当前蛋白身份：P03205
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1KG0 Structure of the Epstein-Barr Virus gp42 Protein Bound to the MHC class II Receptor HLA-DR1 提交 2001-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
86–221（136 aa）
片段：Extracellular Domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；300 K；PEG 4000, Ammonium Acetate, Sodium Chloride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
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分辨率 2.65 Å R-free 0.247 |
| 3FD4 Crystal Structure of Epstein-Barr virus gp42 protein 提交 2008-11-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
33–223（191 aa）
链 B
33–223（191 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；298 K；30% PEG-3000, 100 mM CHES pH 9.5, 10 mM YCl3, 25 mM tris pH 7.5, 150 mM NaCl, temperature 298K, VAPOR DIFFUSION
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分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 3FD4 Crystal Structure of Epstein-Barr virus gp42 protein 提交 2008-11-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
33–223（191 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；298 K；30% PEG-3000, 100 mM CHES pH 9.5, 10 mM YCl3, 25 mM tris pH 7.5, 150 mM NaCl, temperature 298K, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 3FD4 Crystal Structure of Epstein-Barr virus gp42 protein 提交 2008-11-24 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
33–223（191 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；298 K；30% PEG-3000, 100 mM CHES pH 9.5, 10 mM YCl3, 25 mM tris pH 7.5, 150 mM NaCl, temperature 298K, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 5W0K Crystal structure of EBV gHgL/CL40/gp42 N-domain 提交 2017-05-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 X
47–81（35 aa）
片段：UNP residues 47-81
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.25 M sodium sulfate, 0.1 M Bis-tris propane pH 8.5, 20 % (w/v) PEG 4000
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分辨率 3.10 Å R-free 0.299 |
| 5W0K Crystal structure of EBV gHgL/CL40/gp42 N-domain 提交 2017-05-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 Y
47–81（35 aa）
片段：UNP residues 47-81
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.25 M sodium sulfate, 0.1 M Bis-tris propane pH 8.5, 20 % (w/v) PEG 4000
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.299 |
| 8TNN Crystal structure of Epstein-Barr virus gH/gL/gp42 in complex with gp42 antibody A10 提交 2023-08-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
33–223（191 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；20mM Tris pH7.5, 150mM NaCl, 0.1M citric-acid-BIS-TRIS propane, and 10% PEG 3,350
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.281 |
| 8TNN Crystal structure of Epstein-Barr virus gH/gL/gp42 in complex with gp42 antibody A10 提交 2023-08-02 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
33–223（191 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；20mM Tris pH7.5, 150mM NaCl, 0.1M citric-acid-BIS-TRIS propane, and 10% PEG 3,350
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.281 |
| 8TNT Crystal structure of Epstein-Barr virus gH/gL/gp42 in complex with antibodies F-2-1 and 769C2 提交 2023-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 C
33–223（191 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；280 K；20mM Tris pH7.5, 150mM NaCl, 4% Tacsimate pH 7.0, and 10% PEG 3,350
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分辨率 3.15 Å R-free 0.287 |
| 8TOO Crystal structure of Epstein-Barr virus gp42 in complex with antibody 4C12 提交 2023-08-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
85–223（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20mM Tris pH7.5, 150mM NaCl, 0.2M zinc acetate dihydrate, and 18% PEG 3,350
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分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 8TOO Crystal structure of Epstein-Barr virus gp42 in complex with antibody 4C12 提交 2023-08-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 J
85–223（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20mM Tris pH7.5, 150mM NaCl, 0.2M zinc acetate dihydrate, and 18% PEG 3,350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 8TOO Crystal structure of Epstein-Barr virus gp42 in complex with antibody 4C12 提交 2023-08-03 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
85–223（139 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20mM Tris pH7.5, 150mM NaCl, 0.2M zinc acetate dihydrate, and 18% PEG 3,350
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分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 8TOO Crystal structure of Epstein-Barr virus gp42 in complex with antibody 4C12 提交 2023-08-03 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
85–223（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20mM Tris pH7.5, 150mM NaCl, 0.2M zinc acetate dihydrate, and 18% PEG 3,350
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分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |