9yoq

Core module of ctSAGA

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Non-specific serine/threonine protein kinase

物种未注明

UniProt G0S842

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 (G0RYM2) Uncharacterized protein × 1 (G0S660) Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 (G0SH10) Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 (G0S770) Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 (G0RYR4) Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 (G0SED0) Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 (G0S2A1) Putative transcriptional activator protein × 1 SCA7 domain-containing protein × 1 (G0S6A1) Putative transcription initiation factor × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 G0S842_CHATD
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–3893; UniProt 1–3893

Spt20-like SEP domain-containing protein

物种未注明

UniProt G0RYM2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 (G0S842) Uncharacterized protein × 1 (G0S660) Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 (G0SH10) Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 (G0S770) Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 (G0RYR4) Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 (G0SED0) Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 (G0S2A1) Putative transcriptional activator protein × 1 SCA7 domain-containing protein × 1 (G0S6A1) Putative transcription initiation factor × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 G0RYM2_CHATD
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–1192; UniProt 1–1192

Uncharacterized protein

物种未注明

UniProt G0S660

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 (G0S842) Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 (G0RYM2) Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 (G0SH10) Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 (G0S770) Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 (G0RYR4) Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 (G0SED0) Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 (G0S2A1) Putative transcriptional activator protein × 1 SCA7 domain-containing protein × 1 (G0S6A1) Putative transcription initiation factor × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 G0S660_CHATD
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–433; UniProt 1–433

Transcription initiation factor TFIID subunit 5

物种未注明

UniProt G0SH10

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 (G0S842) Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 (G0RYM2) Uncharacterized protein × 1 (G0S660) Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 (G0S770) Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 (G0RYR4) Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 (G0SED0) Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 (G0S2A1) Putative transcriptional activator protein × 1 SCA7 domain-containing protein × 1 (G0S6A1) Putative transcription initiation factor × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 G0SH10_CHATD
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–767; UniProt 1–767

Transcription initiation factor TFIID subunit 6

物种未注明

UniProt G0S770

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 (G0S842) Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 (G0RYM2) Uncharacterized protein × 1 (G0S660) Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 (G0SH10) Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 (G0RYR4) Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 (G0SED0) Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 (G0S2A1) Putative transcriptional activator protein × 1 SCA7 domain-containing protein × 1 (G0S6A1) Putative transcription initiation factor × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 G0S770_CHATD
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–480; UniProt 1–480

Transcription initiation factor TFIID subunit 10

物种未注明

UniProt G0RYR4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 (G0S842) Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 (G0RYM2) Uncharacterized protein × 1 (G0S660) Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 (G0SH10) Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 (G0S770) Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 (G0SED0) Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 (G0S2A1) Putative transcriptional activator protein × 1 SCA7 domain-containing protein × 1 (G0S6A1) Putative transcription initiation factor × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 G0RYR4_CHATD
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–204; UniProt 1–204

Putative transcriptional coactivator HFI1 protein

物种未注明

UniProt G0SED0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 (G0S842) Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 (G0RYM2) Uncharacterized protein × 1 (G0S660) Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 (G0SH10) Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 (G0S770) Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 (G0RYR4) Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 (G0S2A1) Putative transcriptional activator protein × 1 SCA7 domain-containing protein × 1 (G0S6A1) Putative transcription initiation factor × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 G0SED0_CHATD
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–485; UniProt 1–485

Transcription initiation factor TFIID subunit 12

物种未注明

UniProt G0S2A1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 (G0S842) Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 (G0RYM2) Uncharacterized protein × 1 (G0S660) Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 (G0SH10) Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 (G0S770) Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 (G0RYR4) Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 (G0SED0) Putative transcriptional activator protein × 1 SCA7 domain-containing protein × 1 (G0S6A1) Putative transcription initiation factor × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 G0S2A1_CHATD
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–770; UniProt 1–770

SCA7 domain-containing protein

物种未注明

UniProt G0S6A1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 (G0S842) Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 (G0RYM2) Uncharacterized protein × 1 (G0S660) Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 (G0SH10) Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 (G0S770) Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 (G0RYR4) Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 (G0SED0) Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 (G0S2A1) Putative transcriptional activator protein × 1 Putative transcription initiation factor × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 G0S6A1_CHATD
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–1273; UniProt 1–1273

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9yoq
沉积日期 deposition_date2025-10-13
结构标题 titleCore module of ctSAGA
关键词 keywordsctSAGA complex, Histone Acetyl Transferase (HAT) Module, Tra1 module and Core module, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9yoq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9yoq__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9yoq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)49.69 Å
Rg(电子密度)49.54 Å
总 Rg49.66 Å
原子数41791
残基数2656
排除体积375790 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9yoq__assembly_1__model_1 undecameric (11) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

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7. 引用文献 (1)