当前蛋白身份:A0A5F9D2E6 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:83-meric(83) 与全部聚合物一致
链 YY 1–133(133 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 33 PDB 声明:35-meric(35) 与全部聚合物一致
链 Y 1–133(133 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 NN 1–133(133 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致
链 NN 1–133(133 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 NN 1–133(133 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:88-meric(88) 与全部聚合物一致
链 j1 1–133(133 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 76 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 YY 1–130(130 aa)
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 76 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 YY 1–130(130 aa)
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å