当前蛋白身份：K9N7C7
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4WUR The crystal structure of the MERS-CoV papain-like protease (C111S) with human ubiquitin 提交 2014-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1482–1801（320 aa）
片段：UNP residues 1482-1801
|
突变：C111S | IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；291 K；22% w/v PEG 4000, 15% v/v 2-propanol, 0.1M tri-sodium citrate pH 4.8 and 10% glycerol
|
分辨率 3.16 Å R-free 0.252 |
| 8PPL MERS-CoV Nsp1 bound to the human 43S pre-initiation complex 提交 2023-07-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 Aj
2–193（192 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 116 MET METHIONINE × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 129 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 9INM Crystal structure of MERS main protease in complex with Bofutrelvir 提交 2024-07-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3248–3548（301 aa）
链 D
3248–3548（301 aa）
|
未记录 | FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M Sodium formate, 0.1M BICINE pH8.5 20% PEG5000
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.275 |
| 9INM Crystal structure of MERS main protease in complex with Bofutrelvir 提交 2024-07-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3248–3548（301 aa）
链 C
3248–3548（301 aa）
|
未记录 | FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M Sodium formate, 0.1M BICINE pH8.5 20% PEG5000
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.275 |
| 9PAC Crystal structure of MERS-CoV 3CLpro with ALG-097608 (Inhibitor 1) 提交 2025-06-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3248–3553（306 aa）
链 D
3248–3553（306 aa）
|
未记录 | A1CHF (1R,2R,3S,6S,7S)-4-[(2S)-3,3-dimethyl-2-(2,2,2-trifluoroacetamido)butanoyl]-10,10-difluoro-N-{(1E,2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl]propan-2-yl}-4-azatricyclo[5.2.1.0~2,6~]decane-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2M NaCl, Sodium/Potassium Phosphate 6.2, and 18% PEG1000
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.269 |
| 9PAC Crystal structure of MERS-CoV 3CLpro with ALG-097608 (Inhibitor 1) 提交 2025-06-25 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3248–3553（306 aa）
链 B
3248–3553（306 aa）
|
未记录 | A1CHF (1R,2R,3S,6S,7S)-4-[(2S)-3,3-dimethyl-2-(2,2,2-trifluoroacetamido)butanoyl]-10,10-difluoro-N-{(1E,2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl]propan-2-yl}-4-azatricyclo[5.2.1.0~2,6~]decane-3-carboxamide (non-preferred name) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2M NaCl, Sodium/Potassium Phosphate 6.2, and 18% PEG1000
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.269 |
| 9PAK Crystal structure of MERS-CoV 3CLpro with ALG-097655 (Inhibitor 2) 提交 2025-06-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3248–3553（306 aa）
链 B
3248–3553（306 aa）
|
未记录 | A1CHJ (1R,2S,3S,6R,7S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-[(2S)-4,4,4-trifluoro-3,3-dimethyl-2-(2,2,2-trifluoroacetamido)butanoyl]-4-azatricyclo[5.2.1.0~2,6~]dec-8-ene-3-carboxamide (non-preferred name) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2M NaCl, Sodium/Potassium Phosphate 6.2, and 18% PEG1000
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.239 |
| 9PAK Crystal structure of MERS-CoV 3CLpro with ALG-097655 (Inhibitor 2) 提交 2025-06-25 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3248–3553（306 aa）
链 D
3248–3553（306 aa）
|
未记录 | A1CHJ (1R,2S,3S,6R,7S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-[(2S)-4,4,4-trifluoro-3,3-dimethyl-2-(2,2,2-trifluoroacetamido)butanoyl]-4-azatricyclo[5.2.1.0~2,6~]dec-8-ene-3-carboxamide (non-preferred name) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2M NaCl, Sodium/Potassium Phosphate 6.2, and 18% PEG1000
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.239 |
| 9XG7 The crystal structure of MERS-CoV Main protease in complex with inhibitor FD2-21 提交 2025-10-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3248–3551（304 aa）
链 B
3248–3551（304 aa）
|
未记录 | A1EZ7 7-(5-azanylpyridin-3-yl)-2-(2-chlorophenyl)-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.05 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 30% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.298 |
| 9XG7 The crystal structure of MERS-CoV Main protease in complex with inhibitor FD2-21 提交 2025-10-29 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3248–3551（304 aa）
链 D
3248–3551（304 aa）
|
未记录 | A1EZ7 7-(5-azanylpyridin-3-yl)-2-(2-chlorophenyl)-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.05 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 30% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.298 |
| 9Y8W MERS Mpro with EGT710 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3248–3553（306 aa）
链 C
3248–3553（306 aa）
|
未记录 | A1CBU (4S)-4-(iminomethyl)-3-(isoquinolin-4-yl)-1-[6-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]imidazolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1M Hepes pH 7.5, 8% Ethylene Glycol, 10% Peg 8000
|
分辨率 3.04 Å R-free 0.278 |
| 9Y8W MERS Mpro with EGT710 提交 2025-09-11 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3248–3553（306 aa）
链 D
3248–3553（306 aa）
|
未记录 | A1CBU (4S)-4-(iminomethyl)-3-(isoquinolin-4-yl)-1-[6-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]imidazolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1M Hepes pH 7.5, 8% Ethylene Glycol, 10% Peg 8000
|
分辨率 3.04 Å R-free 0.278 |
| 9YCK Cryo-EM structure of MERS-CoV nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P15 RNA, monomeric form 提交 2025-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
4238–4377（140 aa）
链 B
5909–6432（524 aa）
|
突变：E191A | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9YCL Cryo-EM structure of MERS-CoV nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P15 RNA, dimeric form 提交 2025-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4238–4377（140 aa）
链 B
5909–6432（524 aa）
链 D
4238–4377（140 aa）
链 E
5909–6432（524 aa）
|
突变：E191A 突变：E191A | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 9YCM Cryo-EM structure of MERS-CoV nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P14-U RNA 提交 2025-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4238–4377（140 aa）
链 B
5909–6432（524 aa）
链 D
4238–4377（140 aa）
链 E
5909–6432（524 aa）
|
突变：E191A 突变：E191A | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 9YCN Cryo-EM structure of MERS-CoV nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P14-A RNA 提交 2025-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
4238–4377（140 aa）
链 B
5909–6432（524 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.88 Å |
| 9YCO Cryo-EM structure of MERS-CoV nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P14-G RNA 提交 2025-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
4238–4377（140 aa）
链 B
5909–6432（524 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.88 Å |