当前蛋白身份:G0SEI1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4ZOZ Crystal structure of the Chaetomium thermophilum Sqt1 bound to the N-terminus of the ribosomal protein L10 提交 2015-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 Y
1–20(20 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.2 M sodium chloride,
0.1 M Na/K-phosphate pH 6.2,
40% PEG400
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.216 |
| 4ZOZ Crystal structure of the Chaetomium thermophilum Sqt1 bound to the N-terminus of the ribosomal protein L10 提交 2015-05-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
1–20(20 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.2 M sodium chloride,
0.1 M Na/K-phosphate pH 6.2,
40% PEG400
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.216 |
| 7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致 |
链 LI
1–219(219 aa)
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.90 Å |
| 7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致 |
链 LI
1–219(219 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.00 Å |
| 7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致 |
链 LI
1–219(219 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致 |
链 LI
1–219(219 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致 |
链 LI
1–219(219 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å |
| 9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 47 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物一致 |
链 LI
1–219(219 aa)
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未记录 | SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.38 Å |
| 9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 47 PDB 声明:50-meric(50) 与全部聚合物一致 |
链 LI
1–219(219 aa)
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 379 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;waiting time: 15 s
blot force: 0
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分辨率 2.20 Å |