当前蛋白身份：P03051
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B6Q ALANINE 31 PROLINE MUTANT OF ROP PROTEIN 提交 1999-01-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
|
突变：A31P | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.3；pH 4.3
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.240 |
| 1F4M P3(2) CRYSTAL STRUCTURE OF ALA2ILE2-6, A VERSION OF ROP WITH A REPACKED HYDROPHOBIC CORE AND A NEW FOLD. 提交 2000-06-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
链 B
1–63（63 aa）
|
突变：M1G,A8I,T19A,L22I,L26A,Q34I,C38A,L41I,L48I,C52A 突变：M1G,A8I,T19A,L22I,L26A,Q34I,C38A,L41I,L48I,C52A | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；MPD, calcium chloride, sodium HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.282 |
| 1F4M P3(2) CRYSTAL STRUCTURE OF ALA2ILE2-6, A VERSION OF ROP WITH A REPACKED HYDROPHOBIC CORE AND A NEW FOLD. 提交 2000-06-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–63（63 aa）
链 D
1–63（63 aa）
|
突变：M1G,A8I,T19A,L22I,L26A,Q34I,C38A,L41I,L48I,C52A 突变：M1G,A8I,T19A,L22I,L26A,Q34I,C38A,L41I,L48I,C52A | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；MPD, calcium chloride, sodium HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.282 |
| 1F4M P3(2) CRYSTAL STRUCTURE OF ALA2ILE2-6, A VERSION OF ROP WITH A REPACKED HYDROPHOBIC CORE AND A NEW FOLD. 提交 2000-06-08 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–63（63 aa）
链 F
1–63（63 aa）
|
突变：M1G,A8I,T19A,L22I,L26A,Q34I,C38A,L41I,L48I,C52A 突变：M1G,A8I,T19A,L22I,L26A,Q34I,C38A,L41I,L48I,C52A | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；MPD, calcium chloride, sodium HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.282 |
| 1F4N C2 CRYSTAL STRUCTURE OF ALA2ILE2-6, A VERSION OF ROP WITH A REPACKED HYDROPHOBIC CORE AND A NEW FOLD. 提交 2000-06-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
链 B
1–63（63 aa）
|
突变：M1G,A8I,T19A,L22I,L26A,Q34I,C38A,L41I,L48I,C52A 突变：M1G,A8I,T19A,L22I,L26A,Q34I,C38A,L41I,L48I,C52A | CA CALCIUM ION × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；MPD, calcium chloride, sodium HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.237 |
| 1F4N C2 CRYSTAL STRUCTURE OF ALA2ILE2-6, A VERSION OF ROP WITH A REPACKED HYDROPHOBIC CORE AND A NEW FOLD. 提交 2000-06-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
链 B
1–63（63 aa）
|
突变：M1G,A8I,T19A,L22I,L26A,Q34I,C38A,L41I,L48I,C52A 突变：M1G,A8I,T19A,L22I,L26A,Q34I,C38A,L41I,L48I,C52A | CA CALCIUM ION × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；MPD, calcium chloride, sodium HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.237 |
| 1GMG ALANINE 31 PROLINE MUTANT OF ROP PROTEIN, MONOCLINIC FORM 提交 2001-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
|
突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.8；37% (V/V) ETHANOL, 450 MM NACL, 50 MM CITRATE BUFFER PH4.8, 1MM EDTA, USING THE DIALYSIS METHOD., pH 4.80
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.232 |
| 1GMG ALANINE 31 PROLINE MUTANT OF ROP PROTEIN, MONOCLINIC FORM 提交 2001-09-13 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–63（63 aa）
|
突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.8；37% (V/V) ETHANOL, 450 MM NACL, 50 MM CITRATE BUFFER PH4.8, 1MM EDTA, USING THE DIALYSIS METHOD., pH 4.80
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.232 |
| 1GTO HIGH RESOLUTION STRUCTURE OF A HYPERSTABLE HELICAL BUNDLE PROTEIN MUTANT 提交 1996-04-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–62（61 aa）
|
突变：M1G, D30G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.82 Å R-free 0.280 |
| 1GTO HIGH RESOLUTION STRUCTURE OF A HYPERSTABLE HELICAL BUNDLE PROTEIN MUTANT 提交 1996-04-23 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–62（61 aa）
链 C
2–62（61 aa）
|
突变：M1G, D30G 突变：M1G, D30G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.82 Å R-free 0.280 |
| 1NKD ATOMIC RESOLUTION (1.07 ANGSTROMS) STRUCTURE OF THE ROP MUTANT <2AA> 提交 1997-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
|
突变：INS(A-D31-A) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.09 Å R-free 0.134 |
| 1QX8 Crystal structure of a five-residue deletion mutant of the Rop protein 提交 2003-09-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
链 B
1–63（63 aa）
|
突变：Deletion [30D-34Q] 突变：Deletion [30D-34Q] | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；NaCl, methanol, Bis-Tris, DTT, EDTA, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.212 |
| 1ROP STRUCTURE OF THE COL*E1 ROP PROTEIN AT 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1991-04-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1RPO RESTORED HEPTAD PATTERN CONTINUITY DOES NOT ALTER THE FOLDING OF A 4-ALPHA-HELICAL BUNDLE 提交 1994-08-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.40 Å |
| 1RPR THE STRUCTURE OF COLE1 ROP IN SOLUTION 提交 1991-10-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
链 B
1–63（63 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1YO7 Re-engineering topology of the homodimeric ROP protein into a single-chain 4-helix bundle 提交 2005-01-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–56（56 aa）
链 A
32–56（25 aa）
链 A
3–29（27 aa）
|
突变：R55S 突变：R55S 突变：R55S | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；10% PEG 2000, 50mM Tris-HCl pH6.6, 40mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.310 |
| 1YO7 Re-engineering topology of the homodimeric ROP protein into a single-chain 4-helix bundle 提交 2005-01-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–56（56 aa）
链 B
32–56（25 aa）
链 B
3–29（27 aa）
|
突变：R55S 突变：R55S 突变：R55S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；10% PEG 2000, 50mM Tris-HCl pH6.6, 40mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.310 |
| 2GHY Novel Crystal Form of the ColE1 Rom Protein 提交 2006-03-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
链 B
1–63（63 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；30% PEG MME 2000, 0.1M sodium acetate, pH4.6, and 0.2M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.263 |
| 2IJH Crystal structure analysis of ColE1 ROM mutant F14W 提交 2006-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
链 B
1–63（63 aa）
|
突变：M1G, F14W 突变：M1G, F14W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；273 K；Well solution: 20% glycerol, 0.1 M sodium acetate pH 5.5, 0.1 M sodium chloride. Protein solution: protein 5 mg/ml, 0.01 M Tris pH 6.8, 0.05 M sodium chloride. Drops: equal volumes of well and protein solutions., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 2IJH Crystal structure analysis of ColE1 ROM mutant F14W 提交 2006-09-29 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–63（63 aa）
|
突变：M1G, F14W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；273 K；Well solution: 20% glycerol, 0.1 M sodium acetate pH 5.5, 0.1 M sodium chloride. Protein solution: protein 5 mg/ml, 0.01 M Tris pH 6.8, 0.05 M sodium chloride. Drops: equal volumes of well and protein solutions., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 2IJI Structure of F14H mutant of ColE1 Rom protein 提交 2006-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
|
突变：M1G, F14H | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；1uL protein solution (0.5-1 mM) was mixed with 1 uL well buffer (0.1M sodium acetate pH 5.5, 0.1M sodium chloride, 37 40% ethanol, and 20% glycerol), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.292 |
| 2IJJ Crystal structure analysis of ColE1 ROM mutant F14Y 提交 2006-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
链 B
1–63（63 aa）
|
突变：M1G, F14Y 突变：M1G, F14Y | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；273 K；Well solution: 22% MPD, 0.1 M sodium acetate pH 5.5, 0.1 M sodium chloride. Protein solution: protein 2.5 mg/ml, 0.01 M Tris pH 6.5, 0.05 M sodium chloride. Drops: equal volumes of well and protein solutions., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.263 |
| 2IJJ Crystal structure analysis of ColE1 ROM mutant F14Y 提交 2006-09-29 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–63（63 aa）
|
突变：M1G, F14Y | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；273 K；Well solution: 22% MPD, 0.1 M sodium acetate pH 5.5, 0.1 M sodium chloride. Protein solution: protein 2.5 mg/ml, 0.01 M Tris pH 6.5, 0.05 M sodium chloride. Drops: equal volumes of well and protein solutions., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.263 |
| 2IJK Structure of a Rom protein dimer at 1.55 angstrom resolution 提交 2006-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
链 B
1–63（63 aa）
|
突变：M1G 突变：M1G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；Hanging drop contained 1 uL protein/RNA mixture (0.3 0.4 mM complex) and 1 uL well buffer (50 mM sodium cacodylate pH 6.0, 0.1 M potassium chloride, 25 mM magnesium chloride, and 15% isopropanol)., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.216 |
| 3K79 C38A, C52V Cysteine-Free Variant of Rop (Rom) 提交 2009-10-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–63（62 aa）
|
突变：C38A, C52V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；25-30% methanol, 100 mM MES, 300 mM NaCl, 10% glycerol, pH 5.7-5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.250 |
| 4DO2 Crystal Structure of the Rop protein mutant D30P/A31G at resolution 1.4 resolution. 提交 2012-02-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–63（63 aa）
链 B
1–63（63 aa）
|
突变：D30P, A31G 突变：D30P, A31G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；45%(v/v) methanol, 50 mM HEPES pH 6.4 and 100 mM Li2SO4, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.188 |
| 7KAE Rop protein variant with a buried tryptophan 提交 2020-09-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–57（56 aa）
片段：engineered variant
链 B
2–57（56 aa）
片段：engineered variant
|
突变：R16Q, S17N, L20Q, C38A, C52A, F56W 突变：R16Q, S17N, L20Q, C38A, C52A, F56W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；28% (w/v) PEG 400, 300 mM NaCl, 100 mM NaHEPES
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.224 |