当前蛋白身份:C3UPB8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6APD Crystal structure of RSV F bound by AM22 and the infant antibody ADI-19425 提交 2017-08-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致 |
链 A
1–513(513 aa)
链 B
1–513(513 aa)
链 C
1–513(513 aa)
|
突变:N67I, P129A, S215P, I379V, M447V,N67I, P129A, S215P, I379V, M447V,N67I, P129A, S215P, I379V, M447V,N67I, P129A, S215P, I379V, M447V 突变:N67I, P129A, S215P, I379V, M447V,N67I, P129A, S215P, I379V, M447V,N67I, P129A, S215P, I379V, M447V,N67I, P129A, S215P, I379V, M447V 突变:N67I, P129A, S215P, I379V, M447V,N67I, P129A, S215P, I379V, M447V,N67I, P129A, S215P, I379V, M447V,N67I, P129A, S215P, I379V, M447V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;10% PEG 4000
10% 2-propanol
0.1 M sodium citrate pH 5.5
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.256 |
| 7KQD Prefusion RSV F Bound to RV521 提交 2020-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
1–513(513 aa)
|
未记录 | WVA 1'-{[5-(aminomethyl)-1-(4,4,4-trifluorobutyl)-1H-benzimidazol-2-yl]methyl}-6'-fluorospiro[cyclopropane-1,3'-indol]-2'(1'H)-one × 3 SO4 SULFATE ION × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;0.1 M CHES pH 9.0, 0.2 M lithium sulfate and 1.77 M potassium/sodium tartrate
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.249 |
| 7LUC Cryo-EM structure of RSV preF bound by Fabs 32.4K and 01.4B 提交 2021-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致 |
链 A
26–513(488 aa)
链 B
26–513(488 aa)
链 C
26–513(488 aa)
|
突变:N67I, S215P 突变:N67I, S215P 突变:N67I, S215P | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.21 Å |
| 8WSQ A protective human antibody against respiratory syncytial virus by targeting a prefusion epitope across sites IV and V of the viral fusion glycoprotein. 提交 2023-10-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 F
1–513(513 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 6.2, 0.1 M Imidazole pH 7.0, 27% (v/v) polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.280 |
| 8ZQ6 preF6P of RSV glycoprotein 提交 2024-06-01 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
26–99(74 aa)
链 A
140–513(374 aa)
链 B
26–99(74 aa)
链 B
140–513(374 aa)
链 F
26–99(74 aa)
链 F
140–513(374 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH5.5, 24% Jaffamine ED-2001 pH7.0
|
分辨率 2.77 Å R-free 0.237 |
| 8ZQ6 preF6P of RSV glycoprotein 提交 2024-06-01 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
26–99(74 aa)
链 C
140–513(374 aa)
链 D
26–99(74 aa)
链 D
140–513(374 aa)
链 E
26–99(74 aa)
链 E
140–513(374 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH5.5, 24% Jaffamine ED-2001 pH7.0
|
分辨率 2.77 Å R-free 0.237 |
| 8ZYM Complex structure of 60 Fab bound to DS2 prefusion F trimer 提交 2024-06-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 A
1–103(103 aa)
链 A
143–513(371 aa)
链 B
1–103(103 aa)
链 B
143–513(371 aa)
链 C
1–103(103 aa)
链 C
143–513(371 aa)
|
突变:S46G,E92D,V144S,A149C,S155C,S190F,V207L,S215P,S290C,L373R,Y458C,K465Q 突变:S46G,E92D,V144S,A149C,S155C,S190F,V207L,S215P,S290C,L373R,Y458C,K465Q 突变:S46G,E92D,V144S,A149C,S155C,S190F,V207L,S215P,S290C,L373R,Y458C,K465Q 突变:S46G,E92D,V144S,A149C,S155C,S190F,V207L,S215P,S290C,L373R,Y458C,K465Q 突变:S46G,E92D,V144S,A149C,S155C,S190F,V207L,S215P,S290C,L373R,Y458C,K465Q 突变:S46G,E92D,V144S,A149C,S155C,S190F,V207L,S215P,S290C,L373R,Y458C,K465Q | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |