当前蛋白身份:P01863
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1GGI CRYSTAL STRUCTURE OF AN HIV-1 NEUTRALIZING ANTIBODY 50.1 IN COMPLEX WITH ITS V3 LOOP PEPTIDE ANTIGEN 提交 1993-04-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 H
1–107(107 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å |
| 1GGI CRYSTAL STRUCTURE OF AN HIV-1 NEUTRALIZING ANTIBODY 50.1 IN COMPLEX WITH ITS V3 LOOP PEPTIDE ANTIGEN 提交 1993-04-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 J
1–107(107 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å |
| 1IGT STRUCTURE OF IMMUNOGLOBULIN 提交 1996-10-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
1–326(326 aa)
链 D
1–326(326 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8;291 K;7 MICROLITERS OF 4.3 MG/ML MAB231, 3 MICROLITERS 50 MILLIMOLAR TRIS PH 8.0, AND 7 MICROLITERS 4% PEG 3350 EQUILIBRATED AGAINST 25 ML RESERVOIRS OF 4% PEG 3350, AT 18 DEGREE CELSIUS (SANDWICH PLATE)., temperature 291K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.297 |
| 1YEC STRUCTURE OF A CATALYTIC ANTIBODY IGG2A FAB FRAGMENT (D2.3) 提交 1997-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
1–99(99 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 7 PNB 4-NITRO-BENZYLPHOSPHONOBUTANOYL-GLYCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
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分辨率 1.90 Å R-free 0.252 |
| 1YEC STRUCTURE OF A CATALYTIC ANTIBODY IGG2A FAB FRAGMENT (D2.3) 提交 1997-04-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
1–99(99 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 7 PNB 4-NITRO-BENZYLPHOSPHONOBUTANOYL-GLYCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.252 |
| 1YEF STRUCTURE OF IGG2A FAB FRAGMENT (D2.3) COMPLEXED WITH SUBSTRATE ANALOGUE 提交 1997-05-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
1–99(99 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 PNC PARA-NITROBENZYL GLUTARYL GLYCINIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;HANGING DROP METHOD. PRECIPITANT: 30% (W/V) PEG 600, 100MM CACODYLATE PH7.5, 40MM ZN ACETATE., vapor diffusion - hanging drop
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分辨率 2.00 Å R-free 0.248 |
| 1YEG STRUCTURE OF IGG2A FAB FRAGMENT (D2.3) COMPLEXED WITH REACTION PRODUCT 提交 1997-05-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
1–99(99 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 7 BPN PARANITROBENZYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;HANGING DROP METHOD. PRECIPITANT: 30% (W/V) PEG 600, 100MM CACODYLATE PH7.5, 40MM ZN ACETATE., vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 1YEG STRUCTURE OF IGG2A FAB FRAGMENT (D2.3) COMPLEXED WITH REACTION PRODUCT 提交 1997-05-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
1–99(99 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 7 BPN PARANITROBENZYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;HANGING DROP METHOD. PRECIPITANT: 30% (W/V) PEG 600, 100MM CACODYLATE PH7.5, 40MM ZN ACETATE., vapor diffusion - hanging drop
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分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 1YEH STRUCTURE OF IGG2A FAB FRAGMENT 提交 1997-05-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
1–99(99 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;HANGING DROP METHOD. PRECIPITANT: 35% (W/V) PEG 600, 100MM CACODYLATE PH7.5, 40MM ZN ACETATE., vapor diffusion - hanging drop
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分辨率 2.55 Å R-free 0.231 |
| 1YEH STRUCTURE OF IGG2A FAB FRAGMENT 提交 1997-05-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
1–99(99 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;HANGING DROP METHOD. PRECIPITANT: 35% (W/V) PEG 600, 100MM CACODYLATE PH7.5, 40MM ZN ACETATE., vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.231 |
| 3OZ9 Crystal Structure of anti-gp41 Fab NC-1 提交 2010-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
1–100(100 aa)
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未记录 | GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;1.13M sodium citrate, 0.1M sodium borate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
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分辨率 1.60 Å R-free 0.233 |
| 3ZO0 Mouse IgG2a in complex with mouse TRIM21 PRYSPRY 提交 2013-02-19 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
120–327(208 aa)
片段:FC, RESIDUES 120-327
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未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 2 FUC alpha-L-fucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.99 Å R-free 0.253 |
| 5VAA Crystal structure of mouse IgG2a Fc T370K mutant 提交 2017-03-24 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
107–330(224 aa)
片段:UNP residues 107-330
链 B
107–330(224 aa)
片段:UNP residues 107-330
|
突变:T370K 突变:T370K | GOL GLYCEROL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;40% (w/v) PEG 200, 0.1 M MES, pH 6.5
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分辨率 1.55 Å R-free 0.195 |
| 8AQW BA.4/5 SARS-CoV-2 Spike bound to mouse ACE2 (local) 提交 2022-08-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
98–330(233 aa)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å |
| 9RBQ Semliki Forest virus trimer 1 in complex with ApoER2 LA5 提交 2025-05-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:13-meric(13) 与蛋白数一致 |
链 A
99–330(232 aa)
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.70 Å |