当前蛋白身份:M9TLW3 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6TU5 Influenza A/H7N9 polymerase core (apo) 提交 2020-01-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 BBB 1–757(757 aa)
链 EEE 1–757(757 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;281 K;Protein at about 9 mg/ml 0.1 M Tris pH 7.0, 8-13% PEG 8K, 0.2 M MgCl2, 0.1 M guanidine hydrochloride
分辨率 3.33 Å R-free 0.268
7QTL Influenza A/H7N9 polymerase elongation complex 提交 2022-01-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 B 1–757(757 aa)
未记录 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
7R0E Early transcription elongation state of influenza A/H7N9 polymerase backtracked due to double incoproation of nucleotide analogue T1106 and with singly incoporated T1106 at the +1 position 提交 2022-02-01 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 B 1–757(757 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.51 Å
7ZPL Symmetric dimer of influenza A/H7N9 polymerase bound to 5' vRNA hook 提交 2022-04-27 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致
链 B 1–757(757 aa)
链 E 1–757(757 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
7ZPM Influenza A/H7N9 polymerase apo-protein dimer complex 提交 2022-04-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 1–757(757 aa)
链 E 1–757(757 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
8BEK Early transcription elongation state of influenza A/H7N9 backtracked polymerase with singly incoporated T1106 at the U +1 position 提交 2022-10-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 B 1–757(757 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PM0 Influenza A/H7N9 polymerase in replicase-like conformation in pre-initiation state with Pol II pS5 CTD peptide mimic bound in site 1A/2A 提交 2023-06-27 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 B 1–757(757 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8POH Influenza A/H7N9 polymerase symmetric dimer bound to the promoter (PA K289A/C489R) 提交 2023-07-04 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 B 1–757(757 aa)
链 F 1–757(757 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9FYX Influenza A/H7N9 polymerase pre-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-04 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:23-meric(23) 与全部聚合物一致
链 b 1–757(757 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 0.1 mM MgCl2 4% glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9G0A Influenza A/H7N9 polymerase post-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-07 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:23-meric(23) 与全部聚合物一致
链 b 1–757(757 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 3 mM MgCl2 4% glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å