当前蛋白身份：O14980
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1W9C Proteolytic fragment of CRM1 spanning six C-terminal HEAT repeats 提交 2004-10-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
707–1027（321 aa）
片段：C-TERMINAL SIX HEAT REPEATS, RESIDUES 707-1027
链 B
707–1027（321 aa）
片段：C-TERMINAL SIX HEAT REPEATS, RESIDUES 707-1027
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.00
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分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 2L1L NMR Solution Structure of the Phi0 PKI NES Peptide in Complex with CRM1-RanGTP 提交 2010-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
504–630（127 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成
200 uM [U-13C; U-15N; U-2H; ILV-1H] Phi0 PKI-NES-1, 200 uM [U-13C; U-15N; U-2H; ILV-1H, Ala-1H/12C/14N] Phi0 PKI-NES-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 3GB8 Crystal structure of CRM1/Snurportin-1 complex 提交 2009-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1071（1071 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；8% PEG 8000, 0.2M Magnesium chloride, 0.1M MES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
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分辨率 2.90 Å R-free 0.267 |
| 4BSM Crystal structure of the Nuclear Export Receptor CRM1 (exportin-1) lacking the C-terminal helical extension at 4.5A 提交 2013-06-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1032（1032 aa）
片段：RESIDUES 1-1032
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；BY MIXING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN (8-10 MG/ML) AND RESERVOIR SOLUTION 0.5 M DISODIUM TARTRATE, 50 MM TRIS PH 8.0
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分辨率 4.50 Å R-free 0.269 |
| 4BSN Crystal structure of the Nuclear Export Receptor CRM1 (exportin-1) lacking the C-terminal helical extension at 4.1A 提交 2013-06-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1032（1032 aa）
片段：LACKS THE C-TERMINAL HELICAL EXTENSION, RESIDUE 1-1032
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；BY MIXING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN (8-10 MG/ML) AND RESERVOIR SOLUTION 0.8 M SODIUM ACETATE, 50 MM TRIS PH 7.5
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分辨率 4.10 Å R-free 0.298 |
| 5DIS Crystal structure of a CRM1-RanGTP-SPN1 export complex bound to a 113 amino acid FG-repeat containing fragment of Nup214 提交 2015-09-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
5–1048（1044 aa）
片段：UNP residues 5-1058
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未记录 | PRO PROLINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；5% PEG 8000, 0.2M L-proline, 0.1M Tris pH 7.5, 4 mM D-maltose, 180 mM LiCl
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分辨率 2.85 Å R-free 0.249 |
| 6TVO Human CRM1-RanGTP in complex with Leptomycin B 提交 2020-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1036（1036 aa）
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突变：V430A, L431A, V432A | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 LMB Leptomycin B, bound form × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.02M sodium L-glutamate, 0.02M DL-alanine, 0.02M glycine, 0.02M DL-lysine HCl, 0.02 M DL-serine, 10%w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 0.1M bicine /Trizma base pH 8.5
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分辨率 3.20 Å R-free 0.235 |
| 7B51 Crystal structure of human CRM1 covalently modified by 2-mercaptoethanol at Cys528 提交 2020-12-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1036（1036 aa）
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277.15 K；0.02M sodium L-glutamate, 0.02M DL-alanine, 0.02M glycine, 0.02M DL-lysine HCl, 0.02 M DL-serine, 10%w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 0.1M bicine /Trizma base pH 8.5
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分辨率 2.58 Å R-free 0.250 |
| 8URJ Cryo-EM structure of the HIV-1 nuclear export complex 提交 2023-10-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1056（1056 aa）
链 C
1–1056（1056 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Washed grid 2x outside of vitrobot; with the second drop of buffer I loaded the tweezers; moved the grid into the chamber and then I blotted.
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分辨率 4.25 Å |
| 9B62 Human RANBP2/RAN(GTP)/RANGAP1-SUMO1/UBC9/CRM1/RAN(GTP) - composite map and model 提交 2024-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1071（1071 aa）
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris-Cl pH 8.0, 50 mM NaCl, 0.1 mM TCEP supplemented with 0.02% (v/v) IGEPAL CA-630
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；30 s wait time, blot for 2.5 s before plunging
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分辨率 2.90 Å |
| 9HFL Cryo-EM structure of the human snRNA export complex comprising CBC-PHAX-CRM1-RanGTP and capped-RNA 提交 2024-11-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1071（1071 aa）
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.62 Å |
| 9OG9 Cryo-EM structure of human full-length XPO1 (unliganded) 提交 2025-04-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1071（1071 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.93 Å |
| 9OGA Cryo-EM structure of human full-length XPO1 conjugated with selinexor 提交 2025-04-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1071（1071 aa）
|
未记录 | V6A selinexor, bound form × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 9OGB Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to yeast RAN-GTP and human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1071（1071 aa）
|
未记录 | V6A selinexor, bound form × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 9OGC Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-185 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1071（1071 aa）
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未记录 | K85 propan-2-yl 3-{3-[3-methoxy-5-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-1,2,4-triazol-1-yl}propanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 9OGD Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to human ASB8(R197A)-ELOB/C 提交 2025-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1071（1071 aa）
|
未记录 | V6A selinexor, bound form × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.49 Å |
| 9OGE Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-127 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1071（1071 aa）
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未记录 | A1CBC propan-2-yl 3-[3-(3-chlorophenyl)-1H-1,2,4-triazol-1-yl]propanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.28 Å |
| 9OGF Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-UTSW1 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1071（1071 aa）
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未记录 | A1CBB propan-2-yl 3-(3-phenyl-1H-1,2,4-triazol-1-yl)propanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.21 Å |