当前蛋白身份：P04190
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BC2 ZN-DEPENDENT METALLO-BETA-LACTAMASE FROM BACILLUS CEREUS 提交 1997-04-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
链 B
31–257（227 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；HANGING DROP METHOD. PROTEIN WAS DISSOLVED IN 10MM TRIS PH7, 1MM ZINC SULPHATE. WELL SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS-HCL PH4.5, 75% AMMONIUM SULPHATE. 6UL DROPS WERE MADE WITH 3UL PROTEIN SOLUTION 50% DILUTED (WATER) WELL SOLUTION., vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.279 |
| 1BMC STRUCTURE OF A ZINC METALLO-BETA-LACTAMASE FROM BACILLUS CEREUS 提交 1995-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–257（221 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.330 |
| 1BVT METALLO-BETA-LACTAMASE FROM BACILLUS CEREUS 569/H/9 提交 1998-09-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 BCT BICARBONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；SEE IN ACTA CRYSTALLOG PAPER, pH 5.6
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.269 |
| 1DXK Metallo-beta-lactamase from Bacillus cereus 569/H/9 C168S mutant 提交 2000-01-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
突变：YES | ZN ZINC ION × 1 BCT BICARBONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.60
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.261 |
| 1MQO Metallo-beta-lactamase BcII Cd substituted from Bacillus cereus at 1.35 angstroms resolution 提交 2002-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
未记录 | CD CADMIUM ION × 3 CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；281.15 K；13%PEG 8K, 10mM sodium citrate, 100 microM DTT, 100mM MES buffer 4.9, and 1mM CdSO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281.15K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.248 |
| 2BC2 METALLO BETA-LACTAMASE II FROM BACILLUS CEREUS 569/H/9 AT PH 6.0, TRIGONAL CRYSTAL FORM 提交 1997-09-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.251 |
| 2BC2 METALLO BETA-LACTAMASE II FROM BACILLUS CEREUS 569/H/9 AT PH 6.0, TRIGONAL CRYSTAL FORM 提交 1997-09-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
31–257（227 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.251 |
| 2BC2 METALLO BETA-LACTAMASE II FROM BACILLUS CEREUS 569/H/9 AT PH 6.0, TRIGONAL CRYSTAL FORM 提交 1997-09-09 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
31–257（227 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.251 |
| 2BFK Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH7 using 20mM ZnSO4 in buffer. 1mM DTT was used as a reducing agent 提交 2004-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–49（19 aa）
链 A
50–67（18 aa）
链 A
68–102（35 aa）
链 A
103–108（6 aa）
链 A
109–131（23 aa）
链 A
132–149（18 aa）
链 A
150–188（39 aa）
链 A
189–191（3 aa）
链 A
192–242（51 aa）
链 A
243–257（15 aa）
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | AZI AZIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 10 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., pH 7.00
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 2BFK Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH7 using 20mM ZnSO4 in buffer. 1mM DTT was used as a reducing agent 提交 2004-12-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
31–49（19 aa）
链 B
50–67（18 aa）
链 B
68–102（35 aa）
链 B
103–108（6 aa）
链 B
109–131（23 aa）
链 B
132–149（18 aa）
链 B
150–188（39 aa）
链 B
189–191（3 aa）
链 B
192–242（51 aa）
链 B
243–257（15 aa）
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | AZI AZIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., pH 7.00
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 2BFL Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH5 using 20mM ZnSO4 in buffer. 1mM DTT was used as a reducing agent. 提交 2004-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
突变：YES | GOL GLYCEROL × 4 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., pH 5.00
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.202 |
| 2BFL Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH5 using 20mM ZnSO4 in buffer. 1mM DTT was used as a reducing agent. 提交 2004-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
31–257（227 aa）
|
突变：YES | GOL GLYCEROL × 6 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 AZI AZIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., pH 5.00
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.202 |
| 2BFZ Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH4.5 using 20mM ZnSO4 in buffer. 1mM DTT was used as a reducing agent. Cys221 is oxidized. 提交 2004-12-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–227（227 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 4 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., PH 4.50
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.239 |
| 2BFZ Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH4.5 using 20mM ZnSO4 in buffer. 1mM DTT was used as a reducing agent. Cys221 is oxidized. 提交 2004-12-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–227（227 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 5 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 AZI AZIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., PH 4.50
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.239 |
| 2BG2 Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH4.5 using 20mM ZnSO4 in the buffer. 1mM DTT and 1mM TCEP- HCl were used as reducing agents. Cys221 is reduced. 提交 2004-12-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–49（19 aa）
链 A
50–64（15 aa）
链 A
65–66（2 aa）
链 A
67–67（1 aa）
链 A
68–102（35 aa）
链 A
103–108（6 aa）
链 A
109–131（23 aa）
链 A
132–149（18 aa）
链 A
150–188（39 aa）
链 A
189–191（3 aa）
链 A
192–242（51 aa）
链 A
243–257（15 aa）
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | GOL GLYCEROL × 10 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., pH 4.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.224 |
| 2BG2 Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH4.5 using 20mM ZnSO4 in the buffer. 1mM DTT and 1mM TCEP- HCl were used as reducing agents. Cys221 is reduced. 提交 2004-12-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
31–49（19 aa）
链 B
50–64（15 aa）
链 B
65–66（2 aa）
链 B
67–67（1 aa）
链 B
68–102（35 aa）
链 B
103–108（6 aa）
链 B
109–131（23 aa）
链 B
132–149（18 aa）
链 B
150–188（39 aa）
链 B
189–191（3 aa）
链 B
192–242（51 aa）
链 B
243–257（15 aa）
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | GOL GLYCEROL × 11 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 5 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., pH 4.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.224 |
| 2BG6 Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH5 using 20 Micromolar ZnSO4 in the buffer. 1mM DTT was used as a reducing agent. Cys221 is oxidized. 提交 2004-12-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–49（19 aa）
链 A
50–64（15 aa）
链 A
65–66（2 aa）
链 A
67–67（1 aa）
链 A
68–102（35 aa）
链 A
103–108（6 aa）
链 A
109–131（23 aa）
链 A
132–149（18 aa）
链 A
150–188（39 aa）
链 A
189–191（3 aa）
链 A
192–242（51 aa）
链 A
243–257（15 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 10 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., pH 5.00
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.223 |
| 2BG6 Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH5 using 20 Micromolar ZnSO4 in the buffer. 1mM DTT was used as a reducing agent. Cys221 is oxidized. 提交 2004-12-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
31–49（19 aa）
链 B
50–64（15 aa）
链 B
65–66（2 aa）
链 B
67–67（1 aa）
链 B
68–102（35 aa）
链 B
103–108（6 aa）
链 B
109–131（23 aa）
链 B
132–149（18 aa）
链 B
150–188（39 aa）
链 B
189–191（3 aa）
链 B
192–242（51 aa）
链 B
243–257（15 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 6 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5 AZI AZIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., pH 5.00
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.223 |
| 2BG7 Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH4.5 using 20 Micromolar ZnSO4 in the buffer. 1mM DTT was used as a reducing agent. Cys221 is oxidized. 提交 2004-12-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–49（19 aa）
链 A
50–64（15 aa）
链 A
65–66（2 aa）
链 A
67–67（1 aa）
链 A
68–102（35 aa）
链 A
103–108（6 aa）
链 A
109–131（23 aa）
链 A
132–149（18 aa）
链 A
150–188（39 aa）
链 A
189–191（3 aa）
链 A
192–242（51 aa）
链 A
243–257（15 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 6 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., PH 4.50
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.222 |
| 2BG7 Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH4.5 using 20 Micromolar ZnSO4 in the buffer. 1mM DTT was used as a reducing agent. Cys221 is oxidized. 提交 2004-12-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
31–49（19 aa）
链 B
50–64（15 aa）
链 B
65–66（2 aa）
链 B
67–67（1 aa）
链 B
68–102（35 aa）
链 B
103–108（6 aa）
链 B
109–131（23 aa）
链 B
132–149（18 aa）
链 B
150–188（39 aa）
链 B
189–191（3 aa）
链 B
192–242（51 aa）
链 B
243–257（15 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 6 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., PH 4.50
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.222 |
| 2BG8 Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH4.5 using 20 Micromolar ZnSO4 in the buffer. 1mM DTT and 1mM TCEP-HCl were used as reducing agents. 提交 2004-12-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–49（19 aa）
链 A
50–64（15 aa）
链 A
65–66（2 aa）
链 A
67–67（1 aa）
链 A
68–102（35 aa）
链 A
103–108（6 aa）
链 A
109–131（23 aa）
链 A
132–149（18 aa）
链 A
150–188（39 aa）
链 A
189–191（3 aa）
链 A
192–242（51 aa）
链 A
243–257（15 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 7 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., PH 4.50
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.237 |
| 2BG8 Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH4.5 using 20 Micromolar ZnSO4 in the buffer. 1mM DTT and 1mM TCEP-HCl were used as reducing agents. 提交 2004-12-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
31–49（19 aa）
链 B
50–64（15 aa）
链 B
65–66（2 aa）
链 B
67–67（1 aa）
链 B
68–102（35 aa）
链 B
103–108（6 aa）
链 B
109–131（23 aa）
链 B
132–149（18 aa）
链 B
150–188（39 aa）
链 B
189–191（3 aa）
链 B
192–242（51 aa）
链 B
243–257（15 aa）
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | GOL GLYCEROL × 5 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., PH 4.50
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.237 |
| 2BGA Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH7 using 20 Micromolar ZnSO4 in the buffer. 1mM DTT was used as a reducing agent. Cys221 is oxidized. 提交 2004-12-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–49（19 aa）
链 A
50–64（15 aa）
链 A
65–66（2 aa）
链 A
67–67（1 aa）
链 A
68–102（35 aa）
链 A
103–108（6 aa）
链 A
109–131（23 aa）
链 A
132–149（18 aa）
链 A
150–188（39 aa）
链 A
189–191（3 aa）
链 A
192–242（51 aa）
链 A
243–257（15 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | AZI AZIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., pH 7.00
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.247 |
| 2BGA Bacillus cereus metallo-beta-lactamase (BcII) Arg (121) Cys mutant. Solved at pH7 using 20 Micromolar ZnSO4 in the buffer. 1mM DTT was used as a reducing agent. Cys221 is oxidized. 提交 2004-12-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
31–49（19 aa）
链 B
50–64（15 aa）
链 B
65–66（2 aa）
链 B
67–67（1 aa）
链 B
68–102（35 aa）
链 B
103–108（6 aa）
链 B
109–131（23 aa）
链 B
132–149（18 aa）
链 B
150–188（39 aa）
链 B
189–191（3 aa）
链 B
192–242（51 aa）
链 B
243–257（15 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | AZI AZIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. RESERVOIR SOLUTION CONTAINED 100MM TRIS AT PH4.5-5, 70-75% AMMONIUM SULPHATE, 1MM DTT OR 1MM DTT AND 1MM TCEP-HCL, 2MM ZNSO4 AND 0.1% AZIDE. PROTEIN CONCENTRATION OF 2.7 MG/ML. DROPS WERE KEPT AT 291K AND WERE STREAK SEEDED FROM A WILD TYPE CRYSTAL AFTER 1 DAY., pH 7.00
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.247 |
| 2M5C Solution Structure of the Bacillus cereus Metallo-Beta-Lactamase BcII 提交 2013-02-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4；308 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-99% 15N] BcII-1, 20 mM MES-2, 0.2 mM Zinc Chloride-3, 100 mM sodium chloride-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] BcII-5, 20 mM MES-6, 0.2 mM Zinc Chloride-7, 100 mM sodium chloride-8, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2M5D Solution Structure of the Bacillus cereus Metallo-Beta-Lactamase BcII in Complex with R-Thiomandelic Acid 提交 2013-02-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 RTD (2R)-phenyl(sulfanyl)ethanoic acid × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4；308 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-99% 15N] BcII-1, 1 mM R-Thiomandelic Acid-2, 20 mM MES-3, 100 mM sodium chloride-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] BcII-5, 1 mM R-Thiomandelic Acid-6, 20 mM MES-7, 100 mM sodium chloride-8, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2NXA Structure of Zn-dependent Metallo-Beta-Lactamase from Bacillus Cereus R121H, C221D Double Mutant 提交 2006-11-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–257（221 aa）
|
突变：y | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 5.4, 60 mM sodium tartrate, 18% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.256 |
| 2NYP Structure of beta-lactamase II from Bacillus cereus. R121H, C221D doble mutant with two zinc ions. 提交 2006-11-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–257（221 aa）
|
突变：y | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M sodium cacodylate,60 mM sodium tartrate, 18% PEG 3350, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.241 |
| 2NZE Structure of beta-lactamase II from Bacillus cereus. R121H, C221S double mutant. Space group P3121. 提交 2006-11-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–257（222 aa）
|
突变：yes | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 ACY ACETIC ACID × 4 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；295 K；0.1 M sodium acetate, 2.8 M ammonium sulfate, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 2NZE Structure of beta-lactamase II from Bacillus cereus. R121H, C221S double mutant. Space group P3121. 提交 2006-11-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
36–257（222 aa）
|
突变：yes | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 ACY ACETIC ACID × 4 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；295 K；0.1 M sodium acetate, 2.8 M ammonium sulfate, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 2NZE Structure of beta-lactamase II from Bacillus cereus. R121H, C221S double mutant. Space group P3121. 提交 2006-11-23 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
36–257（222 aa）
|
突变：yes | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6 ACY ACETIC ACID × 8 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；295 K；0.1 M sodium acetate, 2.8 M ammonium sulfate, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 2NZF Structure of beta-lactamase II from Bacillus cereus. R121H, C221S double mutant. Space group C2. 提交 2006-11-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–257（221 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M sodium cacodylate, 60 mM sodium tartrate, 18% PEG 3350, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.238 |
| 2UYX metallo-beta-lactamase (1BC2) single point mutant D120S 提交 2007-04-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–49（20 aa）
片段：RESIDUES 30-257
链 A
50–67（18 aa）
片段：RESIDUES 30-257
链 A
68–102（35 aa）
片段：RESIDUES 30-257
链 A
103–108（6 aa）
片段：RESIDUES 30-257
链 A
109–131（23 aa）
片段：RESIDUES 30-257
链 A
132–149（18 aa）
片段：RESIDUES 30-257
链 A
150–188（39 aa）
片段：RESIDUES 30-257
链 A
189–191（3 aa）
片段：RESIDUES 30-257
链 A
192–242（51 aa）
片段：RESIDUES 30-257
链 A
243–257（15 aa）
片段：RESIDUES 30-257
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | GOL GLYCEROL × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；19% PEG 3350, 0.1M NA CACODYLATE PH 5.5, 0.1M NA TARTRATE, 25% GLYCEROL ADDED AS CRYOPROTECTANT
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.221 |
| 3BC2 METALLO BETA-LACTAMASE II FROM BACILLUS CEREUS 569/H/9 AT PH 6.0, MONOCLINIC CRYSTAL FORM 提交 1997-09-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.241 |
| 3FCZ Adaptive protein evolution grants organismal fitness by improving catalysis and flexibility 提交 2008-11-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–247（212 aa）
|
突变：N70S, V112A, L250S, G262S | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；24% PEG 3350, 0.1M sodium tartrate, 1mM DTT, 1mM zinc acetate, 0.1M sodium cacodylate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.258 |
| 3FCZ Adaptive protein evolution grants organismal fitness by improving catalysis and flexibility 提交 2008-11-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
36–247（212 aa）
|
突变：N70S, V112A, L250S, G262S | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；24% PEG 3350, 0.1M sodium tartrate, 1mM DTT, 1mM zinc acetate, 0.1M sodium cacodylate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.258 |
| 3I0V Bacillus cereus metallo-beta-lactamase: apo form 提交 2009-06-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；0.1 M Sodium cacodylate, 0.1 M Sodium tartrate, 18% PEG 3350. Soak at pH 5 to remove Zn(II), Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.205 |
| 3I11 Cobalt-substituted metallo-beta-lactamase from Bacillus cereus 提交 2009-06-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；0.1 M Sodium cacodylate, 0.1 M Sodium tartrate, 18% PEG 3350. Crystals of the apo-protein were soaked in 1 mM CoSO4, pH 5.8, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.204 |
| 3I13 Bacillus cereus Zn-dependent metallo-beta-lactamase at pH 5.8 提交 2009-06-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；0.1 M Sodium cacodylate, 0.1 M Sodium tartrate, 18% PEG 3350, 1 mM ZnSO4, 1 mM DTT, pH 5.8, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.217 |
| 3I14 Cobalt-substituted metallo-beta-lactamase from Bacillus cereus: residue Cys168 partially oxidized 提交 2009-06-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CO COBALT (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；0.1 M Sodium cacodylate, 0.1 M Sodium tartrate, 18% PEG 3350, 1 mM CoSO4, 1 mM DTT, pH 5.8, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.191 |
| 3I15 Cobalt-substituted metallo-beta-lactamase from Bacillus cereus: residue Cys168 fully oxidized 提交 2009-06-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CO COBALT (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；0.1 M Sodium cacodylate, 0.1 M Sodium tartrate, 18% PEG 3350, 40 mM CoSO4, 1 mM DTT, pH 5.8, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.186 |
| 3KNR Bacillus cereus metallo-beta-lactamase Cys221Asp mutant, 1 mM Zn(II) 提交 2009-11-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
突变：C168D | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；0.1 M Sodium Acetate, 2.8 M Ammonium Sulfate, 1 mM Zinc Sulfate, pH 4.9, Vapor diffusion, hanging drop., temperature 293K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.210 |
| 3KNR Bacillus cereus metallo-beta-lactamase Cys221Asp mutant, 1 mM Zn(II) 提交 2009-11-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
31–257（227 aa）
|
突变：C168D | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；0.1 M Sodium Acetate, 2.8 M Ammonium Sulfate, 1 mM Zinc Sulfate, pH 4.9, Vapor diffusion, hanging drop., temperature 293K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.210 |
| 3KNR Bacillus cereus metallo-beta-lactamase Cys221Asp mutant, 1 mM Zn(II) 提交 2009-11-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
31–257（227 aa）
|
突变：C168D | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；0.1 M Sodium Acetate, 2.8 M Ammonium Sulfate, 1 mM Zinc Sulfate, pH 4.9, Vapor diffusion, hanging drop., temperature 293K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.210 |
| 3KNR Bacillus cereus metallo-beta-lactamase Cys221Asp mutant, 1 mM Zn(II) 提交 2009-11-12 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
31–257（227 aa）
|
突变：C168D | ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；0.1 M Sodium Acetate, 2.8 M Ammonium Sulfate, 1 mM Zinc Sulfate, pH 4.9, Vapor diffusion, hanging drop., temperature 293K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.210 |
| 3KNS Bacillus cereus metallo-beta-lactamase Cys221Asp mutant, 20 mM Zn(II) 提交 2009-11-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
突变：C168D | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；0.1 M Sodium Acetate, 2.8 M Ammonium Sulfate, 20 mM Zinc Sulfate, pH 4.9, Vapor diffusion, hanging drop., temperature 293K
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.194 |
| 3KNS Bacillus cereus metallo-beta-lactamase Cys221Asp mutant, 20 mM Zn(II) 提交 2009-11-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
31–257（227 aa）
|
突变：C168D | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACY ACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；0.1 M Sodium Acetate, 2.8 M Ammonium Sulfate, 20 mM Zinc Sulfate, pH 4.9, Vapor diffusion, hanging drop., temperature 293K
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.194 |
| 3KNS Bacillus cereus metallo-beta-lactamase Cys221Asp mutant, 20 mM Zn(II) 提交 2009-11-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
31–257（227 aa）
|
突变：C168D | ZN ZINC ION × 2 ACY ACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；0.1 M Sodium Acetate, 2.8 M Ammonium Sulfate, 20 mM Zinc Sulfate, pH 4.9, Vapor diffusion, hanging drop., temperature 293K
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.194 |
| 3KNS Bacillus cereus metallo-beta-lactamase Cys221Asp mutant, 20 mM Zn(II) 提交 2009-11-12 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
31–257（227 aa）
|
突变：C168D | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACY ACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；0.1 M Sodium Acetate, 2.8 M Ammonium Sulfate, 20 mM Zinc Sulfate, pH 4.9, Vapor diffusion, hanging drop., temperature 293K
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.194 |
| 4C09 Crystal structure of the metallo-beta-lactamase BCII 提交 2013-07-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
片段：RESIDUES 31-257
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS TRIS, 25 % W/V PEG 3350 PH 5.5, 1 MM TCEP.
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.139 |
| 4C1C Crystal structure of the metallo-beta-lactamase BCII with D-captopril 提交 2013-08-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
片段：RESIDUES 31-257
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 MCO 1-(3-MERCAPTO-2-METHYL-PROPIONYL)-PYRROLIDINE-2-CARBOXYLIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS TRIS, 25 % W/V PEG 3350, PH 5.5, 1 MM TCEP.
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.136 |
| 4C1H Crystal structure of the metallo-beta-lactamase BCII with L-captopril 提交 2013-08-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
片段：RESIDUES 31-257
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X8Z L-CAPTOPRIL × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS TRIS, 25 % W/V PEG 3350, PH 5.5, 1 MM TCEP.
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.139 |
| 4NQ4 Bacillus cereus Zn-dependent metallo-beta-lactamase at pH 7 提交 2013-11-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–257（222 aa）
片段：UNP residues 36-257
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG3350, 180mM K2SO4, protein at 15mg/ml in 10mM Tris-HCl pH7, 50mM NaCl, 1mM DTT, 1mM Zn2SO4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.300 |
| 4NQ5 Bacillus cereus Zn-dependent metallo-beta-lactamase at pH 7 complexed with compound CS319 提交 2013-11-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–257（222 aa）
片段：UNP residues 36-257
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 3C7 (3R,5R,7aS)-5-(sulfanylmethyl)tetrahydro[1,3]thiazolo[4,3-b][1,3]thiazole-3-carboxylic acid × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG3350, 180mM K2SO4, protein at 15mg/ml in 10mM Tris-HCl pH7, 50mM NaCl, 1mM DTT, 1mM Zn2SO4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.254 |
| 4NQ6 Bacillus cereus Zn-dependent metallo-beta-lactamase at pH 7 complexed with compound L-CS319 提交 2013-11-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–257（222 aa）
片段：UNP residues 36-257
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 3R9 (3S,5S,7aR)-5-(sulfanylmethyl)tetrahydro[1,3]thiazolo[4,3-b][1,3]thiazole-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG3350, 180mM K2SO4, protein at 15mg/ml in 10mM Tris-HCl pH7, 50mM NaCl, 1mM DTT, 1mM Zn2SO4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.244 |
| 4TYT Crystal Structure of BcII metallo-beta-lactamase in complex with ML302F 提交 2014-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
片段：UNP residues 31-257
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 S3C (2Z)-2-sulfanyl-3-(2,3,6-trichlorophenyl)prop-2-enoic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.2 M A.S., 0.1M BIS-TRIS, 25% PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.201 |
| 5FQA Crystal Structure of Bacillus cereus Metallo-Beta-Lactamase II 提交 2015-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
片段：UNP RESIDUES 31-257
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FE FE (III) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 OH HYDROXIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS TRIS, 25 % W/V PEG 3350 PH 5.5, 1 MM TCEP
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.140 |
| 5FQB Crystal Structure of Bacillus cereus Metallo-Beta-Lactamase with 2C 提交 2015-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
片段：UNP RESIDUES 31-257
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 OK3 (4~{R})-4-[[4-(aminomethyl)phenyl]carbonylamino]-3,3-bis(oxidanyl)-2-oxa-3-boranuidabicyclo[4.4.0]deca-1(10),6,8-triene-10-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS TRIS, 25 % W/V PEG 3350 PH 5.5, 1 MM TCEP.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.181 |
| 5JMX Crystal Structure of BcII metallo-beta-lactamase in complex with DZ-305 提交 2016-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 DZ5 (2Z)-3-(4-fluorophenyl)-2-sulfanylprop-2-enoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1MM TCEP, 5MM DZ-305, 50MM HEPES PH7.5, 100MM NACL, 0.1MM ZNCL2, 0.1M MAGNESIUM FORMATE, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.186 |
| 5W8W Bacillus cereus Zn-dependent metallo-beta-lactamase at pH 7 - new refinement 提交 2017-06-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–257（222 aa）
片段：residues 36-257
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG3350, 180mM K2SO4, protein at 15mg/ml in 10mM Tris-HCl pH7, 50mM NaCl, 1mM DTT, 1mM Zn2SO4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.219 |
| 6EUM CRYSTAL STRUCTURE OF BCII METALLO-BETA-LACTAMASE IN COMPLEX WITH DZ-307 提交 2017-10-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 BY5 (~{Z})-2-sulfanyl-3-[2,3,6-tris(fluoranyl)phenyl]prop-2-enoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1MM TCEP, 5MM DZ-307, 50MM HEPES pH7.5, 100MM NACL, 0.1MM ZNCL2, 0.1M MAGNESIUM FORMATE, 25% PEG 3350
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.151 |
| 6EWE Crystal structure of BCII Metallo-beta-lactamase in complex with DZ-308 提交 2017-11-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 C0W (~{Z})-3-(1-benzothiophen-3-yl)-2-sulfanyl-prop-2-enoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1MM TCEP, 5MM DZ-305, 50MM HEPES PH7.5, 100MM NACL, 0.1MM ZNCL2, 0.1M MAGNESIUM FORMATE, 25% PEG 3350
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.167 |
| 6F2N Crystal structure of BCII Metallo-beta-lactamase in complex with KDU197 提交 2017-11-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–257（227 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 CF8 (~{Z})-3-[2-(naphthalen-2-ylmethyl)phenyl]-2-sulfanyl-prop-2-enoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M A.S., 0.1M BIS-TRIS, 25% PEG 3350, 10mM inhibitor
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.151 |