当前蛋白身份:A0A6L0YA22 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3D29 Proteasome Inhibition by Fellutamide B 提交 2008-05-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 34 PDB 声明:34-meric(34) 与蛋白数一致
链 I 2–205(204 aa)
链 W 2–205(204 aa)
未记录 HXD (3R)-3-HYDROXYDODECANOIC ACID × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;10 % MPD; 0,1 M MES, 30 mM MgAc2, pH 6,8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.266
7O2L Yeast 20S proteasome in complex with the covalently bound inhibitor b-lactone (2R,3S)-3-isopropyl-4-oxo-2-oxetane-carboxylate (IOC) 提交 2021-03-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白数一致
链 I 1–205(205 aa)
链 W 1–205(205 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 V08 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;293 K;20 mM MgAC2, 13% MPD, 0.1 M MES
分辨率 3.00 Å R-free 0.216
7QO6 26S proteasome Rpt1-RK -Ubp6-UbVS complex in the s2 state 提交 2021-12-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:49-meric(49) 与蛋白数一致
链 3 1–205(205 aa)
链 j 1–205(205 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.30 Å
9AW7 Yeast 20S proteasome soaked with isolated TMC-95B 提交 2024-03-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白数一致
链 I 1–205(205 aa)
链 W 1–205(205 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 85 MG MAGNESIUM ION × 12 A1AHA TMC-95B × 6 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;MES 100 mM pH 5.5-6.9, MPD 8-18% and magnesium acetate 20 mM
分辨率 2.91 Å R-free 0.232
9C97 Yeast 20S proteasome soaked with BRA-346 fraction 提交 2024-06-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白数一致
链 I 1–205(205 aa)
链 W 1–205(205 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 44 MG MAGNESIUM ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;291 K;MES 100 mM pH 6.9, MPD 25% and magnesium acetate 20 mM
分辨率 3.33 Å R-free 0.252