当前蛋白身份:O75586 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7EMF Human Mediator (deletion of MED1-IDR) in a Tail-extended conformation 提交 2021-04-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白数一致
链 F 1–246(246 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:76-meric(76) 与全部聚合物一致
链 f 1–246(246 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:76-meric(76) 与全部聚合物一致
链 f 1–246(246 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
7ENJ Human Mediator (deletion of MED1-IDR) in a Tail-bent conformation (MED-B) 提交 2021-04-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白数一致
链 F 1–246(246 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 g 1–246(246 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:58-meric(58) 与全部聚合物一致
链 a 1–246(246 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 83 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致
链 f 1–246(246 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 83 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致
链 f 1–246(246 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
8T9D CryoEM structure of TR-TRAP 提交 2023-06-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白数一致
链 C 1–246(246 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
8TQW Structure of human transcriptional Mediator complex 提交 2023-08-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 29 PDB 声明:29-meric(29) 与蛋白数一致
链 F 1–246(246 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
8TRH The IDRc bound human core Mediator complex 提交 2023-08-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白数一致
链 F 1–246(246 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å