当前蛋白身份：E5BBQ0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3KZY Crystal structure of SNAP-tag 提交 2009-12-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；34% PEG 3350, 100mM BisTris pH 5.5, 500mM NaCl , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.261 |
| 3KZY Crystal structure of SNAP-tag 提交 2009-12-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–182（182 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；34% PEG 3350, 100mM BisTris pH 5.5, 500mM NaCl , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.261 |
| 6RLA Structure of the dynein-2 complex; motor domains 提交 2019-05-01 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
5–181（177 aa）
链 B
5–181（177 aa）
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6RLB Structure of the dynein-2 complex; tail domain 提交 2019-05-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
5–181（177 aa）
链 B
5–181（177 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6SC2 Structure of the dynein-2 complex; IFT-train bound model 提交 2019-07-23 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
5–181（177 aa）
链 B
5–181（177 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6Y8P Crystal structure of SNAP-tag labeled with a benzyl-tetramethylrhodamine fluorophore 提交 2020-03-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
7–182（176 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 OGQ [9-[2-carboxy-5-[(4-methylphenyl)methylcarbamoyl]phenyl]-6-(dimethylamino)xanthen-3-ylidene]-dimethyl-azanium × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；100 mM Na HEPES pH 7.5
25% PEG 8000
10 mg/mL protein 100 nl:100 nL
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分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 8DD7 The Cryo-EM structure of Drosophila Cryptochrome in complex with Timeless 提交 2022-06-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–181（181 aa）
链 B
5–181（177 aa）
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8TK7 Myxococcus xanthus EncA protein shell with compartmentalized SNAP-tag cargo protein 提交 2023-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric（360） 与蛋白数一致 |
链 D
1–182（182 aa）
链 E
1–182（182 aa）
链 F
1–182（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.53 Å |
| 8TK7 Myxococcus xanthus EncA protein shell with compartmentalized SNAP-tag cargo protein 提交 2023-07-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
1–182（182 aa）
链 E
1–182（182 aa）
链 F
1–182（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.53 Å |
| 8TK7 Myxococcus xanthus EncA protein shell with compartmentalized SNAP-tag cargo protein 提交 2023-07-25 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 D
1–182（182 aa）
链 E
1–182（182 aa）
链 F
1–182（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.53 Å |
| 8TK7 Myxococcus xanthus EncA protein shell with compartmentalized SNAP-tag cargo protein 提交 2023-07-25 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致 |
链 D
1–182（182 aa）
链 E
1–182（182 aa）
链 F
1–182（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.53 Å |
| 8TK7 Myxococcus xanthus EncA protein shell with compartmentalized SNAP-tag cargo protein 提交 2023-07-25 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
1–182（182 aa）
链 E
1–182（182 aa）
链 F
1–182（182 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.53 Å |
| 9DI0 Cryo-EM structure of Kif18A bound to a microtubule 提交 2024-09-04 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
5–181（177 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 TA1 TAXOL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |