当前蛋白身份:P03435
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4GMS Crystal structure of heterosubtypic Fab S139/1 in complex with influenza A H3 hemagglutinin 提交 2012-08-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
28–346(319 aa)
片段:UNP residues 28-346
链 B
347–522(176 aa)
片段:UNP residues 347-522
链 C
28–346(319 aa)
片段:UNP residues 28-346
链 D
347–522(176 aa)
片段:UNP residues 347-522
链 E
28–346(319 aa)
片段:UNP residues 28-346
链 F
347–522(176 aa)
片段:UNP residues 347-522
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 SO4 SULFATE ION × 18 GOL GLYCEROL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;0.1 M HEPES, pH 7.5, 2 M ammonium sulfate, 2% v/v PEG400, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.233 |
| 4O58 Crystal structure of broadly neutralizing antibody F045-092 in complex with A/Victoria/3/1975 (H3N2) influenza hemagglutinin 提交 2013-12-19 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
28–346(319 aa)
片段:Hemagglutinin HA1 chain
链 B
347–522(176 aa)
片段:Hemagglutinin HA2 chain
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SO4 SULFATE ION × 42 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.1;277 K;1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.1, 4% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.224 |
| 6R0E Structure of F11TCR in complex with DR1 MHC Class II presenting PKYVKQNTLKLAT 提交 2019-03-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 CCC
323–335(13 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 SO4 SULFATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;291 K;0.1 M Na Cacodylate,
0.2 M NH4 SO4, 15 %
PEG 8000
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.233 |
| 8INR Cryo-EM structure of the alpha-MSH-bound human melanocortin receptor 5 (MC5R)-Gs complex 提交 2023-03-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 R
1–16(16 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.73 Å |
| 8IOC Cryo-EM structure of the gamma-MSH-bound human melanocortin receptor 3 (MC3R)-Gs complex 提交 2023-03-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
1–16(16 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 8IOD Cryo-EM structure of the PG-901-bound human melanocortin receptor 5 (MC5R)-Gs complex 提交 2023-03-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
1–16(16 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.59 Å |
| 8JRU Cryo-EM structure of the glucagon receptor bound to beta-arrestin 1 in ligand-free state 提交 2023-06-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 R
1–16(16 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8JRV Cryo-EM structure of the glucagon receptor bound to glucagon and beta-arrestin 1 提交 2023-06-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 R
1–16(16 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8PJE Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting influenza A virus haemagglutinin (HA)306-318 PKYVKQNTLKLAT 提交 2023-06-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
323–335(13 aa)
|
未记录 | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 GOL GLYCEROL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.1 M HEPES pH 7.0, 25 % PEG8000, 15 % Glycerol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.203 |
| 8PJE Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting influenza A virus haemagglutinin (HA)306-318 PKYVKQNTLKLAT 提交 2023-06-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
323–335(13 aa)
|
未记录 | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.1 M HEPES pH 7.0, 25 % PEG8000, 15 % Glycerol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.203 |
| 8PJF Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting P11T->R modified influenza A virus haemagglutinin (HA)306-318 PKYVKQNTLKLAR 提交 2023-06-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
323–335(13 aa)
|
突变:T318R | SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.1 M MES pH 7.0, 25 % PEG4000, 0.2 M ammonium sulphate
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.192 |
| 8PJG F11 TCR in complex with Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting P11T->R modified influenza A virus haemagglutinin (HA)306-318 PKYVKQNTLKLAR 提交 2023-06-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 C
323–335(13 aa)
|
突变:T318R | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 15 % PEG8000, 0.2 M ammonium sulphate
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.214 |
| 8YH0 A3R-Gi complex bound to NECA 提交 2024-02-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 R
1–16(16 aa)
|
未记录 | NEC N-ETHYL-5'-CARBOXAMIDO ADENOSINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 8YH2 A3R-Gi complex bound to adenosine 提交 2024-02-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 R
1–16(16 aa)
|
未记录 | ADN ADENOSINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å |
| 8YH3 A3R-Gi complex bound to m6A 提交 2024-02-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 R
1–16(16 aa)
|
未记录 | 6MD N-methyladenosine × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8YH5 A3R-Gi complex bound to i6A 提交 2024-02-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 R
1–16(16 aa)
|
未记录 | ZIR N-(3-methylbut-2-en-1-yl)adenosine × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.66 Å |
| 8YH6 A3R-Gi complex bound to namodenoson 提交 2024-02-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 R
1–16(16 aa)
|
未记录 | XS0 namodenoson × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |