当前蛋白身份：P03355
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1D0E CRYSTAL STRUCTURES OF THE N-TERMINAL FRAGMENT FROM MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH NUCLEIC ACID: FUNCTIONAL IMPLICATIONS FOR TEMPLATE-PRIMER BINDING TO THE FINGERS DOMAIN 提交 1999-09-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：N-TERMINAL FRAGMENT COMPRISING FINGERS AND PALM DOMAINS
链 B
144–398（255 aa）
片段：N-TERMINAL FRAGMENT COMPRISING FINGERS AND PALM DOMAINS
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；15% PEG 4000,0.1M NH4CL,0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.298 |
| 1D1U USE OF AN N-TERMINAL FRAGMENT FROM MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE TO FACILITATE CRYSTALLIZATION AND ANALYSIS OF A PSEUDO-16-MER DNA MOLECULE CONTAINING G-A MISPAIRS 提交 1999-09-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：FINGERS AND PALM DOMAIN OF MMLV RT
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.286 |
| 1I6J CRYSTAL STRUCTURE OF A PSEUDO-16-MER DNA WITH STACKED GUANINES AND TWO G-A MISPAIRS COMPLEXED WITH THE N-TERMINAL FRAGMENT OF MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE 提交 2001-03-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：N-TERMINAL FRAGMENT
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 4000, NaCl, ADA, MgCl2, HEPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 1MML MECHANISTIC IMPLICATIONS FROM THE STRUCTURE OF A CATALYTIC FRAGMENT OF MMLV REVERSE TRANSCRIPTASE 提交 1995-07-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
130–394（265 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å R-free 0.257 |
| 1N4L A DNA analogue of the polypurine tract of HIV-1 提交 2002-10-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 4000, NaCl, ADA, MgCl2, HEPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.269 |
| 1NND Arginine 116 is Essential for Nucleic Acid Recognition by the Fingers Domain of Moloney Murine Leukemia Virus Reverse Transcriptase 提交 2003-01-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：MMLV Reverse Transcriptase
|
突变：R116A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 400, Magnesium Chloride, HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.274 |
| 1QAI CRYSTAL STRUCTURES OF THE N-TERMINAL FRAGMENT FROM MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH NUCLEIC ACID: FUNCTIONAL IMPLICATIONS FOR TEMPLATE-PRIMER BINDING TO THE FINGERS DOMAIN 提交 1999-03-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
130–394（265 aa）
片段：FINGERS AND PALM DOMAINS OF THE MMLV REVERSE TRANSCRIPTASE
链 B
130–394（265 aa）
片段：FINGERS AND PALM DOMAINS OF THE MMLV REVERSE TRANSCRIPTASE
|
未记录 | HG MERCURY (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 4000, 0.1M NH4CL, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.296 |
| 1QAJ CRYSTAL STRUCTURES OF THE N-TERMINAL FRAGMENT FROM MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH NUCLEIC ACID: FUNCTIONAL IMPLICATIONS FOR TEMPLATE-PRIMER BINDING TO THE FINGERS DOMAIN 提交 1999-03-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：N-TERMINAL FRAGMENT COMPRISING FINGERS AND PALM DOMAINS
链 B
144–398（255 aa）
片段：N-TERMINAL FRAGMENT COMPRISING FINGERS AND PALM DOMAINS
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；15% PEG 4000, 0.1 M NH4CL,0.1 M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 1ZTT Netropsin bound to d(CTTAATTCGAATTAAG) in complex with MMLV RT catalytic fragment 提交 2005-05-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：RT catalytic fragment
|
未记录 | NT NETROPSIN × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 4000, magnesium acetate, ADA, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.246 |
| 1ZTW d(CTTAATTCGAATTAAG) complexed with Moloney Murine Leukemia Virus Reverse Transcriptase catalytic fragment 提交 2005-05-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：RT catalytic fragment
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 4000, magnesium acetate, ADA, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.264 |
| 2FJV RT29 Bound to D(CTTAATTCGAATTAAG) in complex with MMLV RT Catalytic Fragment 提交 2006-01-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：RT catalytic domain
|
未记录 | HXL 2-(4-(4-CARBAMIMIDOYLPHENOXY)PHENYL)-1H-BENZO[D]IMIDAZOLE-6-CARBOXIMIDAMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 4000, MAGNESIUM ACETATE, ADA PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.280 |
| 2FJW d(CTTGAATGCATTCAAG) in complex with MMLV RT catalytic fragment 提交 2006-01-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
|
突变：RT catalytic domain | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 4000, MAGNESIUM ACETATE, ADA, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.256 |
| 2FJX RT29 bound to D(CTTGAATGCATTCAAG) in complex with MMLV RT catalytic fragment 提交 2006-01-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：RT catalytic domain
|
未记录 | HXL 2-(4-(4-CARBAMIMIDOYLPHENOXY)PHENYL)-1H-BENZO[D]IMIDAZOLE-6-CARBOXIMIDAMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 4000, magnesium acetate, ADA pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.266 |
| 2FVP A Structural Study of the CA Dinucleotide Step in the Integrase Processing Site of Moloney Murine Leukemia Virus 提交 2006-01-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 4000, magnesium acetate, ADA pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.288 |
| 2FVQ A Structural Study of the CA Dinucleotide Step in the Integrase Processing Site of Moloney Murine Leukemia Virus 提交 2006-01-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 4000, magnesium acetate, ADA, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.263 |
| 2FVR A Structural Study of the CA Dinucleotide Step in the Integrase Processing Site of Moloney Murine Leukemia Virus 提交 2006-01-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 4000, magnesium acetate, ADA pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.259 |
| 2FVS A Structural Study of the CA Dinucleotide Step in the Integrase Processing Site of Moloney Murine Leukemia Virus 提交 2006-01-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 4000, magnesium acetate, ADA pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.265 |
| 2HB5 Crystal Structure of the Moloney Murine Leukemia Virus RNase H Domain 提交 2006-06-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
618–791（174 aa）
片段：RNase H Domain (Residues 618-791)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；15% PEG 4000, 0.1M ammonium sulfate, 150mM NaCl, 1.25%PEG-MME 550, 1% 2-propanol, 0.5mM zinc sulfate, 5mM MES , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.221 |
| 2M9U Solution NMR structure of the C-terminal domain (CTD) of Moloney murine leukemia virus integrase, Northeast Structural Genomics Target OR41A 提交 2013-06-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1659–1738（80 aa）
片段：DNA binding C terminal domain (CTD) residues 1659-1738
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM K-glutamate, 100mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MLV IN CTD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-10% 13C; U-100% 15N] MLV IN CTD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MQV Solution NMR structure of the U5-primer binding site (U5-PBS) domain of murine leukemia virus RNA genome bound to the retroviral nucleocapsid protein 提交 2014-06-27 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
479–534（56 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；311 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM Tris, 10mM Nacl；压力 ambient
NMR测量条件
pH 7；288 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM Tris, 10mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM 15N,13C-Alab U5-PBS-NC, 0.5 mM 15N.13C-Glab U5-PBS-NC, 0.5 mM 15N.13C-Ulab U5-PBS-NC, 0.5 mM 15N.13C-Clab U5-PBS-NC, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM U5-PBS-M2-NC, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1 mM UAUCG-linker, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MS0 Solution NMR structure pf tRNApro:MLV-Nucleocapsid (1:2) Complex 提交 2014-07-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
479–534（56 aa）
链 C
479–534（56 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；311 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM Tris, 1mM MgCl2, 10mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM NC-tRNApro (1:1), 0.5 mM 13C, 15N G-lab tRNA-pro NC-tRNApro (1:1), 0.5 mM 13C, 15N G-lab tRNA-pro NC-tRNApro (1:1), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MS1 Solution NMR structure of tRNApro:MLV Nucleocapsid Protein (1:1) Complex 提交 2014-07-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
479–534（56 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；311 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM Tris, 1mM MgCl2, 10mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM NC-tRNApro (1:1), 0.5 mM 13C, 15N G-lab tRNA-pro NC-tRNApro (1:1), 0.5 mM 13C, 15N G-lab tRNA-pro13C NC-tRNApro (1:1), 0.5 mM 13C, 15N G-lab tRNA-pro NC-tRNApro (1:1), 0.5 mM 13C, 15N G-lab tRNA-13C NC-tRNApro (1:1), 0.5 mM 13C, 15N G-lab tRNA-pro NC-tRNApro (1:1), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2R2R d(ATTAGTTATAACTAAT) complexed with MMLV RT catalytic fragment 提交 2007-08-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：residues 144-398
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 4000, MgCl2, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.269 |
| 2R2S Co(III)bleomycinB2 bound to d(ATTAGTTATAACTAAT) complexed with MMLV RT catalytic fragment 提交 2007-08-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：residues 144-398
|
未记录 | 3CO COBALT (III) ION × 2 BLB BLEOMYCIN B2 × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 4000, MgCl2, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.308 |
| 2R2T d(ATTTAGTTAACTAAAT) complexed with MMLV RT catalytic fragment 提交 2007-08-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：residues 144-398
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 4000, MgCl2, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.264 |
| 2R2U Co(III)bleomycinB2 bithiazole/C-terminal tail domain bound to d(ATTTAGTTAACTAAAT) complexed with MMLV RT catalytic fragment 提交 2007-08-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：residues 144-398
|
未记录 | BTZ N-(4-{[amino(imino)methyl]amino}butyl)-2,4'-bi-1,3-thiazole-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG 4000, MgCl2, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.282 |
| 3FSI Crystal structure of a trypanocidal 4,4'-Bis(imidazolinylamino)diphenylamine bound to DNA 提交 2009-01-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
144–398（255 aa）
片段：Reverse transcriptase domain: UNP residues 144-398
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 10 MWB N1-(4,5-dihydro-1H-imidazol-2-yl)-N4-(4-((4,5-dihydro-1H-imidazol-2-yl)amino)phenyl)benzene-1,4-diamine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 4000, Magnesium acetate, ADA pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.254 |
| 3NNQ Crystal Structure of the N-terminal domain of Moloney murine leukemia virus integrase, Northeast Structural Genomics Consortium Target OR3 提交 2010-06-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1331–1435（105 aa）
片段：N-terminal domain
链 B
1331–1435（105 aa）
片段：N-terminal domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 4 ACT ACETATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；2.0 M Sodium Malonate, 0.1 M Sodium Acetate,0.05% Anapoe X-305, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.274 |
| 4M94 d(ATCCGTTATAACGGAT) complexed with Moloney Murine Leukemia virus reverse transcriptase catalytic fragment 提交 2013-08-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：UNP residues 683-937
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；7% PEG 4000, 5mM Magnesium acetate, 50mM N-(2-acetamido)iminodiacetic acid, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293.15K
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.239 |
| 4M95 d(ATCCGTTATAACGGAT)complexed with Moloney Murine Leukemia virus reverse transcriptase catalytic fragment 提交 2013-08-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：UNP residues 683-937
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；9% PEG 4000, 5mM Magnesium acetate, 50mM N-(2-acetamido)iminodiacetic acid, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293.15K
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.234 |
| 4MH8 The crystal structure of the monomeric reverse transcriptase from moloney murine leukemia virus 提交 2013-08-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
683–1330（648 aa）
|
突变：L435K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；POTASSIUM CHLORIDE, MAGNESIUM ACETATE, SODIUM CACODYLATE, PEG 8000, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K REMARK 300
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.277 |
| 4NZG Crystal Structure of the N-terminal domain of Moloney murine leukemia virus integrase, Northeast Structural Genomics Consortium Target OR3 提交 2013-12-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1338–1435（98 aa）
链 B
1338–1435（98 aa）
链 C
1338–1435（98 aa）
链 D
1338–1435（98 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ACT ACETATE ION × 3 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；Protein solution: 100mM NaCl, 5mM DTT, 0.02% NaN3, 10mM Tris-HCl (pH 7.5) . Reservoir solution:1.0 M K2HPO4, 0.1 M NaAc, 0.05% Anapoe X-305, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.265 |
| 4NZG Crystal Structure of the N-terminal domain of Moloney murine leukemia virus integrase, Northeast Structural Genomics Consortium Target OR3 提交 2013-12-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1338–1435（98 aa）
链 C
1338–1435（98 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；Protein solution: 100mM NaCl, 5mM DTT, 0.02% NaN3, 10mM Tris-HCl (pH 7.5) . Reservoir solution:1.0 M K2HPO4, 0.1 M NaAc, 0.05% Anapoe X-305, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.265 |
| 4NZG Crystal Structure of the N-terminal domain of Moloney murine leukemia virus integrase, Northeast Structural Genomics Consortium Target OR3 提交 2013-12-12 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1338–1435（98 aa）
链 D
1338–1435（98 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；Protein solution: 100mM NaCl, 5mM DTT, 0.02% NaN3, 10mM Tris-HCl (pH 7.5) . Reservoir solution:1.0 M K2HPO4, 0.1 M NaAc, 0.05% Anapoe X-305, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.265 |
| 4XO0 Crystal structure of 5'-CTTATPPTAZZATAAG in a host-guest complex 提交 2015-01-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：unp residues 683-937
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 4000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.240 |
| 4XPC Crystal structure of 5'- CTTATAAATTTATAAG in a host-guest complex 提交 2015-01-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 4000
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.241 |
| 4XPE Crystal structure of 5'-CTTATGGGCCCATAAG in a host-guest complex 提交 2015-01-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 4000
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.237 |
| 5DMQ Crystal structure of mouse eRF1 in complex with Reverse Transcriptase (RT) of Moloney Murine Leukemia Virus 提交 2015-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
683–1330（648 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.02 M magnesium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5, 20 % polyacrylic acid sodium salt 5100
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.295 |
| 5DMR Crystal Structure of C-terminal domain of mouse eRF1 in complex with RNase H domain of RT of Moloney Murine Leukemia Virus 提交 2015-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1159–1330（172 aa）
片段：RNase H domain, UNP residues 1159-1330
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；288 K；0.1 M Tris pH 8.5, 18 % ammonium dihydrogen phosphate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.280 |
| 5VBS Structural basis for a six letter alphabet including GATCKX 提交 2017-03-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：unp residues 683-987
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；10 % PEG 4000, 5 mM magnesium acetate and 50 mM ADA (pH 6.5)
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.238 |
| 6B1Q Hydrogen Bonding Complementary, not size complementarity is key in the formation of the double helix 提交 2017-09-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：Catalytic fragment (UNP residues 683-937)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；6 % PEG 4000, 5 mM magnesium acetate and 50 mM ADA (pH 6.5)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.237 |
| 6B1R Hydrogen Bonding Complementary, not size complementarity is key in the formation of the double helix 提交 2017-09-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：Catalytic fragment (UNP residues 683-937)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；6 % PEG 4000, 5 mM magnesium acetate and 50 mM ADA (pH 6.5)
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.230 |
| 6B1S Hydrogen Bonding Complementary, not size complementarity is key in the formation of the double helix 提交 2017-09-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：Catalytic fragment (UNP residues 683-937)
链 B
683–937（255 aa）
片段：Catalytic fragment (UNP residues 683-937)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；6 % PEG 4000, 5 mM magnesium acetate and 50 mM ADA (pH 6.5)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 6MIG Crystal structure of host-guest complex with PB hachimoji DNA 提交 2018-09-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；8 % PEG 4000, 5 mM magnesium acetate and 50 mM ADA (pH 6.5)
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.256 |
| 6MIH Crystal structure of host-guest complex with PC hachimoji DNA 提交 2018-09-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；8 % PEG 4000, 5 mM magnesium acetate and 50 mM ADA (pH 6.5)
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.234 |
| 6MIK Crystal structure of host-guest complex with PP hachimoji DNA 提交 2018-09-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；8 % PEG 4000, 5 mM magnesium acetate and 50 mM ADA (pH 6.5)
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.247 |
| 7JQ8 Solution NMR structure of human Brd3 ET domain 提交 2020-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1716–1738（23 aa）
片段：C-terminal Tail, residues 1716-1738
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 1
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 1
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 1
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 1
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MLV IN TP, 100 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 2 mM 2-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Brd3 ET, 100 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 2 mM 2-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM Brd3 ET, 100 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 2 mM 2-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM Brd3 ET, 100 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 2 mM 2-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |