当前蛋白身份:C3SIV2 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8AKN Cryo-EM structure of the proline-rich antimicrobial peptide drosocin bound to the terminating ribosome 提交 2022-07-30 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 51 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致
链 4 1–70(70 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 305 SPM SPERMINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.30 Å
8AM9 Cryo-EM structure of the proline-rich antimicrobial peptide drosocin bound to the elongating ribosome 提交 2022-08-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 4 1–70(70 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 293 SPM SPERMINE × 1 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
8ANA Cryo-EM structure of the proline-rich antimicrobial peptide drosocin bound to the 50S ribosomal subunit 提交 2022-08-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物一致
链 4 1–70(70 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 216 SPM SPERMINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.10 Å
8VS9 Endogenous trans-translation complex with tmRNA*SmpB in the P site and alanyl-tRNA in the A site and deacyl-tRNA in the E site of E. coli 70S ribosome 提交 2024-01-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致
链 L31 1–45(45 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8VSA Endogenous trans-translation complex with tmRNA*SmpB in the P site and alanyl-tRNA in the A site of E. coli 70S ribosome 提交 2024-01-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:58-meric(58) 与全部聚合物一致
链 L31 1–45(45 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9SX2 30S Doxycycline Bound E. coli Ribosome 提交 2025-10-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 4 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 DXT (4S,4AR,5S,5AR,6R,12AS)-4-(DIMETHYLAMINO)-3,5,10,12,12A-PENTAHYDROXY-6-METHYL-1,11-DIOXO-1,4,4A,5,5A,6,11,12A-OCTAHYDROTETRACENE-2-CARBOXAMIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 142 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;BS100 ribosomal resuspension buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.08 Å