当前蛋白身份:A5U052 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7KIF Mycobacterium tuberculosis WT RNAP transcription open promoter complex with WhiB7 transcription factor 提交 2020-10-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致
链 C 6–1177(1172 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
7KIM Mycobacterium tuberculosis WT RNAP transcription closed promoter complex with WhiB7 transcription factor 提交 2020-10-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致
链 C 6–1177(1172 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
7KIN Mycobacterium tuberculosis WT RNAP transcription open promoter complex with WhiB7 promoter 提交 2020-10-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 C 6–1177(1172 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.74 Å
8E74 Mycobacterium tuberculosis RNAP paused elongation complex with NusG transcription factor 提交 2022-08-23 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 C 6–1177(1172 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8E79 Mycobacterium tuberculosis RNAP paused elongation complex with Escherichia coli NusG transcription factor 提交 2022-08-23 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 C 6–1177(1172 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
8E82 Mycobacterium tuberculosis RNAP elongation complex with NusG transcription factor 提交 2022-08-25 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 C 6–1177(1172 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
8E8M Mycobacterium tuberculosis RNAP paused elongation complex 提交 2022-08-25 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致
链 C 6–1177(1172 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8E95 Mycobacterium tuberculosis RNAP elongation complex 提交 2022-08-26 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致
链 C 6–1177(1172 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9E7V Off-pathway Mycobacterium tuberculosis transcription initiation promoter complex (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA) 提交 2024-11-04 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 C 1–1177(1177 aa)
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9E7Y De Novo Mycobacterium tuberculosis transcription initiation promoter complex with 7-mer RNA and disordered Beta' Lid element (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA) 提交 2024-11-04 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致
链 C 1–1177(1177 aa)
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9E85 De Novo Mycobacterium tuberculosis transcription initiation promoter complex with 6-mer RNA and closed Beta' clamp (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA) 提交 2024-11-05 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:11-meric(11) 与全部聚合物一致
链 C 1–1177(1177 aa)
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9E86 De Novo Mycobacterium tuberculosis transcription initiation promoter complex with 5-mer RNA and open Beta' clamp (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA) 提交 2024-11-05 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:11-meric(11) 与全部聚合物一致
链 C 1–1177(1177 aa)
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9E87 De Novo Mycobacterium tuberculosis transcription initiation pre-RPO promoter complex with open Beta' clamp (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA) 提交 2024-11-05 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 C 1–1177(1177 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9E88 De novo backtracked transcription elongation complex of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase on a linear DNA fragment (TEC-Backtracked) 提交 2024-11-05 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 C 1–1177(1177 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å