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9yx1

Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 213.8 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Propionyl-CoA carboxylase beta chain

物种未注明

UniProt A0R616

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric（20） 与蛋白拷贝数一致 链 F； UniProt 1–517 链 O； UniProt 1–517 未记录 Propionyl-CoA carboxylase beta chain × 4 （A0QTE7） Biotin-dependent acyl-coenzyme A carboxylase alpha3 subunit × 12 （A0QTE1） Acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase AccE5 × 2 （A0QTE6） BTN BIOTIN × 6 BCT BICARBONATE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9YX1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
9T97 cryo-EM structure of AccA3/AccD4/AccD5/AccE5 complex from Mycobacterium smegmatis 提交 2025-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric
链 D4a 1–517（517 aa）
链 D4b 1–517（517 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å
9TDM Cryo-EM structure of AccA3/AccD4/AccD5/AccE5 in complex with Propionyl-CoA 提交 2025-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 D4a 1–517（517 aa）
链 D4b 1–517（517 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å
9YX2 Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis with ATP, bicarbonate, and propionyl-CoA 提交 2025-10-26 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric
链 F 1–517（517 aa）
链 O 1–517（517 aa）
未记录 BTN BIOTIN × 6 BCT BICARBONATE ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 1VU propionyl Coenzyme A × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9YX4 Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis with ATP, bicarbonate, arachidoyl-CoA, and propionyl-CoA 提交 2025-10-26 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric
链 F 1–517（517 aa）
链 O 1–517（517 aa）
未记录 BTN BIOTIN × 6 BCT BICARBONATE ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 A1CZD S-{(3S,5S,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)oxolan-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-3,5,10,14-tetraoxo-2,4,6-trioxa-11,15-diaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaheptadecan-17-yl} (11E,14E,16E)-icosa-11,14,16-trienethioate (non-preferred name) × 2 1VU propionyl Coenzyme A × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
9YX5 Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis with MSMEG_0435-MSMEG_0436 bound 提交 2025-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：26-meric
链 F 1–517（517 aa）
链 O 1–517（517 aa）
未记录 A1CZD S-{(3S,5S,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)oxolan-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-3,5,10,14-tetraoxo-2,4,6-trioxa-11,15-diaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaheptadecan-17-yl} (11E,14E,16E)-icosa-11,14,16-trienethioate (non-preferred name) × 2 1VU propionyl Coenzyme A × 4 BTN BIOTIN × 5 BCT BICARBONATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0R616_MYCS2
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–517； UniProt 1–517 作者链 O； PDB构建体 1–517； UniProt 1–517

Propionyl-CoA carboxylase beta chain

物种未注明

UniProt A0QTE7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric（20） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 1–542 链 H； UniProt 1–542 链 M； UniProt 1–542 链 N； UniProt 1–542 未记录 Propionyl-CoA carboxylase beta chain × 2 （A0R616） Biotin-dependent acyl-coenzyme A carboxylase alpha3 subunit × 12 （A0QTE1） Acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase AccE5 × 2 （A0QTE6） BTN BIOTIN × 6 BCT BICARBONATE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9YX1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
9T97 cryo-EM structure of AccA3/AccD4/AccD5/AccE5 complex from Mycobacterium smegmatis 提交 2025-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric
链 D5a 1–542（542 aa）
链 D5b 1–542（542 aa）
链 D5c 1–542（542 aa）
链 D5d 1–542（542 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å
9TDM Cryo-EM structure of AccA3/AccD4/AccD5/AccE5 in complex with Propionyl-CoA 提交 2025-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 D5a 1–542（542 aa）
链 D5b 1–542（542 aa）
链 D5c 1–542（542 aa）
链 D5d 1–542（542 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å
9YX2 Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis with ATP, bicarbonate, and propionyl-CoA 提交 2025-10-26 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric
链 G 1–542（542 aa）
链 H 1–542（542 aa）
链 M 1–542（542 aa）
链 N 1–542（542 aa）
未记录 BTN BIOTIN × 6 BCT BICARBONATE ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 1VU propionyl Coenzyme A × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9YX4 Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis with ATP, bicarbonate, arachidoyl-CoA, and propionyl-CoA 提交 2025-10-26 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric
链 G 1–542（542 aa）
链 H 1–542（542 aa）
链 M 1–542（542 aa）
链 N 1–542（542 aa）
未记录 BTN BIOTIN × 6 BCT BICARBONATE ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 A1CZD S-{(3S,5S,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)oxolan-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-3,5,10,14-tetraoxo-2,4,6-trioxa-11,15-diaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaheptadecan-17-yl} (11E,14E,16E)-icosa-11,14,16-trienethioate (non-preferred name) × 2 1VU propionyl Coenzyme A × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
9YX5 Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis with MSMEG_0435-MSMEG_0436 bound 提交 2025-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：26-meric
链 G 1–542（542 aa）
链 H 1–542（542 aa）
链 M 1–542（542 aa）
链 N 1–542（542 aa）
未记录 A1CZD S-{(3S,5S,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)oxolan-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-3,5,10,14-tetraoxo-2,4,6-trioxa-11,15-diaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaheptadecan-17-yl} (11E,14E,16E)-icosa-11,14,16-trienethioate (non-preferred name) × 2 1VU propionyl Coenzyme A × 4 BTN BIOTIN × 5 BCT BICARBONATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0QTE7_MYCS2
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–542； UniProt 1–542 作者链 H； PDB构建体 1–542； UniProt 1–542 作者链 M； PDB构建体 1–542； UniProt 1–542 作者链 N； PDB构建体 1–542； UniProt 1–542

Biotin-dependent acyl-coenzyme A carboxylase alpha3 subunit

物种未注明

UniProt A0QTE1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric（20） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–598 链 B； UniProt 1–598 链 C； UniProt 1–598 链 D； UniProt 1–598 链 I； UniProt 1–598 链 J； UniProt 1–598 链 K； UniProt 1–598 链 L； UniProt 1–598 链 Q； UniProt 1–598 链 R； UniProt 1–598 链 S； UniProt 1–598 链 T； UniProt 1–598 未记录 Propionyl-CoA carboxylase beta chain × 2 （A0R616） Propionyl-CoA carboxylase beta chain × 4 （A0QTE7） Acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase AccE5 × 2 （A0QTE6） BTN BIOTIN × 6 BCT BICARBONATE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9YX1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
30HU cryo-EM structure of AccA3-AccE5 complex in the presence of Arachidyl-CoA 提交 2026-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A3a 1–598（598 aa）
链 A3b 1–598（598 aa）
链 A3c 1–598（598 aa）
链 A3d 1–598（598 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å
9T97 cryo-EM structure of AccA3/AccD4/AccD5/AccE5 complex from Mycobacterium smegmatis 提交 2025-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric
链 A3a 1–598（598 aa）
链 A3b 1–598（598 aa）
链 A3c 1–598（598 aa）
链 A3d 1–598（598 aa）
链 A3f 1–598（598 aa）
链 A3g 1–598（598 aa）
链 A3i 1–598（598 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å
9TDM Cryo-EM structure of AccA3/AccD4/AccD5/AccE5 in complex with Propionyl-CoA 提交 2025-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 A3a 1–598（598 aa）
链 A3b 1–598（598 aa）
链 A3c 1–598（598 aa）
链 A3d 1–598（598 aa）
链 A3e 1–598（598 aa）
链 A3f 1–598（598 aa）
链 A3g 1–598（598 aa）
链 A3h 1–598（598 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å
9YX2 Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis with ATP, bicarbonate, and propionyl-CoA 提交 2025-10-26 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric
链 A 1–598（598 aa）
链 B 1–598（598 aa）
链 C 1–598（598 aa）
链 D 1–598（598 aa）
链 I 1–598（598 aa）
链 J 1–598（598 aa）
链 K 1–598（598 aa）
链 L 1–598（598 aa）
链 Q 1–598（598 aa）
链 R 1–598（598 aa）
链 S 1–598（598 aa）
链 T 1–598（598 aa）
未记录 BTN BIOTIN × 6 BCT BICARBONATE ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 1VU propionyl Coenzyme A × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9YX4 Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis with ATP, bicarbonate, arachidoyl-CoA, and propionyl-CoA 提交 2025-10-26 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric
链 A 1–598（598 aa）
链 B 1–598（598 aa）
链 C 1–598（598 aa）
链 D 1–598（598 aa）
链 I 1–598（598 aa）
链 J 1–598（598 aa）
链 K 1–598（598 aa）
链 L 1–598（598 aa）
链 Q 1–598（598 aa）
链 R 1–598（598 aa）
链 S 1–598（598 aa）
链 T 1–598（598 aa）
未记录 BTN BIOTIN × 6 BCT BICARBONATE ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 A1CZD S-{(3S,5S,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)oxolan-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-3,5,10,14-tetraoxo-2,4,6-trioxa-11,15-diaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaheptadecan-17-yl} (11E,14E,16E)-icosa-11,14,16-trienethioate (non-preferred name) × 2 1VU propionyl Coenzyme A × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
9YX5 Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis with MSMEG_0435-MSMEG_0436 bound 提交 2025-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：26-meric
链 A 1–598（598 aa）
链 B 1–598（598 aa）
链 C 1–598（598 aa）
链 D 1–598（598 aa）
链 I 1–598（598 aa）
链 J 1–598（598 aa）
链 K 1–598（598 aa）
链 L 1–598（598 aa）
链 Q 1–598（598 aa）
链 R 1–598（598 aa）
链 S 1–598（598 aa）
链 T 1–598（598 aa）
链 U 1–598（598 aa）
链 X 1–598（598 aa）
未记录 A1CZD S-{(3S,5S,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)oxolan-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-3,5,10,14-tetraoxo-2,4,6-trioxa-11,15-diaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaheptadecan-17-yl} (11E,14E,16E)-icosa-11,14,16-trienethioate (non-preferred name) × 2 1VU propionyl Coenzyme A × 4 BTN BIOTIN × 5 BCT BICARBONATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0QTE1_MYCS2
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598 作者链 B； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598 作者链 C； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598 作者链 D； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598 作者链 I； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598 作者链 J； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598 作者链 K； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598 作者链 L； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598 作者链 Q； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598 作者链 R； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598 作者链 S； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598 作者链 T； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598

Acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase AccE5

物种未注明

UniProt A0QTE6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric（20） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 1–94 链 P； UniProt 1–94 未记录 Propionyl-CoA carboxylase beta chain × 2 （A0R616） Propionyl-CoA carboxylase beta chain × 4 （A0QTE7） Biotin-dependent acyl-coenzyme A carboxylase alpha3 subunit × 12 （A0QTE1） BTN BIOTIN × 6 BCT BICARBONATE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9YX1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
30HU cryo-EM structure of AccA3-AccE5 complex in the presence of Arachidyl-CoA 提交 2026-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E5a 1–94（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å
9T97 cryo-EM structure of AccA3/AccD4/AccD5/AccE5 complex from Mycobacterium smegmatis 提交 2025-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric
链 E5a 1–94（94 aa）
链 E5b 1–94（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å
9TDM Cryo-EM structure of AccA3/AccD4/AccD5/AccE5 in complex with Propionyl-CoA 提交 2025-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 E5a 1–94（94 aa）
链 E5b 1–94（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å
9YX2 Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis with ATP, bicarbonate, and propionyl-CoA 提交 2025-10-26 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric
链 E 1–94（94 aa）
链 P 1–94（94 aa）
未记录 BTN BIOTIN × 6 BCT BICARBONATE ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 1VU propionyl Coenzyme A × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9YX4 Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis with ATP, bicarbonate, arachidoyl-CoA, and propionyl-CoA 提交 2025-10-26 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric
链 E 1–94（94 aa）
链 P 1–94（94 aa）
未记录 BTN BIOTIN × 6 BCT BICARBONATE ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 A1CZD S-{(3S,5S,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)oxolan-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-3,5,10,14-tetraoxo-2,4,6-trioxa-11,15-diaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaheptadecan-17-yl} (11E,14E,16E)-icosa-11,14,16-trienethioate (non-preferred name) × 2 1VU propionyl Coenzyme A × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
9YX5 Structure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis with MSMEG_0435-MSMEG_0436 bound 提交 2025-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：26-meric
链 E 1–94（94 aa）
链 P 1–94（94 aa）
未记录 A1CZD S-{(3S,5S,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)oxolan-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-3,5,10,14-tetraoxo-2,4,6-trioxa-11,15-diaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaheptadecan-17-yl} (11E,14E,16E)-icosa-11,14,16-trienethioate (non-preferred name) × 2 1VU propionyl Coenzyme A × 4 BTN BIOTIN × 5 BCT BICARBONATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0QTE6_MYCS2
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 P； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9yx1

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9yx1
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9yx1
沉积日期 deposition_date2025-10-26
结构标题 titleStructure of the long chain acyl-CoA carboxylase complex from Mycobacterium smegmatis
关键词 keywordsCarboxylase, transferase, lipid synthesis, mycolic acid synthesis, LIGASE; LIGASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier68.45 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron68.09 Å
零角强度 I(0) i06593550000.00
分子量 molecular_weight689660.0 kDa
排除体积 excluded_volume864790 ų
包络体积 envelope_volume1327000 ų
水化壳体积 shell_volume164290 ų
包络直径 envelope_diameter240.3 Å
壳层 Rg shell_rg67.03 Å
包络 Rg envelope_rg68.00 Å
形状 Rg shape_rg68.19 Å
总 Rg total_rg67.73 Å
总原子数 total_atoms48731
残基数 n_residues7040
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax213.8 Å
Rg (实空间) rg_real68.50 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.43 Å
I(0) (实空间) i0_real6.5900e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.3150e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal67.98 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal6586000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8273
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary83.7 Å
偏度 Skewness skewness0.501
峰度 Kurtosis kurtosis0.017
角度范围 angular_range— – 0.1150 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0007
最高正则化参数 α highest_alpha445000000.0000
实空间数据点数 n_real_points24
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.848; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.214
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)