当前蛋白身份:O95639 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2D9N Solution structure of CCCH type zinc-finger domain 2 in Cleavage and polyadenylation specificity factor 提交 2005-12-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 61–126(66 aa) 片段:CCCH-type zinc finger motif
未记录 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM;压力 ambient
NMR样品组成 20mM d-Tris-HCl(pH7.0), 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02% NaN3, 50uM ZnCl2+1mM IDA, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2RHK Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A 提交 2007-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 61–121(61 aa) 片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
链 D 61–121(61 aa) 片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
突变:P94S 突变:P94S NO3 NITRATE ION × 5 ZN ZINC ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;293 K;0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50
分辨率 1.95 Å R-free 0.234
2RHK Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A 提交 2007-10-09 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 61–121(61 aa) 片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
链 D 61–121(61 aa) 片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
突变:P94S 突变:P94S NO3 NITRATE ION × 9 ZN ZINC ION × 6 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;293 K;0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50
分辨率 1.95 Å R-free 0.234
2RHK Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A 提交 2007-10-09 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 61–121(61 aa) 片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
链 D 61–121(61 aa) 片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
突变:P94S 突变:P94S NO3 NITRATE ION × 5 ZN ZINC ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;293 K;0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50
分辨率 1.95 Å R-free 0.234
2RHK Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A 提交 2007-10-09 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 61–121(61 aa) 片段:F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
突变:P94S NO3 NITRATE ION × 4 ZN ZINC ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5;293 K;0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50
分辨率 1.95 Å R-free 0.234
6DNH Cryo-EM structure of human CPSF-160-WDR33-CPSF-30-PAS RNA complex at 3.4 A resolution 提交 2018-06-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 C 1–244(244 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9;25 mM Tris-HCl, pH 7.9, 380 mM NaCl, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6FUW Cryo-EM structure of the human CPSF160-WDR33-CPSF30 complex bound to the PAS AAUAAA motif at 3.1 Angstrom resolution 提交 2018-02-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 C 1–178(178 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;15 seconds wait time prior to blotting
分辨率 3.07 Å
6URG Cryo-EM structure of human CPSF160-WDR33-CPSF30-CPSF100 PIM complex 提交 2019-10-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–244(244 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6URO Cryo-EM structure of human CPSF160-WDR33-CPSF30-PAS RNA-CstF77 complex 提交 2019-10-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 C 1–244(244 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7ZYH Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 118–178(61 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292.15 K;1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.264
7ZYH Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1 提交 2022-05-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 118–178(61 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292.15 K;1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.264
7ZYH Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1 提交 2022-05-24 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 G 118–178(61 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292.15 K;1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.264
7ZYH Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1 提交 2022-05-24 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 J 118–178(61 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292.15 K;1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.264
8E3I CRYO-EM STRUCTURE OF the human MPSF IN COMPLEX WITH THE AUUAAA poly(A) signal 提交 2022-08-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 C 1–244(244 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;25 mM Tris (pH 8.0), 150 mM NaCl, and 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.53 Å
8E3Q CRYO-EM STRUCTURE OF the human MPSF 提交 2022-08-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 1–244(244 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;25 mM Tris (pH 8.0), 150 mM NaCl, and 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
8R8R Cryo-EM structure of the human mPSF with PAPOA C-terminus peptide (PAPOAc) 提交 2023-11-29 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 C 2–244(243 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.79 Å
9OXE CRYO-EM STRUCTURE OF the human mPSF IN COMPLEX WITH THE AGUAAA poly(A) signal 提交 2025-06-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 C 1–244(244 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.53 Å
9OXS CRYO-EM STRUCTURE OF the human mPSF IN COMPLEX WITH THE AAUAAU poly(A) signal 提交 2025-06-04 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 C 1–244(244 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å