当前蛋白身份:A0A8J0PCL3 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8BD4 TniQ-capped Tns-ATP-dsDNA complex 提交 2022-10-18 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 A 1–276(276 aa)
链 B 1–276(276 aa)
链 C 1–276(276 aa)
链 D 1–276(276 aa)
链 E 1–276(276 aa)
链 F 1–276(276 aa)
链 G 1–276(276 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8BD5 Cas12k-sgRNA-dsDNA-S15-TniQ-TnsC transposon recruitment complex 提交 2022-10-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致
链 E 1–276(276 aa)
链 F 1–276(276 aa)
链 G 1–276(276 aa)
链 H 1–276(276 aa)
链 I 1–276(276 aa)
链 J 1–276(276 aa)
链 K 1–276(276 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8BD6 Cas12k-sgRNA-dsDNA-TnsC non-productive complex. 提交 2022-10-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致
链 R 1–276(276 aa)
链 S 1–276(276 aa)
链 T 1–276(276 aa)
链 U 1–276(276 aa)
链 V 1–276(276 aa)
链 W 1–276(276 aa)
链 X 1–276(276 aa)
链 Y 1–276(276 aa)
链 Z 1–276(276 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8EA3 V-K CAST Transpososome from Scytonema hofmanni, major configuration 提交 2022-08-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致
链 A 1–276(276 aa)
链 B 1–276(276 aa)
链 C 1–276(276 aa)
链 D 1–276(276 aa)
链 E 1–276(276 aa)
链 F 1–276(276 aa)
链 G 1–276(276 aa)
链 H 1–276(276 aa)
链 I 1–276(276 aa)
链 J 1–276(276 aa)
链 K 1–276(276 aa)
链 L 1–276(276 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8EA4 V-K CAST Transpososome from Scytonema hofmanni, minor configuration 提交 2022-08-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:31-meric(31) 与全部聚合物一致
链 A 1–276(276 aa)
链 B 1–276(276 aa)
链 C 1–276(276 aa)
链 D 1–276(276 aa)
链 E 1–276(276 aa)
链 F 1–276(276 aa)
链 G 1–276(276 aa)
链 H 1–276(276 aa)
链 I 1–276(276 aa)
链 J 1–276(276 aa)
链 K 1–276(276 aa)
链 L 1–276(276 aa)
链 M 1–276(276 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 15 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8RDU Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K composite map 提交 2023-12-08 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 25 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物一致
链 D 2–276(275 aa)
链 E 2–276(275 aa)
链 F 2–276(275 aa)
链 G 2–276(275 aa)
链 H 2–276(275 aa)
链 I 2–276(275 aa)
链 J 2–276(275 aa)
链 K 2–276(275 aa)
链 L 2–276(275 aa)
链 M 2–276(275 aa)
链 N 2–276(275 aa)
链 O 2–276(275 aa)
链 P 2–276(275 aa)
链 Q 2–276(275 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8RKU Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K TnsC domain local-refinement map 提交 2023-12-30 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物一致
链 D 2–276(275 aa)
链 E 2–276(275 aa)
链 F 2–276(275 aa)
链 G 2–276(275 aa)
链 H 2–276(275 aa)
链 I 2–276(275 aa)
链 J 2–276(275 aa)
链 K 2–276(275 aa)
链 L 2–276(275 aa)
链 M 2–276(275 aa)
链 N 2–276(275 aa)
链 O 2–276(275 aa)
链 P 2–276(275 aa)
链 Q 2–276(275 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å