当前蛋白身份:A0A8C6VAB1 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8J9B LnaB-actin binary complex 提交 2023-05-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:20-meric(20) 与蛋白数一致
链 A 1–375(375 aa)
链 B 1–375(375 aa)
链 C 1–375(375 aa)
链 D 1–375(375 aa)
链 E 1–375(375 aa)
链 F 1–375(375 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;289 K;PEG4000,Sodium HEPES,Ammonnium sulfate
分辨率 3.42 Å R-free 0.298
8K6E LnaB-Actin-PRUb ternary complex 提交 2023-07-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–375(375 aa)
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;289 K;PEG 8000; Sodium chloride; Sodium HEPES
分辨率 2.74 Å R-free 0.245
8K6F LnaB-Actin-PRUb ternary complex 提交 2023-07-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–375(375 aa)
链 B 1–375(375 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;289 K;PEG8000, Sodium Choride, Sodium HEPES
分辨率 3.41 Å R-free 0.243
8K6I LnaB-Actin-PRUb ternary complex 提交 2023-07-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–375(375 aa)
链 B 1–375(375 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;289 K;Sodium Chloride, PEG8000, HEPES
分辨率 3.19 Å R-free 0.315
8K6R LnaB-Actin-PRUb ternary complex in the presence of AMPPNP 提交 2023-07-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1–375(375 aa)
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;289 K;Sodium Chloride, Sodium HEPES, PEG8000
分辨率 2.76 Å R-free 0.261
8K6V LnaB-Actin-PRUb ternary complex 提交 2023-07-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–375(375 aa)
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;289 K;Magnesium acetate, MOPS, PEG8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.307