当前蛋白身份：P03122
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1DBD E2 DNA-BINDING DOMAIN FROM PAPILLOMAVIRUS BPV-1 提交 1999-05-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
311–410（100 aa）
片段：DNA-BINDING DOMAIN
链 B
311–410（100 aa）
片段：DNA-BINDING DOMAIN
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.75；308.3 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 1
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分辨率未提供 |
| 1JJH E2 DNA-binding Domain from Bovine Papillomavirus Type 1 提交 2001-07-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
326–410（85 aa）
片段：DNA-binding domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；ammonium sulfate, imidazole, magnesium chloride, glycerol, DTT, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 1JJH E2 DNA-binding Domain from Bovine Papillomavirus Type 1 提交 2001-07-05 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
326–410（85 aa）
片段：DNA-binding domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；ammonium sulfate, imidazole, magnesium chloride, glycerol, DTT, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 1JJH E2 DNA-binding Domain from Bovine Papillomavirus Type 1 提交 2001-07-05 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
326–410（85 aa）
片段：DNA-binding domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；ammonium sulfate, imidazole, magnesium chloride, glycerol, DTT, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 2BOP CRYSTAL STRUCTURE AT 1.7 ANGSTROMS OF THE BOVINE PAPILLOMAVIRUS-1 E2 DNA-BINDING DOMAIN BOUND TO ITS DNA TARGET 提交 1994-01-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
326–410（85 aa）
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未记录 | YB YTTERBIUM (III) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 1.70 Å |
| 2JEU Transcription activator structure reveals redox control of a replication initiation reaction 提交 2007-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–209（209 aa）
片段：N-TERMINAL TRANS-ACTIVATION DOMAIN (TAD), RESIDUES 1-209
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLISED FROM 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.3 M NACL AND 18-22% TERTIARY BUTANOL, USING THE HANGING DROP METHOD OF VAPOUR DIFFUSION.
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分辨率 2.80 Å R-free 0.281 |
| 2JEX Transcription activator structure reveals redox control of a replication initiation reaction 提交 2007-01-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–209（209 aa）
片段：N-TERMINAL TRANS-ACTIVATION DOMAIN (TAD), RESIDUES 1-209
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突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLISED FROM 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.3 M NACL, 2MM DTT AND 18-22% TERTIARY BUTANOL, USING THE HANGING DROP METHOD OF VAPOUR DIFFUSION.
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分辨率 2.35 Å R-free 0.241 |
| 6BUS Extended E2 DNA-binding domain of the Bovine Papillomavirus-1 提交 2017-12-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 1
310–410（101 aa）
片段：UNP Residues 310-410
链 2
310–410（101 aa）
片段：UNP Residues 310-410
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；sodium citrate, PEG 4000 and ammonium acetate
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分辨率 1.90 Å R-free 0.261 |
| 6BUS Extended E2 DNA-binding domain of the Bovine Papillomavirus-1 提交 2017-12-11 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 3
310–410（101 aa）
片段：UNP Residues 310-410
链 4
310–410（101 aa）
片段：UNP Residues 310-410
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；sodium citrate, PEG 4000 and ammonium acetate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.261 |