当前蛋白身份:A0A6A5PTH4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3D29 Proteasome Inhibition by Fellutamide B 提交 2008-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 34 PDB 声明:34-meric(34) 与蛋白数一致 |
链 E
2–234(233 aa)
链 S
2–234(233 aa)
|
未记录 | HXD (3R)-3-HYDROXYDODECANOIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;10 % MPD; 0,1 M MES, 30 mM MgAc2, pH 6,8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.266 |
| 7O2L Yeast 20S proteasome in complex with the covalently bound inhibitor b-lactone (2R,3S)-3-isopropyl-4-oxo-2-oxetane-carboxylate (IOC) 提交 2021-03-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白数一致 |
链 E
1–234(234 aa)
链 S
1–234(234 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 V08 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;293 K;20 mM MgAC2, 13% MPD, 0.1 M MES
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.216 |
| 7QO6 26S proteasome Rpt1-RK -Ubp6-UbVS complex in the s2 state 提交 2021-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:49-meric(49) 与蛋白数一致 |
链 F
1–234(234 aa)
链 f
1–234(234 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 6.30 Å |
| 9AW7 Yeast 20S proteasome soaked with isolated TMC-95B 提交 2024-03-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白数一致 |
链 E
1–234(234 aa)
链 S
1–234(234 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 85 MG MAGNESIUM ION × 12 A1AHA TMC-95B × 6 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 ACY ACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;MES 100 mM pH 5.5-6.9, MPD 8-18% and magnesium acetate 20 mM
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.232 |
| 9C97 Yeast 20S proteasome soaked with BRA-346 fraction 提交 2024-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白数一致 |
链 E
1–234(234 aa)
链 S
1–234(234 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 44 MG MAGNESIUM ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;291 K;MES 100 mM pH 6.9, MPD 25% and magnesium acetate 20 mM
|
分辨率 3.33 Å R-free 0.252 |