当前蛋白身份:D6IEK6 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8AKN Cryo-EM structure of the proline-rich antimicrobial peptide drosocin bound to the terminating ribosome 提交 2022-07-30 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 51 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致
链 f 1–179(179 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 305 SPM SPERMINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.30 Å
8AM9 Cryo-EM structure of the proline-rich antimicrobial peptide drosocin bound to the elongating ribosome 提交 2022-08-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 f 1–179(179 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 293 SPM SPERMINE × 1 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
8ANA Cryo-EM structure of the proline-rich antimicrobial peptide drosocin bound to the 50S ribosomal subunit 提交 2022-08-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物一致
链 f 1–179(179 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 216 SPM SPERMINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.10 Å
8G2U Time-resolved cryo-EM study of the 70S recycling by the HflX:control-apo-70S at 900ms 提交 2023-02-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物一致
链 F 2–179(178 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8G31 Time-resolved cryo-EM study of the 70S recycling by the HflX:2nd Intermediate 提交 2023-02-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:52-meric(52) 与全部聚合物一致
链 F 2–179(178 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8G34 Time-resolved cryo-EM study of the 70S recycling by the HflX:1st intermediate 提交 2023-02-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:52-meric(52) 与全部聚合物一致
链 F 2–179(178 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8G38 Time-resolved cryo-EM study of the 70S recycling by the HflX:3rd Intermediate 提交 2023-02-07 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:52-meric(52) 与全部聚合物一致
链 F 2–179(178 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8T5D Cryo-EM studies of the interplay between uS2 ribosomal protein and leaderless mRNA during bacterial translation initiation 提交 2023-06-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:53-meric(53) 与全部聚合物一致
链 F 2–179(178 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8T5H Cryo-EM studies of the interplay between uS2 ribosomal protein and leaderless mRNA during bacterial translation initiation 提交 2023-06-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 46 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物一致
链 F 2–179(178 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å