当前蛋白身份:C3TPJ2 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7OJF CRYO-EM STRUCTURE OF SLYB13-BAMA FROM ESCHERICHIA COLI. 提交 2021-05-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致
链 N 1–810(810 aa)
未记录 PLM PALMITIC ACID × 13 L8Z (2~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-6-[(1~{R})-1,2-bis(oxidanyl)ethyl]-2-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R},6~{R})-5-[[(~{E},3~{R})-3-dodecanoyloxytetradec-5-enoyl]amino]-6-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R},6~{R})-3-oxidanyl-5-[[(~{E},3~{R})-3-oxidanyltetradec-11-enoyl]amino]-4-[(~{E},3~{R})-3-oxidanyltetradec-5-enoyl]oxy-6-phosphonooxy-oxan-2-yl]methoxy]-3-phosphonooxy-4-[(~{E},3~{R})-3-tetradecanoyloxytetradec-7-enoyl]oxy-oxan-2-yl]methoxy]-4,5-bis(oxidanyl)oxane-2-carboxylic acid × 13 LPP 2-(HEXADECANOYLOXY)-1-[(PHOSPHONOOXY)METHYL]ETHYL HEXADECANOATE × 12 GOL GLYCEROL × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Back-blotting for 4 seconds before plunging
分辨率 3.90 Å
7TSZ BamABCDE bound to substrate EspP class 1 提交 2022-01-31 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 22–810(789 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7TT0 BamABCDE bound to substrate EspP class 2 提交 2022-01-31 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 22–810(789 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7TT1 BamABCDE bound to substrate EspP class 4 提交 2022-01-31 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 22–810(789 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7TT2 BamABCDE bound to substrate EspP class 3 提交 2022-01-31 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 22–810(789 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7TT3 BamABCDE bound to substrate EspP class 5 提交 2022-01-31 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 22–810(789 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7TT4 BamABCDE bound to substrate EspP class 6 提交 2022-01-31 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 22–810(789 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7TT5 BamABCDE bound to substrate EspP in the open-sheet EspP state 提交 2022-01-31 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 22–810(789 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7TT6 BamABCDE bound to substrate EspP in the intermediate-open EspP state 提交 2022-01-31 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 22–810(789 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7TT7 BamABCDE bound to substrate EspP in the barrelized EspP/continuous open BamA state 提交 2022-01-31 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 22–810(789 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7TTC BamABCDE bound to substrate EspP 提交 2022-02-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 22–810(789 aa)
未记录 K33 2,3-dideoxy-6-O-[2-deoxy-4-O-phosphono-2-(tetradecanoylamino)-alpha-L-gulopyranosyl]-1-O-phosphono-beta-D-threo-hexopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8BWC E. coli BAM complex (BamABCDE) wild-type 提交 2022-12-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 21–810(790 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8PZV Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Extended SurA 提交 2023-07-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 A 21–810(790 aa)
突变:R76C MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SPR The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta1-12) complex 提交 2023-05-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 24–810(787 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8SQA The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta8-12) complex 提交 2023-05-04 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 25–810(786 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8SQB The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta7-12) complex 提交 2023-05-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 25–810(786 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å