当前蛋白身份：P01888
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BMG CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE BETA2-MICROGLOBULIN 提交 1995-07-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
21–118（98 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.290 |
| 2XFX cattle MHC class I N01301 presenting an 11mer from Theileria parva 提交 2010-05-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
20–118（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；20% PEG 8000, 50MM POTASSIUM PHOSPHATE, PH 7.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.238 |
| 3L9R Crystal structure of bovine CD1b3 with endogenously bound ligands 提交 2010-01-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
21–118（98 aa）
片段：UNP residues 21-118
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 L9R (2S)-3-(octadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na cacodylate pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 3L9R Crystal structure of bovine CD1b3 with endogenously bound ligands 提交 2010-01-05 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
21–118（98 aa）
片段：UNP residues 21-118
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 3 L9Q (1S)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(octadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na cacodylate pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 3L9R Crystal structure of bovine CD1b3 with endogenously bound ligands 提交 2010-01-05 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
21–118（98 aa）
片段：UNP residues 21-118
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 L9R (2S)-3-(octadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na cacodylate pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 3L9R Crystal structure of bovine CD1b3 with endogenously bound ligands 提交 2010-01-05 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
21–118（98 aa）
片段：UNP residues 21-118
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 4 L9Q (1S)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(octadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na cacodylate pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 3PWV An immmunodominant CTL epitope from rinderpest virus presented by cattle MHC class I molecule N*01801 (BoLA-A11) 提交 2010-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
21–118（98 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 3PWV An immmunodominant CTL epitope from rinderpest virus presented by cattle MHC class I molecule N*01801 (BoLA-A11) 提交 2010-12-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
21–118（98 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 4F7C Crystal structure of bovine CD1d with bound C12-di-sulfatide 提交 2012-05-15 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
21–118（98 aa）
片段：UNP residues 21-118
|
未记录 | 0SG N-{(2S,3R,4E)-1-[(3,6-di-O-sulfo-beta-D-galactopyranosyl)oxy]-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl}dodecanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG3350, 200 mM sodium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.86 Å R-free 0.291 |
| 4F7C Crystal structure of bovine CD1d with bound C12-di-sulfatide 提交 2012-05-15 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
21–118（98 aa）
片段：UNP residues 21-118
|
未记录 | 0SG N-{(2S,3R,4E)-1-[(3,6-di-O-sulfo-beta-D-galactopyranosyl)oxy]-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl}dodecanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG3350, 200 mM sodium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.86 Å R-free 0.291 |
| 4F7E Crystal structure of bovine CD1d with bound C16:0-alpha-galactosyl ceramide 提交 2012-05-15 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
21–118（98 aa）
片段：UNP residues 21-118
|
未记录 | 0SH N-[(2S,3S,4R)-1-(alpha-D-galactopyranosyloxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]hexadecanamide × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG4000, 200 mM potassium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.276 |
| 4IIQ Crystal structure of a human MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2012-12-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
21–118（98 aa）
片段：UNP C1ITJ8 residues 19-295, UNP P01888 residues 21-118
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.5 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.86 Å R-free 0.271 |
| 4L8S Crystal structure of a human Valpha7.2/Vbeta13.3 MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2013-06-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
21–118（98 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.7 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.278 |
| 4L9L Crystal structure of a human Valpha7.2/Vbeta13.2 MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2013-06-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
21–118（98 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.6 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.312 |
| 4L9L Crystal structure of a human Valpha7.2/Vbeta13.2 MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2013-06-18 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
21–118（98 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.6 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.312 |
| 4LCC Crystal structure of a human MAIT TCR in complex with a bacterial antigen bound to humanized bovine MR1 提交 2013-06-21 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
21–118（98 aa）
片段：P01888 residues 21-118, C1ITJ8 residues 19-295
|
突变：A185M, R260Q, Q264L | 1XL 1-deoxy-1-[6-(hydroxymethyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropteridin-8(2H)-yl]-D-arabinitol × 1 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.5 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
|
分辨率 3.26 Å R-free 0.312 |
| 7RNO Model of the Ac-6-FP/hpMR1/bB2m/TAPBPR complex from integrated docking, NMR and restrained MD 提交 2021-07-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
21–118（98 aa）
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未记录 | 30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；298.15 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1.01325
NMR样品组成
100 uM hpMR1 (human platform MR1), 100 uM [U-100% 12C; U-100% 15N; Ala CB, Ile CD1, Leu CD1/CD2, Val CG1/CG2] bovine beta 2 microglobulin, 300 uM TAPBPR, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |