当前蛋白身份：C3SQV2
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10QM E.coli 50S ribosomal subunit bound to compound 48a 提交 2026-02-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物一致 |
链 b
1–100（100 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.49 Å |
| 11BQ Escherichia coli 70S ribosome containing an evolved 16S rRNA (EC-S3.5) 提交 2026-02-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 307 SPD SPERMIDINE × 14 SPM SPERMINE × 1 C CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 G GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 11DG Chimeric Escherichia coli 70S ribosome containing an evolved Vibrio cholerae 16S rRNA (VC-S4.4) 提交 2026-02-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 272 SPD SPERMIDINE × 14 SPM SPERMINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 11EL Chimeric Escherichia coli 70S ribosome containing an evolved 16S rRNA from Vibrio cholerae (VC-ST) 提交 2026-02-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 308 SPD SPERMIDINE × 16 SPM SPERMINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 11FV Chimeric Escherichia coli 70S ribosome containing an evolved 16S rRNA from Pseudomonas aeruginosa (PA-S3.3) 提交 2026-02-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 b
1–100（100 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 307 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 11GG Chimeric Escherichia coli 70S ribosome containing an evolved 16S rRNA from Pseudomonas aeruginosa (PA-ST) 提交 2026-02-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 b
1–100（100 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 307 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.02 Å |
| 4V85 Crystal Structure of Release Factor RF3 Trapped in the GTP State on a Rotated Conformation of the Ribosome. 提交 2011-06-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 BX
1–100（100 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 493 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Tris Ac PH.7.0, 25-35 mM KCL, 6.1% PEG 20000, 1% glycerol, 50mM sucrose, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.250 |
| 8URM E. coli 70S ribosome with unmodified tRNAPro(GGG) bound to slippery P-site CCC-C codon and tRNAVal(UAC) in the A site 提交 2023-10-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 T
1–100（100 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 395 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8URY Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 30 nt long spacer, and fMet-tRNA in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 2
1–100（100 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8UTJ E. coli 70S ribosome with unmodified lys-tRNAPro(GGG) bound to slippery P-site CCC-C codon in the 0 frame 提交 2023-10-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 T
1–100（100 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 530 LYS LYSINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8UX8 E. coli 70S ribosome with unmodified Lys-tRNAPro(GGG) bound to slippery P-site CCC-C codon in the +1 mRNA reading frame 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 T
1–100（100 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 395 LYS LYSINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8V03 E. coli 70S ribosome with unmodified P/E-tRNAPro(GGG) bound to slippery P-site CCC-C codon 提交 2023-11-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 T
1–100（100 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 281 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8VOS Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 60 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 2
1–100（100 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 8VUP E. coli 70S ribosome with unmodified tRNAPro(GGG) in the e*/E conformation on a slippery CCC-C codon 提交 2024-01-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 T
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 239 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9AX7 70S initiation complex (tRNA-fMet M1 + CUG start codon) 提交 2024-03-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 309 IAS BETA-L-ASPARTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å |
| 9AX8 70S initiation complex (tRNA-fMet M1, initiation factor 2 + CUG start codon) 提交 2024-03-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 T
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 287 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9CG5 70S initiation complex (tRNA-fMet M1 + UUG start codon) 提交 2024-06-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 309 IAS BETA-L-ASPARTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.59 Å |
| 9CG6 70S initiation complex (tRNA-fMet M1 + GUG start codon) 提交 2024-06-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 309 IAS BETA-L-ASPARTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.61 Å |
| 9CG7 70S initiation complex (tRNA-fMet M1 + AUG start codon) 提交 2024-06-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 309 IAS BETA-L-ASPARTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 9D89 E. coli 50S ribosomal subunit in complex with PrAMP rumicidin-2 (focused refinement) 提交 2024-08-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–93（93 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 204 K POTASSIUM ION × 93 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.95 Å |
| 9MKK Structure of arbekacin bound Escherichia coli 70S ribosome 提交 2024-12-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | 84G Arbekacin × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9MOR Damaged 70S ribosome with PrfH bound 提交 2024-12-27 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 T
1–100（100 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 439 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 9MQ4 Damaged 70S ribosome with PrfH bound 提交 2025-01-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 T
1–100（100 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 439 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.78 Å |
| 9NJF E. coli pre-elongation complex without an A-site tRNA with EQ2-YbiT in Non-hydrolytic 1/PtIM(a) conformation 提交 2025-02-27 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 124 ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9NJV E. coli 70S initiation complex (bL33 absent) 提交 2025-02-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 152 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9NKL E. coli 70S initiation complex 提交 2025-03-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 161 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9NL5 E. coli pre-elongation complex without an A-site tRNA with EQ2-EttA in Hydrolytic 1 conformation 提交 2025-03-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 125 ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9NL6 E. coli initiation complex with EQ2-YbiT in Non-hydrolytic 1/PtIM(a) conformation 提交 2025-03-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 252 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9NL7 E. coli initiation complex with EQ2-YbiT in Non-hydrolytic 2/PtIM(b) conformation 提交 2025-03-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 250 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9NLB E. coli initiation complex with EQ2-EttA in Hydrolytic 2 conformation 提交 2025-03-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 279 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9NLE E. coli initiation complex with EQ2-EttA in Hydrolytic 1 conformation 提交 2025-03-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 298 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9NLF E. coli initiation complex with EQ2-YbiT in Hydrolytic 2/PtIM(a) conformation 提交 2025-03-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 245 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9NLH E.coli Initiation complex with YheS-EQ2 提交 2025-03-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 263 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9NLJ E.coli Initiation complex with Uup-EQ2 提交 2025-03-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 277 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9NLQ E. coli initiation complex with EQ2-YbiT in Hydrolytic 1/PtIM(a) conformation 提交 2025-03-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 241 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9NLS E. coli initiation complex with EQ2-YbiT in Intermediate/PtIM(b) conformation 提交 2025-03-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 23
1–93（93 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 248 ZN ZINC ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9O2X Structure of WT E.coli ribosome 70S subunit with complexed with mRNA, P-site fMet-NH-tRNAfMet and A-site (S)-betahydroxyBocK charged NH-tRNAPyl 提交 2025-04-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 320 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 10 PAR PAROMOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 14 SPM SPERMINE × 1 A1B71 (2S)-6-[(tert-butoxycarbonyl)amino]-2-(hydroxymethyl)hexanoic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.29 Å |
| 9O2Y Structure of WT E.coli ribosome 70S subunit with complexed with mRNA, P-site fMet-NH-tRNAfMet and A-site (R) beta-2-hydroxy-BocLysine acid charged NH-tRNAPyl 提交 2025-04-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 320 SPD SPERMIDINE × 13 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 SPM SPERMINE × 1 K POTASSIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 2 A1B70 (2R)-6-[(tert-butoxycarbonyl)amino]-2-(hydroxymethyl)hexanoic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.14 Å |
| 9PIH E. coli 70S ribosome bound to Doxycycline 提交 2025-07-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 276 K POTASSIUM ION × 92 DXT (4S,4AR,5S,5AR,6R,12AS)-4-(DIMETHYLAMINO)-3,5,10,12,12A-PENTAHYDROXY-6-METHYL-1,11-DIOXO-1,4,4A,5,5A,6,11,12A-OCTAHYDROTETRACENE-2-CARBOXAMIDE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 9PII E. coli 70S ribosome bound to Sarecycline 提交 2025-07-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 281 K POTASSIUM ION × 100 V7A Sarecycline × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 9PIJ E. coli 70S ribosome bound to Minocycline 提交 2025-07-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 340 K POTASSIUM ION × 148 MIY (4S,4AS,5AR,12AS)-4,7-BIS(DIMETHYLAMINO)-3,10,12,12A-TETRAHYDROXY-1,11-DIOXO-1,4,4A,5,5A,6,11,12A-OCTAHYDROTETRACENE-2- CARBOXAMIDE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 9QSJ Cryo-EM structure of SKM-70S ribosomal stalled complex in the A-tRNA positioned (Body open) state. 提交 2025-04-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–100（100 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1JAI [(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R},6~{S})-4-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R},6~{S})-5-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-4-[(2~{S},3~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-5-methoxy-3,4-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-2-(hydroxymethyl)-6-[[~{N}-[4-[(~{N}-methylcarbamimidoyl)amino]butyl]carbamimidoyl]amino]-5-oxidanyl-oxan-3-yl] carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 311 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.62 Å |
| 9Y79 Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC^walked) containing mRNA with a 39 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2025-09-09 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 2
1–100（100 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å |