当前蛋白身份：O75626
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3DAL Methyltransferase domain of human PR domain-containing protein 1 提交 2008-05-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–187（186 aa）
链 B
2–187（186 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；Purified PRDM1 was crystallized using hanging drop vapor diffusion method at
20 C by mixing 1.5 l of the protein solution with 1.5 l of the reservoir
solution containing 2.0 M Na Formide, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.217 |
| 9Q1G Blimp-1 with compound 5 提交 2025-08-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
38–223（186 aa）
链 B
38–223（186 aa）
链 C
38–223（186 aa）
链 D
38–223（186 aa）
链 E
38–223（186 aa）
链 F
38–223（186 aa）
链 G
38–223（186 aa）
链 H
38–223（186 aa）
|
突变：37-222 突变：37-222 突变：37-222 突变：37-222 突变：37-222 突变：37-222 突变：37-222 突变：37-222 | A1CNQ (2S)-2-(4-bromophenyl)-2-(5,8-dihydropyrido[3,4-d]pyrimidin-7(6H)-yl)acetamide × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100mM Sodium Cacodylate pH 5.5, 15% w/v PEG 6k, 0.15M Potassium Thiocyanate
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分辨率 3.70 Å R-free 0.253 |
| 9Q33 Cereblon Ternary Complex with Blimp1 and compound 5 提交 2025-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
38–223（186 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
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分辨率 3.20 Å |