGVTTNNFALDELEY

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	PsaF
分子量 formula_weight	18556.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MPANATEAILGLTPCAESAKFQKVLTKEVKALEKREKLYEPGSAPFQALEATKAKTQARFAKYAESGLLCGADGLPHLISDPGLAVKYGHAGETLIPTIGFLYVAGYIGTAGRTYLQEISTRQKPTQSEIIIDVPLATSIAFKSWDWPNKAVKELASGTLLEDAKNVPVSRR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IX
分子量 formula_weight	4298.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MKYFTTYLSTAPVVAVLWFTLTASLLIEINRFFPDIL

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XII
分子量 formula_weight	3445.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MEITTNQVYIALLASLIPAFFAFKLGKSLNQ

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	LHC-1
分子量 formula_weight	22417.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

MLATSGEKRPTWFPGAEAPAWLTGEFPGDRGFDPCGLARDPVDFAKFRDSEVFHGRWAMLGLVGCLVPEVFGNLGIAQLPAWYDAATVANTSNLDYLGNPNLIHASNVSFIALSTLLLMGPVEAWRWNGALASEAKSAERTTYPGGPFDPLKLGASPELKLKEIKNGRLAMVGMFGFWAQSYVTGEGPLANLAAHLADPAHNNLLNTVA

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Light harvesting chlorophyll a /b binding protein of PSII
分子量 formula_weight	24103.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MFAATGSKWYGPNRPKWLGPLSGGAVPEYLKGEYAGDYGFDTAGLAADPKLFQRYRDAELQNGRWAMLGVLGCLAPEVLSNVFGVPYPEPVWFKTGATILNGGSIDYLANPKLIHASNLLLTLVLELVFFFAAETWREAGEGPLGKAQDKSYPGGVFDPLGLSKDPAAFAEAKVKEVKNGRLAMLAMLGLFVQAGVTGQSPLENLSAHLANPGVNFWTSYAPTLA

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	LHC-3
分子量 formula_weight	24694.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MFAATGEKLSDWYGPNRKLFLGPLSDGAPEHLKGELPGDYGFDVLGLATQPTRLERYRQGEIINGRWAMLGIVGCIVPELLARNYGVPFPEPVWFKTGATVFSEEGLNYLGNPSLIHAKSIAAILVTEILFVGAAEAFRVSGGPLGPATDLVYPGKAFDPLGLSKDETAFAELKVKEVKNGRLAMLGMLGLFMQGFATGKGPLQNLADHLADPTGANIITFHQRVLSDLG

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Chloroplast light-harvesting complex I protein
分子量 formula_weight	19968.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MFTTTGEKRPVWFPGATPPAYLTGEFPADRGFDPLGLAKDPATYERMRSSEVFHSRLAMLGVVGSLIPELQGQGAWYTLSEKQFGPGPNGEVIGFTELALIGMLFSYPLEYWRGNGGFGWFEEKGDRTYPGFDPLQLTSEYTKTAEIKNGRLAMSALLGFAVQHATTGASPLENWAATTGGSVA

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Chloroplast light-harvesting complex I protein
分子量 formula_weight	19103.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MFAAAGERATWFPGAKAPPHLTGEFPGDRGFDPVDFAANPESFERMRASEVFHGRMAMLGVAGCLIPELLGRGVWFQAGESVDAAQLGLYFMFLAAPSEYWRGNGGFGWDQKEKKAGNRIYPGFDPLKMTSDETKTKEIKNGRLAMIAFLGLVSQANTTGVSPFQNLAAVFGASPVA

来源 Source

来源生物 organism	Euglena gracilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3039
宿主生物 host_organism	Euglena gracilis

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Chloroplast light-harvesting complex I protein
分子量 formula_weight	20021.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

MAASSGERLLWIPNATPPAHLTGEFPGDRGFDPLGLSKDPKVFARMRISEVFHGRLAMLGIVGCVGQEWLFNKGAWFDYSDFDLPRLGLIALQVIAPLEYWRGNGGFSWNGNDGPDRSYPGFDPLGLTTEDTKLREIKNGRLAMSAMLGLEVQSHITGKSPLTNLGDHLSSPFTANILTGGGSVA

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Chloroplast light-harvesting complex I protein
分子量 formula_weight	21290.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g,j

MYSTSGEKYRGLWFPNITPPAYLTGEFPADRGFDPAGLAADPKVYERMRIAEVFNGRLAMLAIVGCVYPELLGNGVWFEVWNKVDFYRFALISLQVVAPLEYWRGNGGFGWDGEEKYDRSYPGFDPCNLTTEYTKAAEIKNGRLAMIGMFGLEVQSHVTAQGPVANLIEHLRHPLAANIGANLAHPWPPVA

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	LHC-10, 15
分子量 formula_weight	20346.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	h,o

MFSTAGQKTDRRPLWFPGGYAPSWLTGQHFGDRGFDPAGLAADPKVFERMRVSEVYHGRLAMLAIVGAVVPDIQGKGAWYEAAQSAGIGVNEVAVFTAAYGIAEVARGLKANSDPTSRYPGFDPLNLTTDYTKEAEIKNGRLALTAMLGLEVQRHVTGVSPLVNLVEHVKHPLGHNIAESVMHQWPVA

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	LHC-11
分子量 formula_weight	20130.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i

MAATTGERLLWIPNATPPAHLTGEFPGDRGFDPLGLAKDPKVYQRMRISEVFHGRLAMLGIVGCVAPELFFSKGAWFDYSDYDLNRLGLIALQVIAPLEYWRGNGGFSWDGNDGPDRSYPGFDPLGLTNEETKLQEIKNGRLAMTAMLGLEVQSHITGKSPLTNLSEHLSHPLSANLLTGGGSLA

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Chloroplast light-harvesting complex I protein
分子量 formula_weight	18444.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k,l,m,n

MFATTGHKDGVWFPGATPPAHLTGEYPADRGFDPLSLAADPTVYARMRVSEVFHARLSMLAIVGAIVPEVLGKGAWFEAGNSVDGIKLGFIAMAIAAPTEYWRGNGGFNWDKGAADRSYPGFDPLKLTTDYTKAAEIKNGRLAMAGLLGLTFQYLATGESPLANLAAHLANPVG

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	244

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	(3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol
分子量 formula_weight	582.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	37

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	13

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE
分子量 formula_weight	510.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL B
分子量 formula_weight	907.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	27

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ;
分子量 formula_weight	600.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

分辨率 resolution	2.72 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	78124

Cryo-EM structure of Euglenophyte photosystem I

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I iron-sulfur center

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit IX

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit XII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Light harvesting chlorophyll a /b binding protein of PSII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chloroplast light-harvesting complex I protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chloroplast light-harvesting complex I protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chloroplast light-harvesting complex I protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chloroplast light-harvesting complex I protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体