当前蛋白身份:A0A6D2XA84 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7NYW Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA head module 提交 2021-03-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 G 1–78(78 aa)
链 H 1–78(78 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7NYX Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA monomer (closed conformation) 提交 2021-03-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 G 1–78(78 aa)
链 H 1–78(78 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
7NYY Cryo-EM structure of the MukBEF monomer 提交 2021-03-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 1–78(78 aa)
链 H 1–78(78 aa)
未记录 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
7NYZ Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA monomer (partially open conformation) 提交 2021-03-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 G 1–78(78 aa)
链 H 1–78(78 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
7NZ0 Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA monomer (open conformation) 提交 2021-03-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 G 1–78(78 aa)
链 H 1–78(78 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.30 Å
7NZ2 Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA tetrad 提交 2021-03-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:44-meric(44) 与全部聚合物一致
链 G1 1–78(78 aa)
链 G2 1–78(78 aa)
链 G3 1–78(78 aa)
链 G4 1–78(78 aa)
链 H1 1–78(78 aa)
链 H2 1–78(78 aa)
链 H3 1–78(78 aa)
链 H4 1–78(78 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.00 Å
7NZ3 Cryo-EM structure of apposed MukBEF-MatP monomers on DNA 提交 2021-03-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:24-meric(24) 与全部聚合物一致
链 G1 1–78(78 aa)
链 G2 1–78(78 aa)
链 H1 1–78(78 aa)
链 H2 1–78(78 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.00 Å
7NZ4 Cryo-EM structure of the MukBEF dimer 提交 2021-03-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致
链 G1 1–78(78 aa)
链 G2 1–78(78 aa)
链 H1 1–78(78 aa)
链 H2 1–78(78 aa)
未记录 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 13.00 Å