当前蛋白身份：O32504
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6A27 Crystal structure of PprA W183R mutant form 1 提交 2018-06-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–300（284 aa）
链 B
17–300（284 aa）
|
突变：W183R 突变：W183R | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris buffer (pH 8.5) containing 0.2 M LiSO4 and 30% PEG4000
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.202 |
| 6A28 Crystal structure of PprA W183R mutant form 2 提交 2018-06-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–300（284 aa）
链 B
17–300（284 aa）
|
突变：W183R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：W183R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris buffer (pH 8.5) containing 0.2 M LiSO4 and 30% PEG4000
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.235 |
| 6A29 Crystal structure of PprA A139R mutant 提交 2018-06-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–300（284 aa）
链 B
17–300（284 aa）
|
突变：A139R 突变：A139R | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris buffer (pH 8.5) containing 0.2 M LiSO4 and 30% PEG3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.271 |
| 6A29 Crystal structure of PprA A139R mutant 提交 2018-06-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
17–300（284 aa）
链 D
17–300（284 aa）
|
突变：A139R 突变：A139R | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris buffer (pH 8.5) containing 0.2 M LiSO4 and 30% PEG3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.271 |
| 6A29 Crystal structure of PprA A139R mutant 提交 2018-06-09 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
17–300（284 aa）
链 F
17–300（284 aa）
|
突变：A139R 突变：A139R | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris buffer (pH 8.5) containing 0.2 M LiSO4 and 30% PEG3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.271 |
| 6A29 Crystal structure of PprA A139R mutant 提交 2018-06-09 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
17–300（284 aa）
链 H
17–300（284 aa）
|
突变：A139R 突变：A139R | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris buffer (pH 8.5) containing 0.2 M LiSO4 and 30% PEG3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.271 |
| 6BDU Crystal structure of PprA from Deinococcus radiodurans 提交 2017-10-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
25–300（276 aa）
链 B
25–300（276 aa）
|
突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；Protein at 2.4mg/mL in 150mM KCl, 20mM Tris, pH 7.5 was mixed in 1:1 volume ratio with a solution of 0.2 M Lithium Citrate Tribasic and 20 % (w/v) PEG 3350. The drop was suspended over 1.5M Ammonium sulfate.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.236 |
| 6MC6 Crystal structure of PprA filament from Deinococcus radiodurans 提交 2018-08-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
25–300（276 aa）
链 B
25–300（276 aa）
|
突变：D180K, D184K 突变：D180K, D184K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；Protein at 4.5 mg/mL in 150 mM KCl, 20 mM Tris, pH 7.5 was mixed in 1:1 volume ratio with Wizard Classic 1 (Rigaku) #46 - a solution of 200 mM Lithium sulfate, 10% (w/v) PEG 8000 and 100 mM Imidazole/ HCl at pH 8.0. The drop was suspended over a 1.5M Ammonium sulfate dehydrating solution and incubated for about 5 weeks.
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.260 |
| 6NEO Crystal structure of PprA filament from Deinococcus radiodurans 提交 2018-12-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
25–300（276 aa）
|
突变：D180K, D184K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；1:1 4.9 mg/mL protein in 150 mM potassium chloride, 20 mM Tris, pH 8.0 + Morpheus II-FX96 (Molecular Dimensions) condition H2 - 40 mM polyamines (spermine tetrahydrochloride, spermidine trihydrochloride, 1,4-diaminobutane dihydrochloride, DL-ornithine monohydrochloride), 50% v/v Precipitant Mix 6 (25% w/v PEG4000, 40% w/v 1,2,6-hexanetriol), 0.1 M Buffer System 4 (Gly-Gly, AMPD) at pH 6.5. The drop was suspended over a 1.5 M ammonium sulfate dehydrating solution and incubated at 20 degrees C for about 5 months.
|
分辨率 5.94 Å R-free 0.309 |
| 9OM8 Crystal structure of PprA S-F filament from Deinococcus radiodurans 提交 2025-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
25–300（276 aa）
链 B
25–300（276 aa）
链 C
25–300（276 aa）
链 D
25–300（276 aa）
|
突变：D180K, D184K 突变：D180K, D184K 突变：D180K, D184K 突变：D180K, D184K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；1.0 ul of protein solution was mixed with 1.0 uL of crystallization solution and hung upside-down in a sealed chamber containing 1mL of well solution. | Protein solution: 3.5 mg/mL PprA (117 uM), 150mM KCl, 20mM Tris, pH 7.5 | Crystallization solution: 0.2M LiCl, 20% (w/v) PEG 3350 | Well solution: 1.4 M (NH4)2SO4
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.275 |
| 9OR6 Crystal structure of PprA S-F-S tetramer from Deinococcus radiodurans 提交 2025-05-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–300（276 aa）
链 B
25–300（276 aa）
|
突变：D180K, D184K 突变：D180K, D184K | SPD SPERMIDINE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；1.5 ul of protein solution was mixed with 1.0 uL of crystallization solution and hung upside-down in a sealed chamber containing 1mL of well solution.
| Protein solution: 5.0 mg/mL PprA (168 uM), 43bp dsDNA (101 uM), 150mM KCl, 20mM Tris, pH 7.5, 1 mM MgCl2.
| Crystallization solution (Molecular Dimensions - Morpheus 2 #94): 10 mM Spermine tetrahydrochloride, 10 mM Spermidine trihydrochloride, 10 mM 1,4 Diaminobutane dihydrochloride, 10 mM DL Ornithine monohydrochloride
0.1M Gly-Gly, AMPD, pH 8.5, 13% w/v PEG 4000, 21% w/v 1,2,6 Hexanetriol.
| Well solution: 2.0 M Ammonium sulfate.
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.248 |
| 9YI3 Crystal structure of PprA S-F filament from Deinococcus radiodurans 提交 2025-10-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
25–300（276 aa）
链 B
25–300（276 aa）
|
突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；1.0 ul of protein solution was mixed with 2.0 uL of crystallization
solution and hung upside-down in a sealed chamber containing 1mL of well
solution. | Protein solution: 2.98 mg/mL PprA (100 uM), 150mM KCl,
20mM Tris, pH 7.5 | Crystallization solution: 800 mM LiCl, 32% (w/v) PEG
4000, 100 mM HEPES, pH 8.0 | Well solution: 0.8 M Ammonium sulfate
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.275 |
| 9YL4 Crystal structure of PprA S-F filament from Deinococcus radiodurans 提交 2025-10-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
25–300（276 aa）
链 B
25–300（276 aa）
链 C
25–300（276 aa）
链 D
25–300（276 aa）
链 E
25–300（276 aa）
链 F
25–300（276 aa）
|
突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.0 ul of protein solution was mixed with 1.0 uL of crystallization solution and hung upside-down in a sealed chamber containing 1mL of well solution. | Protein solution: 6.4 mg/mL PprA (214 uM), 150mM KCl, 20mM Tris, pH 7.5 | Crystallization solution (Molecular Dimensions - MCSG2 #82): 200 mM NaCl, 20% (w/v) PEG 8000, 100 mM CAPS:NaOH, pH 10.5 | Well solution: 1.25 M Ammonium sulfate
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.283 |
| 9YL4 Crystal structure of PprA S-F filament from Deinococcus radiodurans 提交 2025-10-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 G
25–300（276 aa）
链 H
25–300（276 aa）
链 I
25–300（276 aa）
链 J
25–300（276 aa）
链 K
25–300（276 aa）
链 L
25–300（276 aa）
|
突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；2.0 ul of protein solution was mixed with 1.0 uL of crystallization solution and hung upside-down in a sealed chamber containing 1mL of well solution. | Protein solution: 6.4 mg/mL PprA (214 uM), 150mM KCl, 20mM Tris, pH 7.5 | Crystallization solution (Molecular Dimensions - MCSG2 #82): 200 mM NaCl, 20% (w/v) PEG 8000, 100 mM CAPS:NaOH, pH 10.5 | Well solution: 1.25 M Ammonium sulfate
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.283 |
| 9YUP Crystal structure of PprA S-F-S tetramer from Deinococcus radiodurans 提交 2025-10-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–300（276 aa）
链 B
25–300（276 aa）
链 C
25–300（276 aa）
链 D
25–300（276 aa）
|
突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D180K, D184K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FLC CITRATE ANION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；1.0 ul of protein solution was mixed with 1.0 uL of crystallization solution and hung upside-down in a sealed chamber containing 1mL of well solution. | Protein solution: 2.4 mg/mL PprA (73 uM), 150mM KCl, 20mM Tris, pH 7.5 | Crystallization solution: 400 mM Lithium citrate, 20% (w/v) PEG 3350 | Well solution: 1.5 M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.236 |