当前蛋白身份：A0A0A0GPI6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6Z9Q Transcription termination intermediate complex 2 提交 2020-06-04 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致 |
链 a
25–443（419 aa）
链 b
25–443（419 aa）
链 c
25–443（419 aa）
链 d
25–443（419 aa）
链 e
25–443（419 aa）
链 f
25–443（419 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.70 Å |
| 6Z9S Transcription termination intermediate complex 4 提交 2020-06-04 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 a
25–443（419 aa）
链 b
25–443（419 aa）
链 c
25–443（419 aa）
链 d
25–443（419 aa）
链 e
25–443（419 aa）
链 f
25–443（419 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7ADB Transcription termination intermediate complex 1 delta NusG 提交 2020-09-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 a
25–443（419 aa）
链 b
25–443（419 aa）
链 c
25–443（419 aa）
链 d
25–443（419 aa）
链 e
25–443（419 aa）
链 f
25–443（419 aa）
|
未记录 | BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7ADC Transcription termination intermediate complex 3 delta NusG 提交 2020-09-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 a
25–443（419 aa）
链 b
25–443（419 aa）
链 c
25–443（419 aa）
链 d
25–443（419 aa）
链 e
25–443（419 aa）
链 f
25–443（419 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7ADD Transcription termination intermediate complex IIIa 提交 2020-09-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 a
25–443（419 aa）
链 b
25–443（419 aa）
链 c
25–443（419 aa）
链 d
25–443（419 aa）
链 e
25–443（419 aa）
链 f
25–443（419 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7ADE Transcription termination complex IVa 提交 2020-09-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 a
25–443（419 aa）
链 b
25–443（419 aa）
链 c
25–443（419 aa）
链 d
25–443（419 aa）
链 e
25–443（419 aa）
链 f
25–443（419 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8E3H Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 18 nt long RNA spacer, Mg-ADP-BeF3, and NusG; Rho hexamer part 提交 2022-08-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 a
25–443（419 aa）
链 b
25–443（419 aa）
链 c
25–443（419 aa）
链 d
25–443（419 aa）
链 e
25–443（419 aa）
链 f
25–443（419 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 8E5L Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 21 nt long RNA spacer, Mg-ADP-BeF3, and NusG; Rho hexamer part 提交 2022-08-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 a
25–443（419 aa）
链 b
25–443（419 aa）
链 c
25–443（419 aa）
链 d
25–443（419 aa）
链 e
25–443（419 aa）
链 f
25–443（419 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8E5P Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 24 nt long RNA spacer, Mg-ADP-BeF3, and NusG; Rho hexamer part 提交 2022-08-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 a
25–443（419 aa）
链 b
25–443（419 aa）
链 c
25–443（419 aa）
链 d
25–443（419 aa）
链 e
25–443（419 aa）
链 f
25–443（419 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8E6W Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 18 nt long RNA spacer, lambda-tR1 rut RNA, Mg-ADP-BeF3, and NusG; Rho part 提交 2022-08-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 a
25–443（419 aa）
链 b
25–443（419 aa）
链 c
25–443（419 aa）
链 d
25–443（419 aa）
链 e
25–443（419 aa）
链 f
25–443（419 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.27 Å |
| 8E70 Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 18 nt long RNA spacer, dC75 rut mimic RNA, Mg-ADP-BeF3, and NusG; Rho hexamer part 提交 2022-08-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 a
25–443（419 aa）
链 b
25–443（419 aa）
链 c
25–443（419 aa）
链 d
25–443（419 aa）
链 e
25–443（419 aa）
链 f
25–443（419 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8PEU Rho-ATPgS-Psu complex III 提交 2023-06-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
25–443（419 aa）
链 B
25–443（419 aa）
链 C
25–443（419 aa）
链 D
25–443（419 aa）
链 E
25–443（419 aa）
链 F
25–443（419 aa）
链 I
25–443（419 aa）
链 J
25–443（419 aa）
链 K
25–443（419 aa）
链 L
25–443（419 aa）
链 M
25–443（419 aa）
链 N
25–443（419 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.70 Å |
| 8PEW Rho-ATPgS-Psu complex III expanded 提交 2023-06-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric（34） 与蛋白数一致 |
链 A
25–443（419 aa）
链 B
25–443（419 aa）
链 C
25–443（419 aa）
链 D
25–443（419 aa）
链 E
25–443（419 aa）
链 F
25–443（419 aa）
链 G
25–443（419 aa）
链 H
25–443（419 aa）
链 I
25–443（419 aa）
链 J
25–443（419 aa）
链 K
25–443（419 aa）
链 L
25–443（419 aa）
链 M
25–443（419 aa）
链 N
25–443（419 aa）
链 O
25–443（419 aa）
链 P
25–443（419 aa）
链 X
25–443（419 aa）
链 Y
25–443（419 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 16 MG MAGNESIUM ION × 16 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 4.30 Å |
| 8Q3N Bacterial transcription termination factor Rho + ADP 提交 2023-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–443（419 aa）
链 B
25–443（419 aa）
链 C
25–443（419 aa）
链 D
25–443（419 aa）
链 E
25–443（419 aa）
链 F
25–443（419 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å |
| 8Q3O Bacterial transcription termination factor Rho + pppGpp 提交 2023-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–443（419 aa）
链 B
25–443（419 aa）
链 C
25–443（419 aa）
链 D
25–443（419 aa）
链 E
25–443（419 aa）
链 F
25–443（419 aa）
|
未记录 | 0O2 guanosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) 3'-(trihydrogen diphosphate) × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |