当前蛋白身份:A0A8J0PCL3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8BD4 TniQ-capped Tns-ATP-dsDNA complex 提交 2022-10-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–276(276 aa)
链 B
1–276(276 aa)
链 C
1–276(276 aa)
链 D
1–276(276 aa)
链 E
1–276(276 aa)
链 F
1–276(276 aa)
链 G
1–276(276 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.44 Å |
| 8BD5 Cas12k-sgRNA-dsDNA-S15-TniQ-TnsC transposon recruitment complex 提交 2022-10-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致 |
链 E
1–276(276 aa)
链 F
1–276(276 aa)
链 G
1–276(276 aa)
链 H
1–276(276 aa)
链 I
1–276(276 aa)
链 J
1–276(276 aa)
链 K
1–276(276 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8BD6 Cas12k-sgRNA-dsDNA-TnsC non-productive complex. 提交 2022-10-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致 |
链 R
1–276(276 aa)
链 S
1–276(276 aa)
链 T
1–276(276 aa)
链 U
1–276(276 aa)
链 V
1–276(276 aa)
链 W
1–276(276 aa)
链 X
1–276(276 aa)
链 Y
1–276(276 aa)
链 Z
1–276(276 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8EA3 V-K CAST Transpososome from Scytonema hofmanni, major configuration 提交 2022-08-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–276(276 aa)
链 B
1–276(276 aa)
链 C
1–276(276 aa)
链 D
1–276(276 aa)
链 E
1–276(276 aa)
链 F
1–276(276 aa)
链 G
1–276(276 aa)
链 H
1–276(276 aa)
链 I
1–276(276 aa)
链 J
1–276(276 aa)
链 K
1–276(276 aa)
链 L
1–276(276 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8EA4 V-K CAST Transpososome from Scytonema hofmanni, minor configuration 提交 2022-08-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:31-meric(31) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–276(276 aa)
链 B
1–276(276 aa)
链 C
1–276(276 aa)
链 D
1–276(276 aa)
链 E
1–276(276 aa)
链 F
1–276(276 aa)
链 G
1–276(276 aa)
链 H
1–276(276 aa)
链 I
1–276(276 aa)
链 J
1–276(276 aa)
链 K
1–276(276 aa)
链 L
1–276(276 aa)
链 M
1–276(276 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 15 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 13 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8RDU Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K composite map 提交 2023-12-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 25 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物一致 |
链 D
2–276(275 aa)
链 E
2–276(275 aa)
链 F
2–276(275 aa)
链 G
2–276(275 aa)
链 H
2–276(275 aa)
链 I
2–276(275 aa)
链 J
2–276(275 aa)
链 K
2–276(275 aa)
链 L
2–276(275 aa)
链 M
2–276(275 aa)
链 N
2–276(275 aa)
链 O
2–276(275 aa)
链 P
2–276(275 aa)
链 Q
2–276(275 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 8RKU Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K TnsC domain local-refinement map 提交 2023-12-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物一致 |
链 D
2–276(275 aa)
链 E
2–276(275 aa)
链 F
2–276(275 aa)
链 G
2–276(275 aa)
链 H
2–276(275 aa)
链 I
2–276(275 aa)
链 J
2–276(275 aa)
链 K
2–276(275 aa)
链 L
2–276(275 aa)
链 M
2–276(275 aa)
链 N
2–276(275 aa)
链 O
2–276(275 aa)
链 P
2–276(275 aa)
链 Q
2–276(275 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |