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Protein Structures and Oligomeric States

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Current Protein Identity：A0A8J0PCL3 New Search
7PDB entries
7Biological assembly
76chain/assembly records
Main Difference Dimensions in This Set
Different construct Different assembly state Different ligand/ion Different experimental conditions Different structure-quality metrics

Difference tags compare only the current result set; every original PDB and assembly record remains separate.

Related-Structure Differences

Each row represents one biological assembly in one PDB entry; multiple monomers of the same protein are listed separately.

PDB Entry Assembly / Oligomeric State Construct Mutations and Modifications Ligands, Ions and Non-polymers Experimental Method Experimental Conditions Structure Quality
8BD4 TniQ-capped Tns-ATP-dsDNA complex Deposited 2022-10-18 Assembly 1 Protein–DNA Heteromer；Protein × 10 PDB declaration: dodecameric（12） Consistent with all polymers
Chain A 1–276（276 aa）
Chain B 1–276（276 aa）
Chain C 1–276（276 aa）
Chain D 1–276（276 aa）
Chain E 1–276（276 aa）
Chain F 1–276（276 aa）
Chain G 1–276（276 aa）
Not recorded ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 3.44 Å
8BD5 Cas12k-sgRNA-dsDNA-S15-TniQ-TnsC transposon recruitment complex Deposited 2022-10-18 Assembly 1 Other combination Heteromer；Protein × 10 PDB declaration: tridecameric（13） Consistent with all polymers
Chain E 1–276（276 aa）
Chain F 1–276（276 aa）
Chain G 1–276（276 aa）
Chain H 1–276（276 aa）
Chain I 1–276（276 aa）
Chain J 1–276（276 aa）
Chain K 1–276（276 aa）
Not recorded ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 3.30 Å
8BD6 Cas12k-sgRNA-dsDNA-TnsC non-productive complex. Deposited 2022-10-18 Assembly 1 Other combination Heteromer；Protein × 10 PDB declaration: pentadecameric（15） Consistent with all polymers
Chain R 1–276（276 aa）
Chain S 1–276（276 aa）
Chain T 1–276（276 aa）
Chain U 1–276（276 aa）
Chain V 1–276（276 aa）
Chain W 1–276（276 aa）
Chain X 1–276（276 aa）
Chain Y 1–276（276 aa）
Chain Z 1–276（276 aa）
Not recorded ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 4.10 Å
8EA3 V-K CAST Transpososome from Scytonema hofmanni, major configuration Deposited 2022-08-27 Assembly 1 Other combination Heteromer；Protein × 23 PDB declaration: 30-meric（30） Consistent with all polymers
Chain A 1–276（276 aa）
Chain B 1–276（276 aa）
Chain C 1–276（276 aa）
Chain D 1–276（276 aa）
Chain E 1–276（276 aa）
Chain F 1–276（276 aa）
Chain G 1–276（276 aa）
Chain H 1–276（276 aa）
Chain I 1–276（276 aa）
Chain J 1–276（276 aa）
Chain K 1–276（276 aa）
Chain L 1–276（276 aa）
Not recorded MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.4
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 3.70 Å
8EA4 V-K CAST Transpososome from Scytonema hofmanni, minor configuration Deposited 2022-08-27 Assembly 1 Other combination Heteromer；Protein × 24 PDB declaration: 31-meric（31） Consistent with all polymers
Chain A 1–276（276 aa）
Chain B 1–276（276 aa）
Chain C 1–276（276 aa）
Chain D 1–276（276 aa）
Chain E 1–276（276 aa）
Chain F 1–276（276 aa）
Chain G 1–276（276 aa）
Chain H 1–276（276 aa）
Chain I 1–276（276 aa）
Chain J 1–276（276 aa）
Chain K 1–276（276 aa）
Chain L 1–276（276 aa）
Chain M 1–276（276 aa）
Not recorded MG MAGNESIUM ION × 15 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.4
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 3.00 Å
8RDU Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K composite map Deposited 2023-12-08 Assembly 1 Other combination Heteromer；Protein × 25 PDB declaration: 32-meric（32） Consistent with all polymers
Chain D 2–276（275 aa）
Chain E 2–276（275 aa）
Chain F 2–276（275 aa）
Chain G 2–276（275 aa）
Chain H 2–276（275 aa）
Chain I 2–276（275 aa）
Chain J 2–276（275 aa）
Chain K 2–276（275 aa）
Chain L 2–276（275 aa）
Chain M 2–276（275 aa）
Chain N 2–276（275 aa）
Chain O 2–276（275 aa）
Chain P 2–276（275 aa）
Chain Q 2–276（275 aa）
Not recorded MG MAGNESIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 2.30 Å
8RKU Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K TnsC domain local-refinement map Deposited 2023-12-30 Assembly 1 Protein–DNA Homooligomer；Protein × 14 PDB declaration: 16-meric（16） Consistent with all polymers
Chain D 2–276（275 aa）
Chain E 2–276（275 aa）
Chain F 2–276（275 aa）
Chain G 2–276（275 aa）
Chain H 2–276（275 aa）
Chain I 2–276（275 aa）
Chain J 2–276（275 aa）
Chain K 2–276（275 aa）
Chain L 2–276（275 aa）
Chain M 2–276（275 aa）
Chain N 2–276（275 aa）
Chain O 2–276（275 aa）
Chain P 2–276（275 aa）
Chain Q 2–276（275 aa）
Not recorded MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 2.30 Å

This page presents structural evidence recorded in PDB/mmCIF.“No recorded non-water small molecule” does not prove that the experimental sample was ligand-free; experimental conditions belong to the PDB experiment, while ligands and copy counts are shown for each biological assembly.