当前蛋白身份:P01139 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1BET NEW PROTEIN FOLD REVEALED BY A 2.3 ANGSTROM RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF NERVE GROWTH FACTOR 提交 1993-04-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 131–237(107 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1BTG CRYSTAL STRUCTURE OF BETA NERVE GROWTH FACTOR AT 2.5 A RESOLUTION IN C2 SPACE GROUP WITH ZN IONS BOUND 提交 1995-08-29 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 130–239(110 aa)
链 B 130–239(110 aa)
链 C 130–239(110 aa)
突变:BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) 突变:BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) 突变:BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1BTG CRYSTAL STRUCTURE OF BETA NERVE GROWTH FACTOR AT 2.5 A RESOLUTION IN C2 SPACE GROUP WITH ZN IONS BOUND 提交 1995-08-29 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 130–239(110 aa)
突变:BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1BTG CRYSTAL STRUCTURE OF BETA NERVE GROWTH FACTOR AT 2.5 A RESOLUTION IN C2 SPACE GROUP WITH ZN IONS BOUND 提交 1995-08-29 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 130–239(110 aa)
链 C 130–239(110 aa)
突变:BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) 突变:BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1BTG CRYSTAL STRUCTURE OF BETA NERVE GROWTH FACTOR AT 2.5 A RESOLUTION IN C2 SPACE GROUP WITH ZN IONS BOUND 提交 1995-08-29 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 130–239(110 aa)
链 C 130–239(110 aa)
突变:BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) 突变:BIS-DES-OCTA (MISSING RESIDUES 1-8, PROTEOLYTICALLY CLEAVED) ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1SGF CRYSTAL STRUCTURE OF 7S NGF: A COMPLEX OF NERVE GROWTH FACTOR WITH FOUR BINDING PROTEINS (SERINE PROTEINASES) 提交 1997-08-08 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 122–239(118 aa)
链 Y 122–239(118 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.9;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 20MG/ML PROTEIN SOLUTION IN 50MM SODIUM PHOSPHATE (PH6.8) MIXED WITH AN EQUAL VOLUME OF WELL SOLUTION (50MM SODIUM ACETATE PH4.5-5.1, 12-21% PEG 4000, 10 MICROMOLAR ZNSO4) (MCDONALD AND BLUNDELL, 1991, JMB, 219, 595-601)., pH 4.9
分辨率 3.15 Å R-free 0.282
3IJ2 Ligand-receptor structure 提交 2009-08-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 129–351(223 aa) 片段:UNP RESIDUES 129-241
链 B 129–351(223 aa) 片段:UNP RESIDUES 129-241
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.75 Å R-free 0.274
4EAX Mouse NGF in complex with Lyso-PS 提交 2012-03-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 122–241(120 aa)
链 B 122–241(120 aa)
未记录 S12 O-[(S)-hydroxy{[(2S)-2-hydroxy-3-(octadec-9-enoyloxy)propyl]oxy}phosphoryl]-L-serine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;0.1M Imidazole, 1.0M Sodium Acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.30 Å R-free 0.259
4EAX Mouse NGF in complex with Lyso-PS 提交 2012-03-23 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 122–241(120 aa)
链 D 122–241(120 aa)
未记录 S12 O-[(S)-hydroxy{[(2S)-2-hydroxy-3-(octadec-9-enoyloxy)propyl]oxy}phosphoryl]-L-serine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;0.1M Imidazole, 1.0M Sodium Acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.30 Å R-free 0.259
4XPJ Crystal structure of Nerve growth factor in complex with lysophosphatidylinositol 提交 2015-01-17 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 122–241(120 aa)
链 B 122–241(120 aa)
未记录 LPY (2R)-2-hydroxy-3-{[(S)-hydroxy{[(1S,2R,3R,4S,5S,6R)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl tridecanoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;0.1 M imidazole, 1.0 M Na acetate
分辨率 2.60 Å R-free 0.266
5LSD Recombinant mouse Nerve Growth Factor 提交 2016-08-25 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 122–239(118 aa)
链 B 122–239(118 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;303 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR测量条件 pH 7;308 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR样品组成 0.1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Nerve Growth Factor, 50 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
6FFY Structure of the mouse SorCS2-NGF complex 提交 2018-01-09 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 122–238(117 aa)
链 C 122–238(117 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;291 K;0.225 M MES/bis-tris pH 6.6 and 6.6 % w/v PEG 6000
分辨率 3.90 Å R-free 0.305