当前蛋白身份:O43683 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2LAH Solution NMR Structure of Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 N-terminal domain from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics Consortium Target HR5460A (Methods Development) 提交 2011-03-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–150(150 aa) 片段:N-terminal domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5;298 K;压力 ambient
NMR样品组成 1.164 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HR5460A, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1.033 mM [U-10% 13C; U-100% 15N] HR5460A, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
4A1G The crystal structure of the human Bub1 TPR domain in complex with the KI motif of Knl1 提交 2011-09-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–150(150 aa) 片段:TPR DOMAIN, RESIDUES 1-150
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;1.25-1.3 M NA MALONATE, PH 6.0.
分辨率 2.60 Å R-free 0.244
4A1G The crystal structure of the human Bub1 TPR domain in complex with the KI motif of Knl1 提交 2011-09-15 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–150(150 aa) 片段:TPR DOMAIN, RESIDUES 1-150
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;1.25-1.3 M NA MALONATE, PH 6.0.
分辨率 2.60 Å R-free 0.244
4A1G The crystal structure of the human Bub1 TPR domain in complex with the KI motif of Knl1 提交 2011-09-15 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–150(150 aa) 片段:TPR DOMAIN, RESIDUES 1-150
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;1.25-1.3 M NA MALONATE, PH 6.0.
分辨率 2.60 Å R-free 0.244
4A1G The crystal structure of the human Bub1 TPR domain in complex with the KI motif of Knl1 提交 2011-09-15 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 1–150(150 aa) 片段:TPR DOMAIN, RESIDUES 1-150
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;1.25-1.3 M NA MALONATE, PH 6.0.
分辨率 2.60 Å R-free 0.244
4QPM Structure of Bub1 kinase domain 提交 2014-06-24 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 749–1094(346 aa) 片段:UNP residues 749-1094
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;293 K;20% PEG3350, 1% Tryptone, 10 mM DTT, 0.1 M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.269
4QPM Structure of Bub1 kinase domain 提交 2014-06-24 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 749–1094(346 aa) 片段:UNP residues 749-1094
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;293 K;20% PEG3350, 1% Tryptone, 10 mM DTT, 0.1 M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.269
4R8Q Structure and substrate recruitment of the human spindle checkpoint kinase bub1 提交 2014-09-02 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 724–1085(362 aa) 片段:Kinase domain, unp residues 724-1085
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.29;293 K;TO 15 MG/ML BUB1, ATP WAS ADDED TO A FINAL CONCENTRATION OF 10 MM. SITTING DROPS WERE MADE BY MIXING 1.5 MICROLITERS PROTEIN WITH 1.5 MICROLITERS CRYSTALLIZATION SOLUTION (20% W/V PEG 3350, 0.1 M SODIUM FORMATE PH 6.29, 25 MM DTT) AND EQUILIBRATING AGAINST 200 MICROLITERS OF RESERVOIR SOLUTION. LARGE SINGLE CRYSTALS WERE OBTAINED BY REPEATED SEEDING. THE CRYSTALS WERE CRYO-PROTECTED IN RESERVOIR SOLUTION SUPPLEMENTED WITH 18% V/V GLYCEROL AND THEN FLASH-COOLED IN LIQUID PROPANE, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K, vapor diffusion, sitting drop
分辨率 2.31 Å R-free 0.264
5DMZ Structure of human Bub1 kinase domain phosphorylated at Ser969 提交 2015-09-09 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 726–1085(360 aa) 片段:UNP residues 726-1085
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;277 K;0.2 M NaCl, 15% PEG 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.245
5DMZ Structure of human Bub1 kinase domain phosphorylated at Ser969 提交 2015-09-09 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 726–1085(360 aa) 片段:UNP residues 726-1085
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;277 K;0.2 M NaCl, 15% PEG 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.245
6F7B Crystal structure of the human Bub1 kinase domain in complex with BAY 1816032 提交 2017-12-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 726–1085(360 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CVQ 2-[3,5-bis(fluoranyl)-4-[[3-[5-methoxy-4-[(3-methoxypyridin-4-yl)amino]pyrimidin-2-yl]indazol-1-yl]methyl]phenoxy]ethanol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.26;277 K;200mM MgCl2, 100mM Tris-HCl pH 7.26, 5% glycerol, 20% PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.254
7B1F Orthorhombic P212121 Structure of Human Mad1 C-terminal Domain in Complex with Phosphorylated Bub1 CD1 Domain 提交 2020-11-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 455–479(25 aa)
链 D 455–479(25 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% PEG 4000, 0.1 M Hepes pH 7.5, 10% isopropanol
分辨率 1.75 Å R-free 0.287
7B1H Monoclinic P21 Structure of Human Mad1 C-terminal Domain in Complex with Phosphorylated Bub1 CD1 Domain 提交 2020-11-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 455–479(25 aa)
链 D 455–479(25 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;8% Isopropanol, 20% PEG 4000, 0.1 M Na HEPES, pH 7.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.281
7B1H Monoclinic P21 Structure of Human Mad1 C-terminal Domain in Complex with Phosphorylated Bub1 CD1 Domain 提交 2020-11-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 G 455–479(25 aa)
链 H 455–479(25 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;8% Isopropanol, 20% PEG 4000, 0.1 M Na HEPES, pH 7.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.281
7B1J Orthorhombic P21212 Structure of Human Mad1 C-terminal Domain in Complex with Phosphorylated Bub1 CD1 Domain 提交 2020-11-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 455–479(25 aa)
链 D 455–479(25 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;10% Isopropanol, 0.1 M Na HEPES, pH 7.5, 20% PEG 4000
分辨率 2.90 Å R-free 0.296