9x69

The structure of phycobilisome with a bicylindrical core from the cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 58	ApcG × 2 （Q31RM8） Phycobilisome rod-core linker polypeptide × 4 （Q31LK9） Allophycocyanin, beta subunit × 22 （Q31RG1） Allophycocyanin alpha chain × 20 （Q31RG0） Phycobiliprotein ApcE × 2 （Q31RF9） Allophycocyanin, beta subunit × 2 （O50209） Allophycocyanin alpha-B chain × 2 （Q31RP7） PHYCOCYANOBILIN × 48	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q31RG2_SYNE7
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67 作者链 Y； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67 作者链 Z； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67 作者链 z； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67

ApcG

物种未注明

UniProt Q31RM8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 58	Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 4 （Q31RG2） Phycobilisome rod-core linker polypeptide × 4 （Q31LK9） Allophycocyanin, beta subunit × 22 （Q31RG1） Allophycocyanin alpha chain × 20 （Q31RG0） Phycobiliprotein ApcE × 2 （Q31RF9） Allophycocyanin, beta subunit × 2 （O50209） Allophycocyanin alpha-B chain × 2 （Q31RP7） PHYCOCYANOBILIN × 48	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q31RM8_SYNE7
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–110； UniProt 1–110 作者链 b； PDB构建体 1–110； UniProt 1–110

Phycobilisome rod-core linker polypeptide

物种未注明

UniProt Q31LK9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 58	Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 4 （Q31RG2） ApcG × 2 （Q31RM8） Allophycocyanin, beta subunit × 22 （Q31RG1） Allophycocyanin alpha chain × 20 （Q31RG0） Phycobiliprotein ApcE × 2 （Q31RF9） Allophycocyanin, beta subunit × 2 （O50209） Allophycocyanin alpha-B chain × 2 （Q31RP7） PHYCOCYANOBILIN × 48	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q31LK9_SYNE7
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250 作者链 3； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250 作者链 4； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250 作者链 5； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250

Allophycocyanin, beta subunit

物种未注明

UniProt Q31RG1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 58	Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 4 （Q31RG2） ApcG × 2 （Q31RM8） Phycobilisome rod-core linker polypeptide × 4 （Q31LK9） Allophycocyanin alpha chain × 20 （Q31RG0） Phycobiliprotein ApcE × 2 （Q31RF9） Allophycocyanin, beta subunit × 2 （O50209） Allophycocyanin alpha-B chain × 2 （Q31RP7） PHYCOCYANOBILIN × 48	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q31RG1_SYNE7
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 B； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 C； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 F； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 K； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 L； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 M； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 O； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 T； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 V； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 X； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 a； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 c； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 d； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 g； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 l； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 m； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 n； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 p； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 u； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 w； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 y； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161

Allophycocyanin alpha chain

物种未注明

UniProt Q31RG0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 58	Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 4 （Q31RG2） ApcG × 2 （Q31RM8） Phycobilisome rod-core linker polypeptide × 4 （Q31LK9） Allophycocyanin, beta subunit × 22 （Q31RG1） Phycobiliprotein ApcE × 2 （Q31RF9） Allophycocyanin, beta subunit × 2 （O50209） Allophycocyanin alpha-B chain × 2 （Q31RP7） PHYCOCYANOBILIN × 48	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q31RG0_SYNE7
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 E； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 G； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 H； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 I； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 J； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 Q； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 R； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 U； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 W； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 e； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 f； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 h； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 i； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 j； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 k； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 r； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 s； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 v； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 x； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161

Phycobiliprotein ApcE

物种未注明

UniProt Q31RF9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 58	Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 4 （Q31RG2） ApcG × 2 （Q31RM8） Phycobilisome rod-core linker polypeptide × 4 （Q31LK9） Allophycocyanin, beta subunit × 22 （Q31RG1） Allophycocyanin alpha chain × 20 （Q31RG0） Allophycocyanin, beta subunit × 2 （O50209） Allophycocyanin alpha-B chain × 2 （Q31RP7） PHYCOCYANOBILIN × 48	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q31RF9_SYNE7
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–705； UniProt 1–705 作者链 o； PDB构建体 1–705； UniProt 1–705

Allophycocyanin, beta subunit

物种未注明

UniProt O50209

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 58	Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 4 （Q31RG2） ApcG × 2 （Q31RM8） Phycobilisome rod-core linker polypeptide × 4 （Q31LK9） Allophycocyanin, beta subunit × 22 （Q31RG1） Allophycocyanin alpha chain × 20 （Q31RG0） Phycobiliprotein ApcE × 2 （Q31RF9） Allophycocyanin alpha-B chain × 2 （Q31RP7） PHYCOCYANOBILIN × 48	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	O50209_SYNE7
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–169； UniProt 1–169 作者链 q； PDB构建体 1–169； UniProt 1–169

Allophycocyanin alpha-B chain

物种未注明

UniProt Q31RP7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 58	Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core × 4 （Q31RG2） ApcG × 2 （Q31RM8） Phycobilisome rod-core linker polypeptide × 4 （Q31LK9） Allophycocyanin, beta subunit × 22 （Q31RG1） Allophycocyanin alpha chain × 20 （Q31RG0） Phycobiliprotein ApcE × 2 （Q31RF9） Allophycocyanin, beta subunit × 2 （O50209） PHYCOCYANOBILIN × 48	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q31RP7_SYNE7
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 t； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9x69
沉积日期 deposition_date	2025-10-15
最后修订 last_revision	2026-04-01
结构标题 title	The structure of phycobilisome with a bicylindrical core from the cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942
关键词 keywords	phycobilisome PBS, ELECTRON TRANSPORT; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9x69__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9x69__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9x69__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	69.16 Å
Rg（电子密度）	68.97 Å
总 Rg	69.09 Å
原子数	73424
残基数	9306
排除体积	1310800 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9x69__assembly_1__model_1`	58-meric （58）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core
分子量 formula_weight	7821.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	0,Y,Z,z
原子数 atom_count	73424

MRMFRITACLPSPSKIRTQRELQNTFFTKLVPYDAWFREQQRIQKLGGKIIKVELATGRPNTNTGLL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ApcG
分子量 formula_weight	11365.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1,b

MVLDKLFGKKEKFFLEIDSSAASTETAAVETAVTPVAAAVETPTAAAGVATPEPAATPAPEPVAEETPAKEIPNVTFAADLSVPTINTGRRLPGPSLDPFVQIASEVVRR

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Phycobilisome rod-core linker polypeptide
分子量 formula_weight	28372.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2,3,4,5

MALPLLNYAPTTQNSRVAGFEVPGDEQPKQYNTEDQYSPVQFDEVIQAAYRQIFFHAFKCDRQTVLESQLRNGQITVRDFIRGLLLSATFRSSFYDKNSNYRFVEQVVQRVLGRDVYGEREKIAWSLAVATQGYEGFIDTLLNSDEYLSNFGYDKVPYQRRRVLPGRALGETPFNIKSPRYDSYYRTILGFPKAVFAGGPGKRFPAQYLSAKAGDPGAYLALARSIGARGQALSASADIDYLSKVPYRKR

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Allophycocyanin, beta subunit
分子量 formula_weight	17408.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	22

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,F,K,L,M,O,T,V,X,a,c,d,g,l,m,n,p,u,w,y

MQDAITAVINASDVQGKYLDSSALDRLKSYFQSGELRVRAAATISANSALIVKEAVAKSLLYSDITRPGGNMYTTRRYAACIRDLEYYLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPIGATVQAIQAIKEVTASLVGPDAGREMGVYLDYISSGLS

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Allophycocyanin alpha chain
分子量 formula_weight	17439.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	20

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,G,H,I,J,Q,R,U,W,e,f,h,i,j,k,r,s,v,x

MSIVSKSIVNADAEARYLSPGELERIKTFVVGGDRRLRIAQTIAESRERIVKQAGNQLFQKRPDVVSPGGNAYGEDMTATCLRDLDYYLRLVTYGVVSGDITPIEEIGIVGVREMYKSLGTPIEAVAEGVRELKSAATALLTGEDADEAGAYFDYVIGALS

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Phycobiliprotein ApcE
分子量 formula_weight	78910.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N,o

MTVTASGGSSLARPQLYQTVPGSTIVQAEQQDRFPQQGELRELSSYFQSGLKRLAIAEIITRNSDTIVSRAANRIFVGGSPLAYIERPKVDPRNLRSAEEQRAREAKLGTVTFVESSGGGGFFSGLTAALGGAGAVRIPSGFRPINVARYGPRNMQKSLRDMSWFLRYITYAIVAGDPNILVVNVRGLREIIEKACSTPATLVALQDMRATSAGYFRNDPEAQQLVKDYFDVLIREFEAPTPSLKQRQRFAEDQQGLALPQSYANAAERRPKFVIKSTLSTVEKNEAIKAAYRQVFERDITRAYSQKVSDLESKVKNGEISTKEFIRRLGKSPLYRQQFHDRFVNSRVIELAFRHFLGRGISSAEEFTRYFDLLSAKGFAALIDALVDSQEYADYFGEETVPYLRGLGQEAQECRNWGVQQELFKYSAPFVKVPQFVTLFGEYKQPLLDQHPYGAGNDPLEIQFGAIFPSRTVNNRTNPAPFGKDTRRLLVSKGGVNNQVGSAAFQQSGTTPTKIFKLTQVAAGSSSIRSKSVGNPSIRQTESTTQAVIRAAYRQVFGRDLYEGQRLTVPEIKLENGEITVREFVRQIAKSETFRKLYWNNLYVVKAVEYIHRRLLGRPTTGRAEINAYFDISAKKGFYALVDAILDSPEYIAAFGEDTVPYERYITPKGLALRSVRGLEASEKVKASLRPAAGAQERRPEVGRR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Allophycocyanin, beta subunit
分子量 formula_weight	18590.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,q

MRDAVSSLIAGYDLAGKYLDRNAVDSLRAYFAEGNARVQAAEIINANAASLVRDASAQLFEEVPELLRPGGNAYTTRRYSACLRDLDYYLRYATYALVAGNTEVLDERVLQGLRETYTSLGVPSGPTVRGIAILRDRVRQLVEQAGISNAAFVEVPFDHLGRNLAEQDI

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Allophycocyanin alpha-B chain
分子量 formula_weight	18149.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S,t

MTIVSQVILKADDELRYPSGGELKNITDFFKTGEQRLRIAQVLSDSEKKIVDQASRKLWQRRPDFIAPGGNAYGQRQRAQCLRDYGWYLRLITYGVLAGDKEPIESIGLLGAREMYNSLGVPLPGMAEAIRTLKEASLALLSSADATVAAPYFDFLIQGMETI

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	PHYCOCYANOBILIN
分子量 formula_weight	588.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	48

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	258722

The structure of phycobilisome with a bicylindrical core from the cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phycobilisome 7.8 kDa linker polypeptide, allophycocyanin-associated, core

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ApcG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Phycobilisome rod-core linker polypeptide

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Allophycocyanin, beta subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Allophycocyanin alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Phycobiliprotein ApcE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Allophycocyanin, beta subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Allophycocyanin alpha-B chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9x69__assembly_1__model_1

9x69__assembly_1__model_1 | I(q)

9x69__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer