当前蛋白身份:P03435 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4GMS Crystal structure of heterosubtypic Fab S139/1 in complex with influenza A H3 hemagglutinin 提交 2012-08-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 28–346(319 aa) 片段:UNP residues 28-346
链 B 347–522(176 aa) 片段:UNP residues 347-522
链 C 28–346(319 aa) 片段:UNP residues 28-346
链 D 347–522(176 aa) 片段:UNP residues 347-522
链 E 28–346(319 aa) 片段:UNP residues 28-346
链 F 347–522(176 aa) 片段:UNP residues 347-522
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 SO4 SULFATE ION × 18 GOL GLYCEROL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;0.1 M HEPES, pH 7.5, 2 M ammonium sulfate, 2% v/v PEG400, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.95 Å R-free 0.233
4O58 Crystal structure of broadly neutralizing antibody F045-092 in complex with A/Victoria/3/1975 (H3N2) influenza hemagglutinin 提交 2013-12-19 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 28–346(319 aa) 片段:Hemagglutinin HA1 chain
链 B 347–522(176 aa) 片段:Hemagglutinin HA2 chain
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SO4 SULFATE ION × 42 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.1;277 K;1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.1, 4% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.75 Å R-free 0.224
6R0E Structure of F11TCR in complex with DR1 MHC Class II presenting PKYVKQNTLKLAT 提交 2019-03-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 CCC 323–335(13 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 SO4 SULFATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6;291 K;0.1 M Na Cacodylate, 0.2 M NH4 SO4, 15 % PEG 8000
分辨率 1.91 Å R-free 0.233
8INR Cryo-EM structure of the alpha-MSH-bound human melanocortin receptor 5 (MC5R)-Gs complex 提交 2023-03-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 R 1–16(16 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8IOC Cryo-EM structure of the gamma-MSH-bound human melanocortin receptor 3 (MC3R)-Gs complex 提交 2023-03-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 R 1–16(16 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8IOD Cryo-EM structure of the PG-901-bound human melanocortin receptor 5 (MC5R)-Gs complex 提交 2023-03-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 R 1–16(16 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.59 Å
8JRU Cryo-EM structure of the glucagon receptor bound to beta-arrestin 1 in ligand-free state 提交 2023-06-17 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 R 1–16(16 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8JRV Cryo-EM structure of the glucagon receptor bound to glucagon and beta-arrestin 1 提交 2023-06-17 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 R 1–16(16 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8PJE Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting influenza A virus haemagglutinin (HA)306-318 PKYVKQNTLKLAT 提交 2023-06-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 323–335(13 aa)
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 GOL GLYCEROL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.1 M HEPES pH 7.0, 25 % PEG8000, 15 % Glycerol
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
8PJE Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting influenza A virus haemagglutinin (HA)306-318 PKYVKQNTLKLAT 提交 2023-06-23 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 323–335(13 aa)
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.1 M HEPES pH 7.0, 25 % PEG8000, 15 % Glycerol
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
8PJF Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting P11T->R modified influenza A virus haemagglutinin (HA)306-318 PKYVKQNTLKLAR 提交 2023-06-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 323–335(13 aa)
突变:T318R SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.1 M MES pH 7.0, 25 % PEG4000, 0.2 M ammonium sulphate
分辨率 1.48 Å R-free 0.192
8PJG F11 TCR in complex with Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting P11T->R modified influenza A virus haemagglutinin (HA)306-318 PKYVKQNTLKLAR 提交 2023-06-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 323–335(13 aa)
突变:T318R EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 15 % PEG8000, 0.2 M ammonium sulphate
分辨率 1.83 Å R-free 0.214
8YH0 A3R-Gi complex bound to NECA 提交 2024-02-27 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 R 1–16(16 aa)
未记录 NEC N-ETHYL-5'-CARBOXAMIDO ADENOSINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8YH2 A3R-Gi complex bound to adenosine 提交 2024-02-27 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 R 1–16(16 aa)
未记录 ADN ADENOSINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8YH3 A3R-Gi complex bound to m6A 提交 2024-02-27 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 R 1–16(16 aa)
未记录 6MD N-methyladenosine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8YH5 A3R-Gi complex bound to i6A 提交 2024-02-27 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 R 1–16(16 aa)
未记录 ZIR N-(3-methylbut-2-en-1-yl)adenosine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
8YH6 A3R-Gi complex bound to namodenoson 提交 2024-02-27 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 R 1–16(16 aa)
未记录 XS0 namodenoson × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å