当前蛋白身份：A0A0F7LMQ4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7NYW Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA head module 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–440（440 aa）
链 D
1–440（440 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7NYX Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA monomer (closed conformation) 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–440（440 aa）
链 D
1–440（440 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 7NYY Cryo-EM structure of the MukBEF monomer 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–440（440 aa）
链 D
1–440（440 aa）
|
未记录 | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.80 Å |
| 7NYZ Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA monomer (partially open conformation) 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–440（440 aa）
链 D
1–440（440 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 7NZ0 Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA monomer (open conformation) 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–440（440 aa）
链 D
1–440（440 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.30 Å |
| 7NZ2 Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA tetrad 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：44-meric（44） 与全部聚合物一致 |
链 C1
1–440（440 aa）
链 C2
1–440（440 aa）
链 D1
1–440（440 aa）
链 D2
1–440（440 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 11.00 Å |
| 7NZ3 Cryo-EM structure of apposed MukBEF-MatP monomers on DNA 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 C1
1–440（440 aa）
链 C2
1–440（440 aa）
链 D1
1–440（440 aa）
链 D2
1–440（440 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 11.00 Å |
| 7NZ4 Cryo-EM structure of the MukBEF dimer 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 C1
1–440（440 aa）
链 D1
1–440（440 aa）
|
未记录 | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 13.00 Å |
| 9GM6 MukBEF in a nucleotide-bound state with open neck gate (heads core) 提交 2024-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 C
1–440（440 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.70 Å |
| 9GM7 MukBEF in a nucleotide-bound state with open neck gate (monomer) 提交 2024-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–440（440 aa）
链 D
1–440（440 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 4.30 Å |
| 9GM8 MukBEF in a nucleotide-bound state with open neck gate 提交 2024-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–440（440 aa）
链 D
1–440（440 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.90 Å |
| 9GM9 MukBEF in a DNA capture state 提交 2024-08-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric（11） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–440（440 aa）
链 D
1–440（440 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 7.80 Å |
| 9GMA MukBEF in a DNA capture state (dimer) 提交 2024-08-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–440（440 aa）
链 D
1–440（440 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 9.10 Å |