当前蛋白身份:O43143 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5XDR Crystal structure of human DEAH-box RNA helicase DHX15 in complex with ADP 提交 2017-03-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 110–795(686 aa) 片段:UNP residues 110-795
突变:T678S ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG4000, lithium sulfate, sodium acetate
分辨率 2.00 Å R-free 0.269
6ID1 Cryo-EM structure of a human intron lariat spliceosome after Prp43 loaded (ILS2 complex) at 2.9 angstrom resolution 提交 2018-09-07 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 39 PDB 声明:43-meric(43) 与全部聚合物一致
链 V 1–795(795 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
6SH6 Crystal structure of the human DEAH-helicase DHX15 in complex with the NKRF G-patch bound to ADP 提交 2019-08-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 113–795(683 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291.15 K;0.02 M 1,6-hexanediol, 0.02 M 1-butanol, 0.02 M (RS)-1,2-propanediol, 0.02 M 2-propanol, 0.02 M 1,4-butanediol, 0.02 M 1,3-propanediol, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol
分辨率 1.85 Å R-free 0.244
6SH7 Crystal structure of the human DEAH-helicase DHX15 in complex with the NKRF G-patch 提交 2019-08-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 113–795(683 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;291.15 K;0.1 M carboxylic acids, 0.1 M BICINE/Tris pH 8.5, 12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD
分辨率 2.21 Å R-free 0.251
8EJM Crystal structure of human DEAH-box helicase DHX15 in complex with SUGP1 G-patch 提交 2022-09-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 113–795(683 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG3350, ammonium sulfate, HEPES buffer
分辨率 1.80 Å R-free 0.224
8RO2 Integrative Structure of the human intron lariat Spliceosome (ILS'') 提交 2024-01-11 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:40-meric(40) 与全部聚合物一致
链 DX 1–795(795 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9R8V Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 59 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致
链 DH 1–795(795 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.50 Å
9ZE0 Cryo-EM structure of the endogenous U2/branchpoint spliceosomal complex (Proximal DHX15 state) 提交 2025-11-26 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致
链 B 1–795(795 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9;20 mM HEPES-KOH pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2, 10 mM DTT, 4.5% glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9ZE3 Cryo-EM structure of the endogenous U2/branchpoint spliceosomal complex (Distal DHX15 state) 提交 2025-11-27 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致
链 B 1–795(795 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9;20 mM HEPES-KOH pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2, 10 mM DTT, 4.5% glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å