当前蛋白身份：P04051
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5FJ8 Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III elongation complex at 3. 9 A 提交 2015-10-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 3.90 Å |
| 5FJ9 Cryo-EM structure of yeast apo RNA polymerase III at 4.6 A 提交 2015-10-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 4.60 Å |
| 5FJA Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III at 4.7 A 提交 2015-10-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 4.65 Å |
| 6CNB Yeast RNA polymerase III initial transcribing complex 提交 2018-03-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6CNC Yeast RNA polymerase III open complex 提交 2018-03-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6CND Yeast RNA polymerase III natural open complex (nOC) 提交 2018-03-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 6CNF Yeast RNA polymerase III elongation complex 提交 2018-03-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6EU0 RNA Polymerase III open pre-initiation complex (OC-PIC) 提交 2017-10-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6EU1 RNA Polymerase III - open DNA complex (OC-POL3). 提交 2017-10-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric（19） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6EU2 Apo RNA Polymerase III - open conformation (oPOL3) 提交 2017-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6EU3 Apo RNA Polymerase III - closed conformation (cPOL3) 提交 2017-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6F40 RNA Polymerase III open complex 提交 2017-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6F41 RNA Polymerase III initially transcribing complex 提交 2017-11-29 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 6F42 RNA Polymerase III closed complex CC1. 提交 2017-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |
| 6F44 RNA Polymerase III closed complex CC2. 提交 2017-11-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6TUT Cryo-EM structure of the RNA Polymerase III-Maf1 complex 提交 2020-01-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM HEPES, 150 mM (NH4)2SO4, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot time 6, blot force 2
|
分辨率 3.25 Å |
| 7Z0H Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.6 A (focus subunit AC40). 提交 2022-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric（19） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7Z1L Structure of yeast RNA Polymerase III Pre-Termination Complex (PTC) 提交 2022-02-24 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7Z1M Structure of yeast RNA Polymerase III Elongation Complex (EC) 提交 2022-02-24 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7Z1N Structure of yeast RNA Polymerase III Delta C53-C37-C11 提交 2022-02-24 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7Z1O Structure of yeast RNA Polymerase III PTC + NTPs 提交 2022-02-24 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7Z2Z Structure of yeast RNA Polymerase III-DNA-Ty1 integrase complex (Pol III-DNA-IN1) at 3.1 A 提交 2022-03-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 7Z30 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.9 A (focus subunit C11 terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric（19） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7Z31 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.7 A (focus subunit C11, no C11 C-terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric（19） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 8BWS Structure of yeast RNA Polymerase III elongation complex at 3.3 A 提交 2022-12-07 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1460（1460 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |