当前蛋白身份:O00401 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2FF3 Crystal structure of Gelsolin domain 1:N-wasp V2 motif hybrid in complex with actin 提交 2005-12-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 451–465(15 aa) 片段:N-wasp second WH2 domain
未记录 CA CALCIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 6.5;293.15 K;5% PEG 8000, 0.1M sodium acetate, 10mM calcium chloride, pH 6.5, microbatch, temperature 293.15K
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
2LNH Enterohaemorrhagic E. coli (EHEC) exploits a tryptophan switch to hijack host F-actin assembly 提交 2011-12-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 207–270(64 aa) 片段:UNP residues 207-270
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 ambient
NMR样品组成 0.3 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] protein_1, 0.3 mM protein_2, 0.3 mM protein_3, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.5 mM protein_1, 0.5 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] protein_2, 0.5 mM protein_3, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.5 mM protein_1, 0.5 mM protein_2, 0.5 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] protein_3, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
2VCP Crystal structure of N-Wasp VC domain in complex with skeletal actin 提交 2007-09-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 392–484(93 aa) 片段:WH2 1,2 AND C DOMAIN, RESIDUES 392-484
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7;277 K;VAPOR DIFFUSION METHOD (4 C) PROTEIN SOLUTION: 0.18MM ACTIN, 0.36MM N-WASP PEPTIDE, 5MM TRIS.HCL PH7.0, ATP 0.2MM, CACL2 0.02MM, TCEP 20MM, NAN3 0.01%. RESERVOIR: 10.2% (V/V) TACSIMATE, 13.2%(W/V)PEG 8000, 100MM HEPES PH7.0
分辨率 3.20 Å R-free 0.331
2VCP Crystal structure of N-Wasp VC domain in complex with skeletal actin 提交 2007-09-26 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 392–484(93 aa) 片段:WH2 1,2 AND C DOMAIN, RESIDUES 392-484
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7;277 K;VAPOR DIFFUSION METHOD (4 C) PROTEIN SOLUTION: 0.18MM ACTIN, 0.36MM N-WASP PEPTIDE, 5MM TRIS.HCL PH7.0, ATP 0.2MM, CACL2 0.02MM, TCEP 20MM, NAN3 0.01%. RESERVOIR: 10.2% (V/V) TACSIMATE, 13.2%(W/V)PEG 8000, 100MM HEPES PH7.0
分辨率 3.20 Å R-free 0.331
4CC2 Complex of human Tuba C-terminal SH3 domain with human N-WASP proline- rich peptide - P212121 提交 2013-10-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 346–357(12 aa) 片段:N-WASP PROLINE-RICH PEPTIDE, RESIDUES 346-357
未记录 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 1.55 Å R-free 0.218
4CC2 Complex of human Tuba C-terminal SH3 domain with human N-WASP proline- rich peptide - P212121 提交 2013-10-17 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 346–357(12 aa) 片段:N-WASP PROLINE-RICH PEPTIDE, RESIDUES 346-357
未记录 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 1.55 Å R-free 0.218
4CC7 Crystal structure of the sixth or C-terminal SH3 domain of human Tuba in complex with proline-rich peptides of N-WASP. Space group P41 提交 2013-10-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 346–357(12 aa) 片段:PROLINE-RICH REGION, RESIDUES 346-357
未记录 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 1.97 Å R-free 0.215
4CC7 Crystal structure of the sixth or C-terminal SH3 domain of human Tuba in complex with proline-rich peptides of N-WASP. Space group P41 提交 2013-10-18 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 346–357(12 aa) 片段:PROLINE-RICH REGION, RESIDUES 346-357
未记录 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 1.97 Å R-free 0.215
4CC7 Crystal structure of the sixth or C-terminal SH3 domain of human Tuba in complex with proline-rich peptides of N-WASP. Space group P41 提交 2013-10-18 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 346–357(12 aa) 片段:PROLINE-RICH REGION, RESIDUES 346-357
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 1.97 Å R-free 0.215
4CC7 Crystal structure of the sixth or C-terminal SH3 domain of human Tuba in complex with proline-rich peptides of N-WASP. Space group P41 提交 2013-10-18 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 H 346–357(12 aa) 片段:PROLINE-RICH REGION, RESIDUES 346-357
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 1.97 Å R-free 0.215
4CC7 Crystal structure of the sixth or C-terminal SH3 domain of human Tuba in complex with proline-rich peptides of N-WASP. Space group P41 提交 2013-10-18 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 J 346–357(12 aa) 片段:PROLINE-RICH REGION, RESIDUES 346-357
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 1.97 Å R-free 0.215
4CC7 Crystal structure of the sixth or C-terminal SH3 domain of human Tuba in complex with proline-rich peptides of N-WASP. Space group P41 提交 2013-10-18 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 L 346–357(12 aa) 片段:PROLINE-RICH REGION, RESIDUES 346-357
未记录 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 1.97 Å R-free 0.215
4CC7 Crystal structure of the sixth or C-terminal SH3 domain of human Tuba in complex with proline-rich peptides of N-WASP. Space group P41 提交 2013-10-18 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 N 346–357(12 aa) 片段:PROLINE-RICH REGION, RESIDUES 346-357
未记录 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 1.97 Å R-free 0.215
9DLX Bovine Arp2/3 complex with N-WASP CA bound to Arp3 and Arp2-ArpC1 提交 2024-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 H 465–505(41 aa)
链 I 465–505(41 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
9R3Y Solution NMR structure of N-WASP GBD in complex with EspFu R5 提交 2025-05-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 207–275(69 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.11;压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] N-WASP GBD, 0.6 mM EspFu R5, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.4 mM N-WASP GBD, 0.3 mM [U-13C; U-15N] EspFu R5, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
9R4V Solution structure of N-WASP GBD in complex with EspF 提交 2025-05-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 207–275(69 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] N-WASP GBD, 0.6 mM EspF, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.7 mM GBD, 0.5 mM [U-13C; U-15N] EspF, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供