当前蛋白身份:P01009 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1ATU UNCLEAVED ALPHA-1-ANTITRYPSIN 提交 1997-05-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 45–418(374 aa)
突变:F51L, T59A, T68A, A70G, M374I, S381A, K387R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.0
分辨率 2.70 Å
1D5S CRYSTAL STRUCTURE OF CLEAVED ANTITRYPSIN POLYMER 提交 1999-10-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 44–377(334 aa) 片段:N-TERMINAL FRAGMENT
链 B 378–418(41 aa) 片段:C-TERMINAL FRAGMENT
突变:M358R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;295 K;PEG 4000 sodium citrate buffer t-butanol, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.00 Å R-free 0.262
1EZX CRYSTAL STRUCTURE OF A SERPIN:PROTEASE COMPLEX 提交 2000-05-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 48–382(335 aa) 片段:N-TERMINAL FRAGMENT OF PROTEOLYTIC CLEAVAGE AT MET358-SER359
链 B 383–418(36 aa) 片段:C-TERMINAL FRAGMENT OF PROTEOLYTIC CLEAVAGE AT MET358-SER359
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;PEG 3350, sodium citrate , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.239
1HP7 A 2.1 ANGSTROM STRUCTURE OF AN UNCLEAVED ALPHA-1-ANTITRYPSIN SHOWS VARIABILITY OF THE REACTIVE CENTER AND OTHER LOOPS 提交 2000-12-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 25–418(394 aa)
突变:A70G ZN ZINC ION × 5 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å R-free 0.273
1HP7 A 2.1 ANGSTROM STRUCTURE OF AN UNCLEAVED ALPHA-1-ANTITRYPSIN SHOWS VARIABILITY OF THE REACTIVE CENTER AND OTHER LOOPS 提交 2000-12-12 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 25–418(394 aa)
突变:A70G ZN ZINC ION × 10 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å R-free 0.273
1HP7 A 2.1 ANGSTROM STRUCTURE OF AN UNCLEAVED ALPHA-1-ANTITRYPSIN SHOWS VARIABILITY OF THE REACTIVE CENTER AND OTHER LOOPS 提交 2000-12-12 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 25–418(394 aa)
突变:A70G ZN ZINC ION × 10 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å R-free 0.273
1IZ2 Interactions causing the kinetic trap in serpin protein folding 提交 2002-09-19 Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 25–418(394 aa)
突变:F51L/T59A/T68A/A70G/R101H/V364A/M374I/E376D/S381A/K387R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;Ammonium Sulfate 1.8M, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.278
1KCT ALPHA1-ANTITRYPSIN 提交 1996-08-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 25–418(394 aa)
突变:T59A, T68A, A70G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;pH 8.5
分辨率 3.46 Å
1OO8 CRYSTAL STRUCTURE OF A1PI-PITTSBURGH IN THE NATIVE CONFORMATION 提交 2003-03-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa) 片段:RESIDUES 26-418
突变:F51L, T59A, T68A, A70G, C232S, M358R, M374I, S381A, K387R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;292 K;0.2M TRI-POTASSIUM CITRATE, 20% PEG-3350, pH 6.30, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.193
1OPH NON-COVALENT COMPLEX BETWEEN ALPHA-1-PI-PITTSBURGH AND S195A TRYPSIN 提交 2003-03-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa) 片段:alpha-1-antitrypsin (RESIDUES 26-418)
突变:F51L, T59A, T68A, A70G, C232S, M358R, M274I, S381A, K387R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;291 K;0.2 M tri-K-citrate, 17.5% PEG 3350, 2% GLYCEROL, pH 8.30, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.229
1OPH NON-COVALENT COMPLEX BETWEEN ALPHA-1-PI-PITTSBURGH AND S195A TRYPSIN 提交 2003-03-05 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa) 片段:alpha-1-antitrypsin (RESIDUES 26-418)
突变:F51L, T59A, T68A, A70G, C232S, M358R, M274I, S381A, K387R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;291 K;0.2 M tri-K-citrate, 17.5% PEG 3350, 2% GLYCEROL, pH 8.30, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.229
1PSI Intact recombined alpha1-antitrypsin mutant PHE 51 to LEU 提交 1996-06-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
突变:F51L 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;24% PEG, 0.2 M SODIUM ACETATE, 0.1 M TRIS.HCL, PH 6.0, 0.002 M FESO4, 25 DEG CELSIUS
分辨率 2.92 Å R-free 0.288
1QLP 2.0 ANGSTROM STRUCTURE OF INTACT ALPHA-1-ANTITRYPSIN: A CANONICAL TEMPLATE FOR ACTIVE SERPINS 提交 1999-09-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;24% PEG 4000, 0.2 M SODIUM ACETATE, 0.1M TRIS-HCL PH 6.0, 2MM FESO4.7H20
分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1QMB Cleaved alpha-1-antitrypsin polymer 提交 1999-09-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 49–69(21 aa) 片段:RESIDUES 49-69,71-302,304-376
链 A 71–302(232 aa) 片段:RESIDUES 49-69,71-302,304-376
链 A 304–376(73 aa) 片段:RESIDUES 49-69,71-302,304-376
链 B 377–418(42 aa) 片段:RESIDUES 377-418
突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;0.2M TRI-SODIUM CITRATE, 0.1M TRIS, PH 8.5, 30% PEG 400
分辨率 2.60 Å R-free 0.258
2D26 Active site distortion is sufficient for proteinase inhibit second crystal structure of covalent serpin-proteinase complex 提交 2005-09-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 25–382(358 aa) 片段:residues 1-358
链 B 383–418(36 aa) 片段:residues 359-394
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.1;291 K;PEG3350, pH 8.10, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.312
2QUG Crystal structure of alpha-1-antitrypsin, crystal form A 提交 2007-08-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 25–418(394 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;29% PEG 3350, 400 mM NaF, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K
分辨率 2.00 Å R-free 0.275
3CWL Crystal structure of alpha-1-antitrypsin, crystal form B 提交 2008-04-22 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 25–418(394 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4;295 K;27% PEG 4000, 0.2M Sodium Acetate, 100mM Tris-HCl, pH 8.4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K, pH 8.40
分辨率 2.44 Å R-free 0.264
3CWM Crystal structure of alpha-1-antitrypsin complexed with citrate 提交 2008-04-22 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 25–418(394 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.4;295 K;27% PEG 4000, 0.2M Sodium Acetate, 100mM Tris-HCl, pH 8.4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K
分辨率 2.51 Å R-free 0.271
3DRM 2.2 Angstrom Crystal Structure of Thr114Phe Alpha1-Antitrypsin 提交 2008-07-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
突变:T114F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;PEG 4000, Li2SO4, Tris/HCl, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.272
3DRU Crystal Structure of Gly117Phe Alpha1-Antitrypsin 提交 2008-07-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
突变:G117F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;PEG 4000, Li2SO4, Tris/HCl, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.290
3DRU Crystal Structure of Gly117Phe Alpha1-Antitrypsin 提交 2008-07-11 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 26–418(393 aa)
突变:G117F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;PEG 4000, Li2SO4, Tris/HCl, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.290
3DRU Crystal Structure of Gly117Phe Alpha1-Antitrypsin 提交 2008-07-11 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 26–418(393 aa)
突变:G117F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;PEG 4000, Li2SO4, Tris/HCl, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.290
3NDD Cleaved antitrypsin with P10 Pro, and P9-P6 Asp 提交 2010-06-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 46–382(337 aa) 片段:P1 cleaved antitrypsin, nterm, UNP residues 46-382
链 B 383–418(36 aa) 片段:P1 cleaved antitrypsin, cterm, UNP residues 383-418
突变:C232A, G349P, A350D, M351D, F352D, L353D, M358R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;295 K;0.1M MES/NaOH, 30% PEG 400, 35% glycerol, pH 6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 1.50 Å R-free 0.211
3NDF Cleaved antitrypsin with P8-P6 Asp 提交 2010-06-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 46–382(337 aa) 片段:P1 cleaved antitrypsin, nterm, UNP residues 46-382
链 B 383–418(36 aa) 片段:P1 cleaved antitrypsin, cterm, UNP residues 383-418
突变:C232A, M351D, F352D, L353D, M358R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;295 K;0.12M Alcohols (Morpheus), 0.1M Buffer 1, 13.3% PEG 550MME, 6.6% PEG 20000, 20% glycerol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
3NE4 1.8 Angstrom structure of intact native wild-type alpha-1-antitrypsin 提交 2010-06-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 48–418(371 aa) 片段:UNP residues 48-418
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;0.1 M MMT Buffer, 20 % PEG 1500 and N-[4-hydroxy-3-methyl-5- [(1H-1,2,4,5-tetrazol-3-yl)sulfanyl] phenyl]-4-methylbenzenesulfonamide, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.81 Å R-free 0.233
3T1P Crystal structure of an alpha-1-antitrypsin trimer 提交 2011-07-22 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 48–418(371 aa) 片段:unp residues 48-418
突变:C256S, S316C, T363C, M382R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;18% (w/w) ethanol, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.90 Å R-free 0.297
4PYW 1.92 angstrom crystal structure of A1AT:TTAI ternary complex 提交 2014-03-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;26% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 1.91 Å R-free 0.225
5IO1 CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT HUMAN Z ALPHA-1-ANTITRYPSIN 提交 2016-03-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 29–418(390 aa) 片段:UNP residues 29-418
突变:E342L, T345C, M358A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 6.5;293 K;20-30% PEG8000, 0.2M NACL, 0.1M MES, PH 6.5, EVAPORATION, TEMPERATURE 298K
分辨率 3.34 Å R-free 0.275
5IO1 CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT HUMAN Z ALPHA-1-ANTITRYPSIN 提交 2016-03-08 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 29–418(390 aa) 片段:UNP residues 29-418
突变:E342L, T345C, M358A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 6.5;293 K;20-30% PEG8000, 0.2M NACL, 0.1M MES, PH 6.5, EVAPORATION, TEMPERATURE 298K
分辨率 3.34 Å R-free 0.275
5NBU Crystal structure of native alpha-1-antitrypsin with seven stabilising mutations 提交 2017-03-02 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 43–418(376 aa)
突变:F51L, T59A, T68A, A70G, C232S, M374I, S381A, K387R GOL GLYCEROL × 2 OXM OXAMIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG 4000, carboxylic acid mixture
分辨率 1.67 Å R-free 0.228
5NBV Crystal structure of native alpha-1-antitrypsin with seven stabilising mutations 提交 2017-03-02 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 43–418(376 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG 4000, carboxylic acid mixture
分辨率 1.73 Å R-free 0.259
6HX4 Fab fragment of a native monomer-selective antibody in complex with alpha-1-antitrypsin 提交 2018-10-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 24–418(395 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;15% PEG 4000, 0.1M sodium cacodylate pH 6
分辨率 2.95 Å R-free 0.277
6HX4 Fab fragment of a native monomer-selective antibody in complex with alpha-1-antitrypsin 提交 2018-10-15 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 24–418(395 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;15% PEG 4000, 0.1M sodium cacodylate pH 6
分辨率 2.95 Å R-free 0.277
6I3Z Fab fragment of an antibody selective for wild-type alpha-1-antitrypsin in complex with its antigen 提交 2018-11-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 26–377(352 aa)
链 B 378–418(41 aa)
未记录 NA SODIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;289 K;20% PEG 3350, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.307
6I4V Alpha-1-antitrypsin Queen's (K154N) variant 提交 2018-11-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
突变:K154N GLY GLYCINE × 2 H3B 3-trimethylsilylpropane-1-sulfonic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.75;293 K;20% PEG 1500, 0.1M SPG (succinate-phosphate-glycine), 0.5mM DSS (4,4-dimethyl-4-silapentane-1-sulfonic acid)
分辨率 1.78 Å R-free 0.213
6I7U Alpha-1-antitrypsin (Ala250Met) in the native conformation 提交 2018-11-19 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
突变:A250M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;22.5% PEG 1500, 0.1M SPG (succinate-phosphate-glycine) pH 5.5
分辨率 1.55 Å R-free 0.211
6IAY Alpha-1-antitrypsin Queen's (Lys154Asn) variant 提交 2018-11-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
突变:K154N GLY GLYCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.75;293 K;22.5% PEG 1500, 0.1M SPG (succinate-phosphate-glycine) pH 5.75
分辨率 1.90 Å R-free 0.241
6ROD Alpha-1-antitrypsin (Ser36Arg/Glu78Arg/Glu266Arg) in the native conformation 提交 2019-05-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
突变:S36R, E78R, E266R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.25;293 K;22.5% PEG 1500, 0.1M SPG (succinate-phosphate-glycine) pH 5.25
分辨率 1.85 Å R-free 0.223
7AEL alpha 1-antitrypsin (C232S) complexed with GSK716 提交 2020-09-17 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 AAA 26–418(393 aa)
未记录 R7Z ~{N}-[(1~{S},2~{R})-1-(3-fluoranyl-2-methyl-phenyl)-1-oxidanyl-pentan-2-yl]-2-oxidanylidene-1,3-dihydroindole-4-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;22% PEG1500, 0.2M MES pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.224
7API THE S VARIANT OF HUMAN ALPHA1-ANTITRYPSIN, STRUCTURE AND IMPLICATIONS FOR FUNCTION AND METABOLISM 提交 1988-09-08 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 36–382(347 aa)
链 B 383–418(36 aa)
未记录 CYS CYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
7NPK ALPHA-1 ANTITRYPSIN C232S COMPLEXED WITH CMPD3 提交 2021-02-27 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–417(392 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 UL2 N-((1S,2R)-1-hydroxy-1-(o-tolyl)pentan-2-yl)-2-oxo-2,3-dihydrobenzo[d]oxazole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;14% w/v PEG1500, 0.2M MES pH6.0
分辨率 1.83 Å R-free 0.233
7NPL ALPHA-1 ANTITRYPSIN (C232S) COMPLEXED WITH cmpd 11 提交 2021-02-27 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
未记录 UKZ N-((1S,2R)-1-(3-chloro-2-methylphenyl)-1-hydroxypentan-2-yl)-2-oxoindoline-4-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;14% PEG1500 0.1M MES pH6.0
分辨率 1.82 Å R-free 0.218
8API THE S VARIANT OF HUMAN ALPHA1-ANTITRYPSIN, STRUCTURE AND IMPLICATIONS FOR FUNCTION AND METABOLISM 提交 1988-09-08 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 36–382(347 aa)
链 B 383–418(36 aa)
未记录 CYS CYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å
8P4J Alpha-1-antitrypsin - Sydney variant (G192C) 提交 2023-05-22 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
突变:G192C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;294 K;0.1M MIB pH 5.5 25% PEG 1500
分辨率 1.91 Å R-free 0.253
8P4U Alpha-1-antitrypsin - Sydney variant (G192C) 提交 2023-05-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;294 K;0.1M MIB pH 5.5 25% PEG 1500
分辨率 2.40 Å R-free 0.254
8PI2 Native alpha-1-antitrypsin at 1.5 Angstrom (Cys232Ser) 提交 2023-06-20 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
突变:C232S GLY GLYCINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.75;294 K;0.1M malonate-imidazole-borate pH5.75, 25% PEG1500
分辨率 1.48 Å R-free 0.195
8QZ5 Alpha-1-antitrypsin (Tyr244Phe) in the native conformation 提交 2023-10-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
突变:Y244F 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.75;293 K;25% PEG 1500, 0.1M SPG (succinate-phosphate-glycine) pH 5.75
分辨率 1.69 Å R-free 0.213
8R13 Alpha-1-antitrypsin (Met374Phe) in the native conformation 提交 2023-11-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
突变:M374F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;22.5% PEG 1500, 0.1M MIB (malonate-imidazole-borate) pH 5.25
分辨率 1.95 Å R-free 0.235
8R21 Alpha-1-antitrypsin (Ile340Trp) in the native conformation 提交 2023-11-02 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
突变:I340W 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.25;293 K;0.1M SPG (succinate-phosphate-glycine) pH 5.25, 17.5% PEG1500
分辨率 2.88 Å R-free 0.242
8R21 Alpha-1-antitrypsin (Ile340Trp) in the native conformation 提交 2023-11-02 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 26–418(393 aa)
突变:I340W 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.25;293 K;0.1M SPG (succinate-phosphate-glycine) pH 5.25, 17.5% PEG1500
分辨率 2.88 Å R-free 0.242
9API THE S VARIANT OF HUMAN ALPHA1-ANTITRYPSIN, STRUCTURE AND IMPLICATIONS FOR FUNCTION AND METABOLISM 提交 1988-09-08 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 36–382(347 aa)
链 B 383–418(36 aa)
未记录 CYS CYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
9GGP Alpha-1-antitrypsin in complex with the Fab fragment of an anti-polymer antibody 提交 2024-08-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 26–418(393 aa)
链 B 26–418(393 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.1;293 K;0.2 M Ammonium citrate dibasic 20% w/v Polyethylene glycol 3,350 pH 5.1
分辨率 1.84 Å R-free 0.206
9HUD Alpha-1-antitrypsin in the cleaved conformation in complex with a conformationally nonselective Fab fragment 提交 2024-12-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 26–378(353 aa)
链 B 379–418(40 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GLY GLYCINE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M sodium HEPES, MOPS 0.1M DL-Glutamic acid monohydrate; 0.1M DL-Alanine; 0.1M Glycine; 0.1M DL-Lysine 40% v/v Glycerol; 20% w/v PEG 4000
分辨率 2.42 Å R-free 0.247
9HUD Alpha-1-antitrypsin in the cleaved conformation in complex with a conformationally nonselective Fab fragment 提交 2024-12-22 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 26–378(353 aa)
链 D 379–418(40 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GLY GLYCINE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 LYS LYSINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M sodium HEPES, MOPS 0.1M DL-Glutamic acid monohydrate; 0.1M DL-Alanine; 0.1M Glycine; 0.1M DL-Lysine 40% v/v Glycerol; 20% w/v PEG 4000
分辨率 2.42 Å R-free 0.247
9VDI Crystal structure of the recombinant A1-antitrypsin F51L/M351V/M358V triple mutant 提交 2025-06-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 47–418(372 aa)
突变:F51L,M351V,M358V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Tris (pH 8.5), and 25% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.254
9VDI Crystal structure of the recombinant A1-antitrypsin F51L/M351V/M358V triple mutant 提交 2025-06-08 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 47–418(372 aa)
突变:F51L,M351V,M358V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Tris (pH 8.5), and 25% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.254