当前蛋白身份：P03120
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BY9 CRYSTAL STRUCTURE OF THE E2 DNA-BINDING DOMAIN FROM HUMAN PAPILLOMAVIRUS TYPE-16: IMPLICATIONS FOR ITS DNA BINDING-SITE SELECTION MECHANISM 提交 1998-10-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
285–365（81 aa）
片段：DNA-BINDING DOMAIN
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.2；pH 6.2
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分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 1DTO CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLETE TRANSACTIVATION DOMAIN OF E2 PROTEIN FROM THE HUMAN PAPILLOMAVIRUS TYPE 16 提交 2000-01-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–201（201 aa）
片段：TRANSACTIVATION DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；291 K；monomethylether PEG 5000, NaCl, isopropanol, triethanolamine,Tris-HCl, DTT, EDTA, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.0K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.305 |
| 1R8P HPV-16 E2C solution structure 提交 2003-10-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
286–365（80 aa）
片段：DNA binding domain
链 B
286–365（80 aa）
片段：DNA binding domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM Phosphate；压力 ambient
NMR样品组成
1.8mM 15N-labeled HPV-16 E2C, 50mM Sodium Phosphate, 5mM DTT | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.9mM 13C,15N-labeled HPV-16 E2C, 50mM Sodium Phosphate, 5mM DTT | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.2mM 15N-labeled HPV-16 E2C, 50mM Sodium Phosphate, 5mM DTT | 6% polyacrylamide gel
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分辨率未提供 |
| 1ZZF The DNA-bound solution structure of HPV-16 E2 DNA-binding domain 提交 2005-06-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
286–365（80 aa）
片段：DNA-binding domain
链 B
286–365（80 aa）
片段：DNA-binding domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.6；318 K；离子强度（mmCIF原始值）250 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
DNA-E2C complex (15N) 0.6mM, 25mM Acetate+ 10mM Phosphate, pH 5.6, NaCl 250mM, DTT 5mM | 95% H20, 5% D2O
NMR样品组成
DNA-E2C complex (15N, 13C) 0.6mM, 25mM Acetate+ 10mM Phosphate, pH 5.6, NaCl 250mM, DTT 5mM | 95% H20, 5% D2O
NMR样品组成
DNA-E2C complex (15N) 0.2mM, 25mM Acetate+ 10mM Phosphate, pH 5.6, NaCl 250mM, DTT 5mM, Philamentosus phage 17mg/ml | 95% H20, 5% D2O
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分辨率未提供 |
| 2NNU Crystal Structure of the Papillomavirus DNA Tethering Complex E2:Brd4 提交 2006-10-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–201（201 aa）
片段：Activation Domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；100mM citrate, 1.8-2.0M Na-acetate, 10mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.233 |
| 2NNU Crystal Structure of the Papillomavirus DNA Tethering Complex E2:Brd4 提交 2006-10-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–201（201 aa）
片段：Activation Domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；100mM citrate, 1.8-2.0M Na-acetate, 10mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.233 |
| 2Q79 Crystal Structure of single chain E2C from HPV16 with a 12aa linker for monomerization. 提交 2007-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
285–365（81 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.21；298 K；80 mM sodium citrate, 1.53 M (NH4)2SO4, 150 mM sodium and potassium tartrate, pH 5.21, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.241 |
| 3MI7 An Enhanced Repressor of Human Papillomavirus E2 Protein 提交 2010-04-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 X
283–365（83 aa）
片段：UNP residues 283-365
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突变：H290E, C309S | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；100 mM sodium citrate, 100 mM ammonium acetate, 10% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.281 |