当前蛋白身份:O75554 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2DK1 Solution structure of WW domain in WW domain binding protein 4 (WBP-4) 提交 2006-04-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 124–163(40 aa) 片段:WW domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 0.8mM U-15N/13C; 20mM phosphate buffer NA; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2JXW Solution Structure of the Tandem WW Domains of FBP21 提交 2007-11-30 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 122–196(75 aa) 片段:WW Domian
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;293 K;压力 1
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;压力 1
NMR样品组成 1.0mM [U-99% 13C; U-99% 15N] FBP21; 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5mM [U-99% 15N] FBP21; 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致
链 Q 1–376(376 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致
链 X 1–376(376 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7OS1 Cryo-EM structure of Brr2 in complex with Fbp21 提交 2021-06-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 199–376(178 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致
链 4I 1–376(376 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致
链 4I 1–376(376 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致
链 X 1–376(376 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:71-meric(71) 与全部聚合物一致
链 X 1–376(376 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.29 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:20-meric(20) 与全部聚合物一致
链 X 1–376(376 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 61 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致
链 X 1–376(376 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å